CIDEA - CIDEA

CIDEA
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EEL
Identifikátory
Aliasy	CIDEA, CIDE-A, efektor podobný DFFA indukující buněčnou smrt, efektor podobný DFFA indukující buněčnou smrt
Externí ID	OMIM: 604440 MGI: 1270845 HomoloGene: 77852 Genové karty: CIDEA
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 18 (lidský)
Konec	12,277,595 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 18 (myš)
Konec	67,367,785 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • lipidová kapička; • intracelulární; • mitochondrie; • mitochondriální obálka; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • negativní regulace prováděcí fáze apoptózy; • regulace transkripce, DNA-šablony; • metabolismus lipidů; • skladování lipidů; • buněčná smrt; • negativní regulace signální dráhy receptoru beta transformujícího růstového faktoru; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace sekvestrace triglyceridů; • negativní regulace sekrece cytokinů; • reakce na stilbenoid; • negativní regulace produkce faktoru nekrózy nádorů; • homeostáza teploty; • negativní regulace lipidového katabolického procesu; • regulace apoptotické fragmentace DNA; • apoptotický proces; • organizace lipidových částic; • negativní regulace termogeneze vyvolané chladem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1149
	12683
	ENSG00000176194
	ENSMUSG00000024526
	O60543
	O70302
	NM_001279; NM_001318383
	NM_007702
	NP_001270; NP_001305312
	NP_031728
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aktivátor buněčné smrti CIDE-A je protein že u lidí je kódován CIDEA gen.^[5]^[6]^[7] Cidea je nezbytná transkripce koaktivátor regulační prsní žláza sekrece mléčných lipidů.^[8]

Tento gen kóduje homolog myšího proteinu Cidea, u kterého bylo prokázáno, že se aktivuje apoptóza. Tato aktivace apoptózy je inhibována faktorem fragmentace DNA DFF45, ale nikoliv kaspáza inhibitory. Myši, kterým chybí funkční Cidea, mají vyšší metabolické rychlosti, vyšší lipolýza v hnědá tuková tkáň a vyšší teploty těla jádra, když jsou vystaveny chladu. Tyto myši jsou také rezistentní vůči dietě obezita a cukrovka. To naznačuje, že u myší hraje tento genový produkt roli termogeneze a lipolýza. Dva alternativní přepisy kódující různé izoformy byl identifikován.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176194 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024526 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Inohara N, Koseki T, Chen S, Wu X, Nunez G (červen 1998). „CIDE, nová rodina aktivátorů buněčné smrti s homologií k 45 kDa podjednotce faktoru fragmentace DNA“ (PDF). EMBO J.. 17 (9): 2526–33. doi:10.1093 / emboj / 17.9.2526. PMC 1170594. PMID 9564035.
^ Puri V, Ranjit S, Konda S, Nicoloro SM, Straubhaar J, Chawla A, Chouinard M, Lin C, Burkart A, Corvera S, Perugini RA, český poslanec (červen 2008). „Cidea je spojena s lipidovými kapičkami a citlivostí na inzulín u lidí“. Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (22): 7833–8. doi:10.1073 / pnas.0802063105. PMC 2409392. PMID 18509062.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CIDEA buněčná smrt indukující efektor podobný DFFA a“.
^ Cidea je základní transkripční koaktivátor regulující sekreci mléčných lipidů v mléčné žláze

externí odkazy

Člověk CIDEA umístění genomu a CIDEA stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Zhang L, Miyaki K, Nakayama T, Muramatsu M (2008). „Polymorfismus genu V115F (G -> T) indukující fragmentaci DNA faktoru fragmentace DNA faktoru alfa (CIDEA) je u japonských mužů spojen s fenotypy metabolického syndromu“. Metab. Clin. Exp. 57 (4): 502–5. doi:10.1016 / j.metabol.2007.11.011. PMID 18328351.
Li D, Da L, Tang H a kol. (2008). „Methylace CpG hraje zásadní roli při určování tkáňově a buněčně specifické exprese lidského buněčné smrti indukujícího genu efektoru A podobného DFF45 prostřednictvím regulace vazby Sp1 / Sp3“. Nucleic Acids Res. 36 (1): 330–41. doi:10.1093 / nar / gkm 1028. PMC 2248752. PMID 18033804.
Gummesson A, Jernås M, Svensson PA a kol. (2008). „Vztahy genové exprese CIDEA v tukové tkáni k bazálnímu metabolismu, energetickému omezení a obezitě: populační a dietní intervenční studie“. J. Clin. Endokrinol. Metab. 92 (12): 4759–65. doi:10.1210 / jc.2007-1136. PMID 17895319.
Iwahana H, Yakymovych I, Dubrovska A a kol. (2007). „Glykoproteomové profilování signalizace transformujícího růstového faktoru beta (TGFbeta): nonglykosylovaný buněčný smrt indukující DFF podobný efektor A inhibuje apoptózu závislou na TGFbeta1“. Proteomika. 6 (23): 6168–80. doi:10.1002 / pmic.200600384. PMID 17080483.
Dahlman I, Kaaman M, Jiao H a kol. (2005). „Polymorfismus genu C11EA V115F je u švédských subjektů spojen s obezitou“. Cukrovka. 54 (10): 3032–4. doi:10 2337 / cukrovka. 54.10.3032. PMID 16186410.
Nordström EA, Rydén M, Backlund EC a kol. (2005). „Specifická lidská role efektoru A (CIDEA) indukujícího buněčnou smrt DFFA (DNA fragmentation factor-alfa) v lipolýze a obezitě adipocytů“. Cukrovka. 54 (6): 1726–34. doi:10 2337 / cukrovka. 54.6.1726. PMID 15919794.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Zhou Z, Yon Toh S, Chen Z a kol. (2003). „Myši s deficitem cidea mají chudý fenotyp a jsou rezistentní na obezitu.“ Nat. Genet. 35 (1): 49–56. doi:10.1038 / ng1225. PMID 12910269. S2CID 12428229.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Chen Z, Guo K, Toh SY a kol. (2000). „Pro indukci apoptózy je pro CIDE-B nutná lokalizace a dimerizace mitochondrií.“. J. Biol. Chem. 275 (30): 22619–22. doi:10,1074 / jbc.C000207200. PMID 10837461.

Tento článek o gen na lidský chromozom 18 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176194 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024526 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9564035-5] Inohara N, Koseki T, Chen S, Wu X, Nunez G (červen 1998). „CIDE, nová rodina aktivátorů buněčné smrti s homologií k 45 kDa podjednotce faktoru fragmentace DNA“ (PDF). EMBO J.. 17 (9): 2526–33. doi:10.1093 / emboj / 17.9.2526. PMC 1170594. PMID 9564035.

[pmid18509062-6] Puri V, Ranjit S, Konda S, Nicoloro SM, Straubhaar J, Chawla A, Chouinard M, Lin C, Burkart A, Corvera S, Perugini RA, český poslanec (červen 2008). „Cidea je spojena s lipidovými kapičkami a citlivostí na inzulín u lidí“. Proc Natl Acad Sci U S A. 105 (22): 7833–8. doi:10.1073 / pnas.0802063105. PMC 2409392. PMID 18509062.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CIDEA buněčná smrt indukující efektor podobný DFFA a“.

[8] Cidea je základní transkripční koaktivátor regulující sekreci mléčných lipidů v mléčné žláze

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]