CHMP4B - CHMP4B

CHMP4B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3C3Q, 3UM3, 4ABM
Identifikátory
Aliasy	CHMP4B, C20orf178, CHMP4A, CTPP3, CTRCT31, SNF7, SNF7-2, Shax1, VPS32B, Vps32-2, dJ553F4.4, nabitý multivesikulární tělesný protein 4B
Externí ID	OMIM: 610897 MGI: 1922858 HomoloGene: 57102 Genové karty: CHMP4B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	33,854,366 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	154,694,785 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex ESCRT III; • cytosol; • endozom; • membrána; • membrána pozdního endozomu; • cytoplazmatická strana plazmatické membrány; • membránový plášť; • extracelulární exosom; • váček; • střední část těla; • jaderný obal; • buněčné jádro;
Biologický proces	• negativní regulace sestavy autofagozomu; • regulace duplikace centrozomu; • GO: 0019067 virový životní cyklus; • organizace jádra; • udržování průhlednosti čočky; • multivesikulární sestava těla; • negativní regulace buněčné smrti; • regulace sestavy mitotického vřetena; • autofagie; • endozomální transport; • posttranslační cílení proteinu na membránu endoplazmatického retikula; • na ubikvitinu nezávislý proteinový katabolický proces multivesikulární cestou třídění těla; • transport bílkovin; • buněčná separace po cytokinéze; • kongres mitotické metafázové desky; • homooligomerizace bílkovin; • vakuolární transport; • negativní regulace neuronové smrti; • opětovné sestavení jaderné obálky; • výstup z mitózy; • mitotická cytokineze; • regulace autofagie; • štěpení membrány; • makroautofagie; • doprava; • virové pučení prostřednictvím hostitelského komplexu ESCRT; • abscesy v těle;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	128866
	75608
	ENSG00000101421
	ENSMUSG00000038467
	Q9H444
	Q9D8B3
	NM_176812
	NM_029362
	NP_789782
	NP_083638
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Nabitý multivesikulární tělesný protein 4b je protein že u lidí je kódován CHMP4B gen.^[5]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101421 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038467 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Katoh K, Shibata H, Hatta K, Maki M (prosinec 2003). „CHMP4b je hlavním vazebným partnerem proteinu Alix interagujícího s ALG-2 mezi třemi izoformami CHMP4.“ Arch Biochem Biophys. 421 (1): 159–65. doi:10.1016 / j.abb.2003.09.038. PMID 14678797.
^ „Entrez Gene: CHMP4B chromatin modifying protein 4B“.

externí odkazy

Člověk CHMP4A umístění genomu a CHMP4A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CHMP4B umístění genomu a CHMP4B stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Katoh K, Shibata H, Suzuki H a kol. (2003). „ALG-2 interagující protein Alix se asociuje s CHMP4b, lidským homologem kvasinek Snf7, který se podílí na multivesikulárním třídění těla“. J. Biol. Chem. 278 (40): 39104–13. doi:10,1074 / jbc.M301604200. PMID 12860994.
Strack B, Calistri A, Craig S a kol. (2003). „AIP1 / ALIX je vazebným partnerem pro HIV-1 p6 a EIAV p9 fungující při nadějném viru“. Buňka. 114 (6): 689–99. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00653-6. PMID 14505569. S2CID 10733770.
von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B a kol. (2003). "Proteinová síť HIV nadějná". Buňka. 114 (6): 701–13. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID 14505570. S2CID 16894972.
Martin-Serrano J, Yarovoy A, Perez-Caballero D a kol. (2003). „Divergentní retrovirové domény s pozdním pučením získávají faktory třídění vakuolárních proteinů pomocí alternativních adaptačních proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (21): 12414–9. doi:10.1073 / pnas.2133846100. PMC 218772. PMID 14519844.
Peck JW, Bowden ET, Burbelo PD (2004). "Struktura a funkce lidských proteinů Vps20 a Snf7". Biochem. J. 377 (Pt 3): 693–700. doi:10.1042 / BJ20031347. PMC 1223912. PMID 14583093.
Sharma M, Pampinella F, Nemes C a kol. (2004). „Špatné skládání odkloní CFTR od recyklace k degradaci: kontrola kvality na počátku endosomů“. J. Cell Biol. 164 (6): 923–33. doi:10.1083 / jcb.200312018. PMC 2172283. PMID 15007060.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yorikawa C, Shibata H, Waguri S a kol. (2005). „Lidský CHMP6, myristoylovaný protein ESCRT-III, interaguje přímo s komponentou ESCRT-II EAP20 a reguluje třídění endozomálního nákladu“. Biochem. J. 387 (Pt 1): 17–26. doi:10.1042 / BJ20041227. PMC 1134928. PMID 15511219.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Tsang HT, Connell JW, Brown SE a kol. (2006). „Systematická analýza interakcí humánního proteinu CHMP: další proteiny obsahující doménu MIT se vážou na více složek lidského komplexu ESCRT III.“ Genomika. 88 (3): 333–46. doi:10.1016 / j.ygeno.2006.04.003. PMID 16730941.
Usami Y, Popov S, Göttlinger HG (2007). „Silná záchrana mutantů pozdní domény viru lidské imunodeficience typu 1 pomocí ALIX / AIP1 závisí na jeho vazebném místě CHMP4“. J. Virol. 81 (12): 6614–22. doi:10.1128 / JVI.00314-07. PMC 1900090. PMID 17428861.
Shiels A, Bennett TM, Knopf HL a kol. (2007). „CHMP4B, nový gen pro autozomálně dominantní katarakty spojené s chromozomem 20q“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 81 (3): 596–606. doi:10.1086/519980. PMC 1950844. PMID 17701905.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000101421 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038467 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid14678797-5] Katoh K, Shibata H, Hatta K, Maki M (prosinec 2003). „CHMP4b je hlavním vazebným partnerem proteinu Alix interagujícího s ALG-2 mezi třemi izoformami CHMP4.“ Arch Biochem Biophys. 421 (1): 159–65. doi:10.1016 / j.abb.2003.09.038. PMID 14678797.

[entrez-6] „Entrez Gene: CHMP4B chromatin modifying protein 4B“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]