CHMP6 - CHMP6

CHMP6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2K3W, 3HTU
Identifikátory
Aliasy	CHMP6, VPS20, nabitý multivesikulární tělesný protein 6
Externí ID	OMIM: 610901 MGI: 3583942 HomoloGene: 11607 Genové karty: CHMP6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 17 (lidský)
Konec	81,009,517 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	119,919,548 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba N-konce proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu;
Buněčná složka	• Komplex ESCRT III; • cytosol; • endozom; • membrána; • membrána pozdního endozomu; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • endomembránový systém;
Biologický proces	• GO: 0019067 virový životní cyklus; • organizace jádra; • regulace exosomální sekrece; • multivesikulární sestava těla; • Kompletní montáž ESCRT III; • endozomální transport; • transport bílkovin; • buněčná separace po cytokinéze; • kongres mitotické metafázové desky; • vakuolární transport; • makroautofagie; • negativní regulace aktivity receptoru aktivovaného epidermálním růstovým faktorem; • doprava; • regulace proteinového katabolického procesu; • abscesy v těle;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79643
	208092
	ENSG00000176108
	ENSMUSG00000025371
	Q96FZ7
	P0C0A3
	NM_024591
	NM_001085498
	NP_078867
	NP_001078967
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nabitý multivesikulární tělesný protein 6 je protein že u lidí je kódován CHMP6 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176108 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025371 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (září 2001). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.
^ Yorikawa C, Shibata H, Waguri S, Hatta K, Horii M, Katoh K, Kobayashi T, Uchiyama Y, Maki M (březen 2005). „Lidský CHMP6, myristoylovaný protein ESCRT-III, interaguje přímo s komponentou ESCRT-II EAP20 a reguluje třídění endozomálního nákladu“. Biochem J.. 387 (Pt 1): 17–26. doi:10.1042 / BJ20041227. PMC 1134928. PMID 15511219.
^ "Entrez Gene: CHMP6 chromatin modifikující protein 6".

externí odkazy

Člověk CHMP6 umístění genomu a CHMP6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Strack B, Calistri A, Craig S a kol. (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B a kol. (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D a kol. (2003). „Divergentní retrovirové domény s pozdním pučením získávají faktory třídění vakuolárních proteinů pomocí alternativních adaptačních proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (21): 12414–9. doi:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
Peck JW, Bowden ET, Burbelo PD (2004). "Struktura a funkce lidských proteinů Vps20 a Snf7". Biochem. J. 377 (Pt 3): 693–700. doi:10.1042 / BJ20031347. PMC 1223912. PMID 14583093.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Tsang HT, Connell JW, Brown SE a kol. (2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 17 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000176108 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025371 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11559748-5] Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (září 2001). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.

[pmid15511219-6] Yorikawa C, Shibata H, Waguri S, Hatta K, Horii M, Katoh K, Kobayashi T, Uchiyama Y, Maki M (březen 2005). „Lidský CHMP6, myristoylovaný protein ESCRT-III, interaguje přímo s komponentou ESCRT-II EAP20 a reguluje třídění endozomálního nákladu“. Biochem J.. 387 (Pt 1): 17–26. doi:10.1042 / BJ20041227. PMC 1134928. PMID 15511219.

[entrez-7] "Entrez Gene: CHMP6 chromatin modifikující protein 6".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]