CIRBP - CIRBP

CIRBP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1X5S
Identifikátory
Aliasy	CIRBP, CIRP, za studena indukovatelný protein vázající RNA
Externí ID	OMIM: 602649 MGI: 893588 HomoloGene: 980 Genové karty: CIRBP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	1,274,880 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	80,172,786 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita represoru překladu; • vazba nukleové kyseliny; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba rRNA na malou ribozomální podjednotku; • mRNA 3'-UTR vazba; • Vazba RNA; • poly (U) RNA vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Stresová granule; • jádro; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • spliceosomální komplex; • ribonukleoprotein;
Biologický proces	• sestava stresových granulí; • reakce na chlad; • stabilizace mRNA; • reakce na UV; • pozitivní regulace překladu; • negativní regulace překladu; • pozitivní regulace sestřihu mRNA prostřednictvím spliceosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1153
	12696
	ENSG00000099622
	ENSMUSG00000045193
	Q14011; Q53XX5
	P60824
	NM_001280; NM_001300815; NM_001300829
	NM_007705
	NP_001271; NP_001287744; NP_001287758; NP_001271.1
NP_031731; NP_001366350; NP_001366351; NP_001366352; NP_001366353;
	NP_001366354
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Za studena indukovatelný protein vázající RNA je protein že u lidí je kódován CIRBP gen.^[5]^[6]^[7] Chlad indukovatelný Protein vázající RNA CIRBP hraje rozhodující roli v řízení buněčné odezvy při konfrontaci s různými buněčnými stresy, včetně krátké vlnové délky ultrafialový světlo, hypoxie, a podchlazení.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099622 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045193 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nishiyama H, Higashitsuji H, Yokoi H, Itoh K, Danno S, Matsuda T, Fujita J (únor 1998). „Klonování a charakterizace cDNA lidského CIRP (za studena indukovatelného proteinu vázajícího RNA) a chromozomální přiřazení genu“. Gen. 204 (1–2): 115–20. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00530-1. PMID 9434172.
^ Nishiyama H, Itoh K, Kaneko Y, Kishishita M, Yoshida O, Fujita J (červen 1997). „Glycin bohatý na RNA vázající protein zprostředkující za studena indukovatelnou potlačení růstu savčích buněk“. J Cell Biol. 137 (4): 899–908. doi:10.1083 / jcb.137.4.899. PMC 2139845. PMID 9151692.
^ "Entrez Gene: CIRBP studený indukovatelný protein vázající RNA".

externí odkazy

Člověk CIRBP umístění genomu a CIRBP stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Sheikh MS, Carrier F, Papathanasiou MA a kol. (1997). „Identifikace několika lidských homologů transkriptů indukovatelných poškozením křečka DNA. Klonování a charakterizace nové UV-indukovatelné cDNA, která kóduje domnělý protein vázající RNA“. J. Biol. Chem. 272 (42): 26720–6. doi:10.1074 / jbc.272.42.26720. PMID 9334257.
Nishiyama H, Danno S, Kaneko Y a kol. (1998). „Snížená exprese za studena indukovatelného proteinu vázajícího RNA (CIRP) v mužských zárodečných buňkách při zvýšené teplotě“. Dopoledne. J. Pathol. 152 (1): 289–96. PMC 1858111. PMID 9422546.
Lee J, Bedford MT (2002). „PABP1 identifikován jako substrát arginin methyltransferázy pomocí proteinových polí s vysokou hustotou“. EMBO Rep. 3 (3): 268–73. doi:10.1093 / embo-reports / kvf052. PMC 1084016. PMID 11850402.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hamid AA, Mandai M, Fujita J a kol. (2004). "Exprese za studena indukovatelného proteinu vázajícího RNA v normálním endometriu, hyperplazii endometria a karcinomu endometria". Int. J. Gynecol. Pathol. 22 (3): 240–7. doi:10.1097 / 01.PGP.0000070851.25718.EC. PMID 12819390. S2CID 22639276.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Grimwood J, Gordon LA, Olsen A a kol. (2004). „Sekvence DNA a biologie lidského chromozomu 19“. Příroda. 428 (6982): 529–35. doi:10.1038 / nature02399. PMID 15057824.
Wellmann S, Bührer C, Moderegger E a kol. (2004). „Kyslíkem regulovaná exprese proteinů RBM3 a CIRP vázajících RNA mechanismem nezávislým na HIF-1“. J. Cell Sci. 117 (Pt 9): 1785–94. doi:10.1242 / jcs.01026. PMID 15075239.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000099622 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000045193 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9434172-5] Nishiyama H, Higashitsuji H, Yokoi H, Itoh K, Danno S, Matsuda T, Fujita J (únor 1998). „Klonování a charakterizace cDNA lidského CIRP (za studena indukovatelného proteinu vázajícího RNA) a chromozomální přiřazení genu“. Gen. 204 (1–2): 115–20. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00530-1. PMID 9434172.

[pmid9151692-6] Nishiyama H, Itoh K, Kaneko Y, Kishishita M, Yoshida O, Fujita J (červen 1997). „Glycin bohatý na RNA vázající protein zprostředkující za studena indukovatelnou potlačení růstu savčích buněk“. J Cell Biol. 137 (4): 899–908. doi:10.1083 / jcb.137.4.899. PMC 2139845. PMID 9151692.

[entrez-7] "Entrez Gene: CIRBP studený indukovatelný protein vázající RNA".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]