N-koncová doména CDC48 - CDC48 N-terminal domain

CDC48_2
	aminoterminální doména fúzního proteinu citlivého na n-ethylmaleimid (NSF)
Identifikátory
Symbol	CDC48_2
Pfam	PF02933
Pfam klan	CL0402
InterPro	IPR004201
SCOP2	1cz4 / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

CDC48_N
	krystalová struktura aaa atpázy p97 / vcp nd1 v komplexu s p47 c
Identifikátory
Symbol	CDC48_N
Pfam	PF02359
InterPro	IPR003338
SCOP2	1cz4 / Rozsah / SUPFAM
Dostupné proteinové struktury:
Pfam	struktur / ECOD
PDB	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBsum	shrnutí struktury

V molekulární biologii se N-koncová doména CDC48 je proteinová doména nalezen v AAA ATPázy včetně proteinu buněčného dělení 48 (CDC48), ATCPázy podobné VCP a fúzního proteinu citlivého na N-ethylmaleimid. Je to doména rozpoznávající substrát, která se váže polypeptidy, zabraňuje agregaci proteinů a katalýzy opětovné složení permisivních substrátů. Skládá se ze dvou stejně velkých subdomén. Aminoterminální subdoména (CDC48_N) tvoří dvojitý psi beta-barel jehož pseudo-dvojnásobek symetrie je zrcadlen interní sekvence opakovat ze 42 zbytky. Karboxyterminální subdoména (CDC48_2) tvoří nový šestivláknový beta-škeble složit.^[1] Společně tyto subdomény tvoří strukturu ve tvaru ledviny, v těsné shodě s výsledky z elektronová mikroskopie. CDC48_N souvisí s mnoha bílkoviny počítaje v to prokaryotický transkripce faktory, metabolické enzymy, proteáza kofaktory UFD1 a PrlF a aspartátové proteinázy.

Reference

^ Coles M, Diercks T, Liermann J, Groger A, Rockel B, Baumeister W, Koretke KK, Lupas A, Peters J, Kessler H (říjen 1999). „Struktura řešení VAT-N odhaluje„ chybějící článek “ve vývoji komplexních enzymů z jednoduchého prvku betaalphabetabeta.“ Curr. Biol. 9 (20): 1158–68. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80017-2. PMID 10531028. S2CID 6561497.

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR003338

Tento článek včlení text od public domain Pfam a InterPro: IPR004201

[pmid10531028-1] Coles M, Diercks T, Liermann J, Groger A, Rockel B, Baumeister W, Koretke KK, Lupas A, Peters J, Kessler H (říjen 1999). „Struktura řešení VAT-N odhaluje„ chybějící článek “ve vývoji komplexních enzymů z jednoduchého prvku betaalphabetabeta.“ Curr. Biol. 9 (20): 1158–68. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80017-2. PMID 10531028. S2CID 6561497.

[1]