CCT5 (gen) - CCT5 (gene)

CCT5
Identifikátory
Aliasy	CCT5, CCT-epsilon, CCTE, HEL-S-69, TCP-1-epsilon, PNAS-102, chaperonin obsahující podjednotku TCP1
Externí ID	OMIM: 610150 MGI: 107185 HomoloGene: 6287 Genové karty: CCT5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	10,266,389 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	31,601,804 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba beta-podjednotky G-proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba beta-tubulinu; • ATP vazba; • vazba na bílkoviny zapojená do skládání bílkovin; • rozložená vazba na bílkoviny; • mRNA 3'-UTR vazba; • mRNA 5'-UTR vazba;
Buněčná složka	• buněčné tělo; • centrosome; • myelin; • organizační centrum mikrotubulů; • komplex receptoru zona pellucida; • jádro; • T-komplex obsahující chaperonin; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• pozitivní regulace lokalizace bílkovin do Cajalova těla; • pozitivní regulace zavedení proteinové lokalizace do telomer; • reakce na virus; • stabilizace bílkovin; • pozitivní regulace udržování telomer prostřednictvím telomerázy; • transport toxinů; • skládání bílkovin; • pozitivní regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • vazba spermií na zona pellucida; • skládání bílkovin „de novo“; • skládání proteinů zprostředkované chaperonem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	22948
	12465
	ENSG00000150753
	ENSMUSG00000022234
	P48643
	P80316
	NM_001306153; NM_001306154; NM_001306155; NM_001306156; NM_012073
	NM_007637; NM_001348035
	NP_001293082; NP_001293083; NP_001293084; NP_001293085; NP_036205
	NP_001334964; NP_031663
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Epsilon podjednotky proteinu T-komplexu 1 je protein že u lidí je kódován CCT5 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje molekulární chaperon, který je členem TRiC komplex. Tento komplex se skládá ze dvou identických skládaných kruhů, z nichž každý obsahuje osm různých proteinů. Rozložené polypeptidy vstupují do centrální dutiny komplexu a jsou složeny způsobem závislým na ATP. Komplex skládá různé proteiny, včetně aktinu a tubulinu. Byly pozorovány alternativní transkripční sestřihové varianty tohoto genu, ale nebyly důkladně charakterizovány.^[5]

Interakce

Ukázalo se, že CCT5 (gen) komunikovat s PPP4C.^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150753 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022234 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b "Entrez Gene: CCT5 chaperonin obsahující TCP1, podjednotka 5 (epsilon)".
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

