CDC40 - CDC40

CDC40
Identifikátory
Aliasy	CDC40, EHB3, PRP17, PRPF17, cyklus buněčného dělení 40
Externí ID	OMIM: 605585 MGI: 1918963 HomoloGene: 5716 Genové karty: CDC40
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	110,254,275 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	40,883,311 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• katalytický krok 2 spliceosom; • spliceosomální komplex; • nukleoplazma; • buněčné jádro; • Spliceosom katalytického kroku 2 typu U2; • jaderná skvrna;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • Zpracování mRNA; • export mRNA z jádra; • Zpracování mRNA 3'-end; • Sestřih RNA; • Export RNA z jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51362
	71713
	ENSG00000168438
	ENSMUSG00000038446
	O60508
	Q9DC48
	NM_015891
	NM_027879
	NP_056975
	NP_082155
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Faktor před zpracováním mRNA 17 je protein že u lidí je kódován CDC40 gen.^[5]^[6]^[7]

Sestřih pre-mRNA se vyskytuje ve dvou po sobě jdoucích transesterifikace kroky. Bylo zjištěno, že protein kódovaný tímto genem je nezbytný pro katalytický krok II pre-mRNA spojovací proces. Nachází se v spliceosome a obsahuje sedm WD opakování, která fungují při interakcích protein-protein. Tento protein má sekvenční podobnost s kvasinkovým proteinem Prp17, který funguje ve dvou různých buněčných procesech: sestřihu pre-mRNA a postupu buněčného cyklu. To naznačuje, že tento protein může hrát roli v progresi buněčného cyklu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168438 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038446 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ben Yehuda S, Dix I, Russell CS, Levy S, Beggs JD, Kupiec M (říjen 1998). „Identifikace a funkční analýza hPRP17, lidského homologu genu kvasinek PRP17 / CDC40 zapojeného do sestřihu a kontroly buněčného cyklu“. RNA. 4 (10): 1304–12. doi:10.1017 / S1355838298980712. PMC 1369702. PMID 9769104.
^ Lindsey LA, Garcia-Blanco MA (leden 1999). "Funkční konzervace lidského homologu kvasinkového pre-mRNA sestřihového faktoru Prp17p". J Biol Chem. 273 (49): 32771–5. doi:10.1074 / jbc.273.49.32771. PMID 9830021.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CDC40 cyklus buněčného dělení 40 homolog (S. cerevisiae)".

externí odkazy

Člověk CDC40 umístění genomu a CDC40 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Wong WT, Schumacher C, Salcini AE a kol. (1995). „Doména vázající protein, EH, identifikovaná v substrátu receptoru tyrosinkinázy Eps15 a konzervovaná v evoluci“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 92 (21): 9530–4. Bibcode:1995PNAS ... 92,9530W. doi:10.1073 / pnas.92.21.9530. PMC 40835. PMID 7568168.
Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Salcini AE, Confalonieri S, Doria M a kol. (1997). „Vazebná specificita a in vivo cíle EH domény, nový modul interakce protein-protein“. Genes Dev. 11 (17): 2239–49. doi:10.1101 / gad.11.17.2239. PMC 275390. PMID 9303539.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Zhou Z, Reed R (1998). „Lidské homology kvasinek prp16 a prp17 odhalují zachování mechanismu pro katalytický krok II sestřihu pre-mRNA“. EMBO J.. 17 (7): 2095–106. doi:10.1093 / emboj / 17.7.2095. PMC 1170554. PMID 9524131.
Ben-Yehuda S, Dix I, Russell CS a kol. (2001). „Genetické a fyzikální interakce mezi faktory podílejícími se jak na progresi buněčného cyklu, tak na sestřihu pre-mRNA u Saccharomyces cerevisiae“. Genetika. 156 (4): 1503–17. PMC 1461362. PMID 11102353.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B a kol. (2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. Bibcode:2005Sci ... 307.1621B. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000168438 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038446 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9769104-5] Ben Yehuda S, Dix I, Russell CS, Levy S, Beggs JD, Kupiec M (říjen 1998). „Identifikace a funkční analýza hPRP17, lidského homologu genu kvasinek PRP17 / CDC40 zapojeného do sestřihu a kontroly buněčného cyklu“. RNA. 4 (10): 1304–12. doi:10.1017 / S1355838298980712. PMC 1369702. PMID 9769104.

[pmid9830021-6] Lindsey LA, Garcia-Blanco MA (leden 1999). "Funkční konzervace lidského homologu kvasinkového pre-mRNA sestřihového faktoru Prp17p". J Biol Chem. 273 (49): 32771–5. doi:10.1074 / jbc.273.49.32771. PMID 9830021.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: CDC40 cyklus buněčného dělení 40 homolog (S. cerevisiae)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]