CHD5 - CHD5

CHD5
Identifikátory
Aliasy	CHD5CHD-5, protein vázající DNA helikázy z chromodomény 5
Externí ID	OMIM: 610771 MGI: 3036258 HomoloGene: 56712 Genové karty: CHD5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	6,180,321 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 4 (myš)
Konec	152,390,194 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • vazba kovových iontů; • H3K27me3 modifikovaná vazba histonu; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba;
Buněčná složka	• Komplex NuRD; • membrána; • heterochromatin; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytosol; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• diferenciace buněk; • regulace transkripce, DNA-šablony; • spermatogeneze, výměna chromozomálních proteinů; • trimethylace histonu H3-K27; • pozitivní regulace přenosu signálu mediátorem třídy p53; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj nervového systému; • regulace transkripce podílející se na závazku osudu buněk; • spermatogeneze; • acetylace histonu H4; • diferenciace neuronů mozkové kůry; • negativní regulace buněčné proliferace; • kovalentní modifikace chromatinu; • organizace chromatinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26038
	269610
	ENSG00000116254
	ENSMUSG00000005045
	Q8TDI0
	A2A8L1
	NM_015557
	NM_001081376; NM_029216; NM_001369243
	NP_056372
	NP_001074845; NP_083492; NP_001356172
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chromodomain-helikáza-DNA vázající protein 5 je enzym že v lidé je kódován CHD5 gen.^[5]^[6]^[7] Je součástí Podrodina CHD komplexů remodelace chromatinu závislých na ATP.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116254 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005045 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Schuster EF, Stoger R (březen 2002). "CHD5 definuje novou podrodinu helikáz podobných chromodomain-SWI2 / SNF2". Mamm genom. 13 (2): 117–9. doi:10.1007 / s00335-001-3042-6. PMID 11889561.
^ Thompson PM, Gotoh T, Kok M, White PS, Brodeur GM (únor 2003). „CHD5, nový člen rodiny genů chromodomén, je přednostně exprimován v nervovém systému“. Onkogen. 22 (7): 1002–11. doi:10.1038 / sj.onc.1206211. PMID 12592387.
^ "Entrez Gene: CHD5 chromodoména helikáza DNA vázající protein 5".

externí odkazy

Člověk CHD5 umístění genomu a CHD5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Nakajima D, Okazaki N, Yamakawa H a kol. (2003). „Konstrukce klonů cDNA připravených na expresi pro geny KIAA: ruční kurace 330 klonů cIANA KIAA“. DNA Res. 9 (3): 99–106. doi:10.1093 / dnares / 9.3.99. PMID 12168954.
Seki N, Ohira M, Nagase T a kol. (1998). "Charakterizace cDNA klonů v knihovnách cDNA s frakcionací podle velikosti z lidského mozku". DNA Res. 4 (5): 345–9. doi:10.1093 / dnares / 4.5.345. PMID 9455484.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Gregory SG, Barlow KF, McLay KE a kol. (2006). „Sekvence DNA a biologická anotace lidského chromozomu 1“. Příroda. 441 (7091): 315–21. doi:10.1038 / nature04727. PMID 16710414.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Bagchi A, Papazoglu C, Wu Y a kol. (2007). „CHD5 je supresor nádoru u lidské 1p36“. Buňka. 128 (3): 459–75. doi:10.1016 / j.cell.2006.11.052. PMID 17289567.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000116254 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000005045 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11889561-5] Schuster EF, Stoger R (březen 2002). "CHD5 definuje novou podrodinu helikáz podobných chromodomain-SWI2 / SNF2". Mamm genom. 13 (2): 117–9. doi:10.1007 / s00335-001-3042-6. PMID 11889561.

[pmid12592387-6] Thompson PM, Gotoh T, Kok M, White PS, Brodeur GM (únor 2003). „CHD5, nový člen rodiny genů chromodomén, je přednostně exprimován v nervovém systému“. Onkogen. 22 (7): 1002–11. doi:10.1038 / sj.onc.1206211. PMID 12592387.

[entrez-7] "Entrez Gene: CHD5 chromodoména helikáza DNA vázající protein 5".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]