externí odkazy

Člověk CCT5 umístění genomu a CCT5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Roobol A, Holmes FE, Hayes NV, Baines AJ, Carden MJ (duben 1995). „Cytoplazmatické chaperoninové komplexy vstupují do neuritů vyvíjejících se in vitro a liší se složením podjednotek v jednotlivých buňkách“. Journal of Cell Science. 108 (4): 1477–88. PMID 7615668.
Nagase T, Miyajima N, Tanaka A, Sazuka T, Seki N, Sato S, Tabata S, Ishikawa K, Kawarabayasi Y, Kotani H (1995). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. III. Kódující sekvence 40 nových genů (KIAA0081-KIAA0120) odvozené analýzou klonů cDNA z lidské buněčné linie KG-1“. Výzkum DNA. 2 (1): 37–43. doi:10.1093 / dnares / 2.1.37. PMID 7788527.
Kubota H, Hynes G, Carne A, Ashworth A, Willison K (únor 1994). "Identifikace šesti genů souvisejících s Tcp-1 kódujících divergentní podjednotky chaperoninu obsahujícího TCP-1". Aktuální biologie. 4 (2): 89–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (94) 00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Liou AK, Willison KR (červenec 1997). "Objasnění orientace podjednotky v CCT (chaperonin obsahující TCP1) ze složení podjednotky v CCT mikrokomplexech". Časopis EMBO. 16 (14): 4311–6. doi:10.1093 / emboj / 16.14.4311. PMC 1170057. PMID 9250675.
Roperch JP, Lethrone F, Prieur S, Piouffre L, Israeli D, Tuynder M, Nemani M, Pasturaud P, Gendron MC, Dausset J, Oren M, Amson RB, Telerman A (červenec 1999). „SIAH-1 podporuje apoptózu a potlačení nádoru prostřednictvím sítě zahrnující regulaci skládání, rozkládání a obchodování s proteiny: identifikace běžných efektorů s p53 a p21 (Waf1)“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 96 (14): 8070–3. doi:10.1073 / pnas.96.14.8070. PMC 22189. PMID 10393949.
Yanaka N, Kobayashi K, Wakimoto K, Yamada E, Imahie H, Imai Y, Mori C (květen 2000). „Inzerční mutace myšího lokusu kisimo způsobila poruchu spermatogeneze“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (20): 14791–4. doi:10.1074 / jbc.C901047199. PMID 10747865.
Yoo BC, Kim SH, Cairns N, Fountoulakis M, Lubec G (leden 2001). "Poškozená exprese molekulárních chaperonů v mozku pacientů s Alzheimerovou chorobou". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 280 (1): 249–58. doi:10,1006 / bbrc.2000.4109. PMID 11162507.
Yoo BC, Vlkolinsky R, Engidawork E, Cairns N, Fountoulakis M, Lubec G (duben 2001). "Diferenciální exprese molekulárních chaperonů v mozku pacientů s Downovým syndromem". Elektroforéza. 22 (6): 1233–41. doi:10.1002 / 1522-2683 () 22: 6 <1233 :: AID-ELPS1233> 3.0.CO; 2-M. PMID 11358150.
Yokota S, Yanagi H, Yura T, Kubota H (září 2001). „Polypeptid 1 obsahující cytosolický chaperonin t-komplex 1 mění obsah konkrétního druhu podjednotky současně s vazbou na substrát a sbalením během buněčného cyklu.“ European Journal of Biochemistry / FEBS. 268 (17): 4664–73. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02393.x. PMID 11532003.
McCormack EA, Llorca O, Carrascosa JL, Valpuesta JM, Willison KR (srpen 2001). „Bodové mutace v závěsu spojujícím malou a velkou doménu beta-aktinu vedou k zachyceným skládacím meziproduktům navázaným na cytosolický chaperonin CCT“. Journal of Structural Biology. 135 (2): 198–204. doi:10.1006 / jsbi.2001.4385. PMID 11580269. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Llorca O, Martín-Benito J, Gómez-Puertas P, Ritco-Vonsovici M, Willison KR, Carrascosa JL, Valpuesta JM (srpen 2001). "Analýza interakce mezi eukaryotickým chaperoninem CCT a jeho substráty aktinem a tubulinem". Journal of Structural Biology. 135 (2): 205–18. doi:10.1006 / jsbi.2001.4359. PMID 11580270. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Guenther MG, Yu J, Kao GD, Yen TJ, Lazar MA (prosinec 2002). „Sestavení represivního komplexu SMRT-histon-deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1“. Geny a vývoj. 16 (24): 3130–5. doi:10.1101 / gad.1037502. PMC 187500. PMID 12502735. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Ludwig A, Dietel M, Lage H (2003). "Identifikace rozdílně exprimovaných genů v klasických a atypických multirezistentních buňkách žaludečního karcinomu". Protinádorový výzkum. 22 (6A): 3213–21. PMID 12530067.
Imai Y, Soda M, Murakami T, Shoji M, Abe K, Takahashi R (prosinec 2003). „Produkt lidského genu sousedící s parkinem je součástí Lewyho těl a potlačuje buněčnou smrt vyvolanou receptorem Pael“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (51): 51901–10. doi:10,1074 / jbc.M309655200. PMID 14532270. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Lehner B, Sanderson CM (červenec 2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Výzkum genomu. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Lukov GL, Hu T, McLaughlin JN, Hamm HE, Willardson BM (červen 2005). „Protein podobný fosducinu působí jako molekulární chaperon pro sestavení dimeru betagamma G proteinu“. Časopis EMBO. 24 (11): 1965–75. doi:10.1038 / sj.emboj.7600673. PMC 1142607. PMID 15889144.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000150753 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000022234 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b "Entrez Gene: CCT5 chaperonin obsahující TCP1, podjednotka 5 (epsilon)".

[pmid18715871-6] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-7] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“ (PDF). Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932. S2CID 7531012.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]