CHMP5 - CHMP5

CHMP5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LXM, 3ULY, 3UM0, 3UM1, 3UM2, 4TXR
Identifikátory
Aliasy	CHMP5, C9orf83, HSPC177, PNAS-2, SNF7DC2, Vps60, CGI-34, nabitý multivesikulární tělesný protein 5
Externí ID	OMIM: 610900 MGI: 1924209 HomoloGene: 5757 Genové karty: CHMP5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	33,282,070 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	40,965,303 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • endozom; • membrána; • endosomová membrána; • extracelulární exosom; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace duplikace centrozomu; • GO: 0019067 virový životní cyklus; • organizace jádra; • multivezikulární dráha třídění těla; • transport endosomu k lysozomu; • multivesikulární sestava těla; • regulace sestavy mitotického vřetena; • endozomální transport; • transport bílkovin; • buněčná separace po cytokinéze; • kongres mitotické metafázové desky; • regulace recyklace receptorů; • organizace lysozomů; • vakuolární transport; • Složitá demontáž ESCRT III; • doprava; • abscesy v těle; • buněčná odpověď na lipopolysacharid; • buněčná odpověď na muramyldipeptid;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51510
	76959
	ENSG00000086065
	ENSMUSG00000028419
	Q9NZZ3
	Q9D7S9
	NM_016410; NM_001195536
	NM_029814
	NP_001182465; NP_057494
	NP_084090
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nabitý multivesikulární tělesný protein 5 je protein že u lidí je kódován CHMP5 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

CHMP5 patří do skupiny chromatin rodina modifikovaných proteinů / nabitých multivezikulárních tělesných proteinů (CHMP). Tyto proteiny jsou složkami ESCRT-III (komplex endosomálního třídění potřebný pro transport III), komplex podílející se na degradaci povrchových receptorových proteinů a tvorbě endocytických multivezikulárních tělísek (MVB ). Některé CHMP mají jak jadernou, tak cytoplazmatickou / vezikulární distribuci a jeden takový CHMP, CHMP1A, je vyžadován jak pro tvorbu MVB, tak pro regulaci buněčný cyklus postup.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086065 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028419 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ward DM, Vaughn MB, Shiflett SL, White PL, Pollock AL, Hill J, Schnegelberger R, Sundquist WI, Kaplan J (březen 2005). „Role LIP5 a CHMP5 při tvorbě multivesikulárního těla a pučení HIV-1 v buňkách savců“. J Biol Chem. 280 (11): 10548–55. doi:10,1074 / jbc.M413734200. PMID 15644320.
^ Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (září 2001). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CHMP5 chromatin modifying protein 5“.
^ Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (září 2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

externí odkazy

Člověk CHMP5 umístění genomu a CHMP5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámečky pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v buňkách hematopoetických kmenových / progenitorových buněk CD34 +“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Strack B, Calistri A, Craig S a kol. (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B a kol. (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D a kol. (2003). „Divergentní retrovirové domény s pozdním pučením získávají faktory třídění vakuolárních proteinů pomocí alternativních adaptačních proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (21): 12414–9. doi:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR a kol. (2004). "DNA sekvence a analýza lidského chromozomu 9". Příroda. 429 (6990): 369–74. doi:10.1038 / nature02465. PMC 2734081. PMID 15164053.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 9 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000086065 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028419 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15644320-5] Ward DM, Vaughn MB, Shiflett SL, White PL, Pollock AL, Hill J, Schnegelberger R, Sundquist WI, Kaplan J (březen 2005). „Role LIP5 a CHMP5 při tvorbě multivesikulárního těla a pučení HIV-1 v buňkách savců“. J Biol Chem. 280 (11): 10548–55. doi:10,1074 / jbc.M413734200. PMID 15644320.

[pmid11559748-6] Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (září 2001). "CHMP1 funguje jako člen nově definované rodiny proteinů přenášejících vezikuly". J Cell Sci. 114 (Pt 13): 2395–404. PMID 11559748.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CHMP5 chromatin modifying protein 5“.

[pmid16730941-8] Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (září 2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]