CCT2 (gen) - CCT2 (gene) - Wikipedia

CCT2
Identifikátory
Aliasy	CCT2, 99D8.1, CCT-beta, CCTB, HEL-S-100n, PRO1633, TCP-1-beta, chaperonin obsahující podjednotku TCP1
Externí ID	OMIM: 605139 MGI: 107186 HomoloGene: 4696 Genové karty: CCT2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	69,601,570 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	117,063,814 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • vazba na bílkoviny zapojená do skládání bílkovin; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • rozložená vazba na bílkoviny;
Buněčná složka	• buněčné tělo; • myelin; • komplex receptoru zona pellucida; • T-komplex obsahující chaperonin; • mikrotubuly; • extracelulární exosom; • extracelulární matrix; • extracelulární oblast; • cytoplazma; • cytosol; • lumen azurofilní granule;
Biologický proces	• skládání proteinů zprostředkované chaperonem nezávisle na kofaktoru; • chaperonem zprostředkovaný proteinový komplex; • pozitivní regulace lokalizace bílkovin do Cajalova těla; • pozitivní regulace zavedení proteinové lokalizace do telomer; • ScaRNA lokalizace do Cajalova těla; • stabilizace bílkovin; • pozitivní regulace udržování telomer prostřednictvím telomerázy; • transport toxinů; • skládání bílkovin; • pozitivní regulace aktivity telomerázy; • pozitivní regulace lokalizace telomerasové RNA do Cajalova těla; • vazba spermií na zona pellucida; • degranulace neutrofilů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10576
	12461
	ENSG00000166226
	ENSMUSG00000034024
	P78371
	P80314
	NM_006431; NM_001198842
	NM_007636; NM_001358767
	NP_001185771; NP_006422
	NP_031662; NP_001345696
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

T-komplex protein 1 podjednotka beta je protein že u lidí je kódován CCT2 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje molekulární chaperon, který je členem TRiC komplex. Tento komplex se skládá ze dvou identických skládaných kruhů, z nichž každý obsahuje osm různých proteinů. Rozložené polypeptidy vstupují do centrální dutiny komplexu a jsou složeny způsobem závislým na ATP. Komplex skládá různé proteiny, včetně aktinu a tubulinu. Byly pozorovány alternativní transkripční sestřihové varianty genu popsaného v tomto záznamu, ale nebyly důkladně charakterizovány.^[6]

Interakce

Ukázalo se, že CCT2 (gen) komunikovat s PPP4C.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166226 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034024 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vyhrál KA, Schumacher RJ, Farr GW, Horwich AL, Reed SI (prosinec 1998). „Zrání lidského cyklinu E vyžaduje funkci eukaryotického chaperoninu CCT“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (12): 7584–9. doi:10.1128 / mcb.18.12.7584. PMC 109339. PMID 9819444.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CCT2 chaperonin obsahující TCP1, podjednotka 2 (beta)“.
^ Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.
^ Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“. Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.

externí odkazy

Člověk CCT2 umístění genomu a CCT2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: P78371 (T-komplex protein 1 podjednotka beta) na PDBe-KB.

Další čtení

Kubota H, Hynes G, Carne A, Ashworth A, Willison K (únor 1994). "Identifikace šesti genů souvisejících s Tcp-1 kódujících divergentní podjednotky chaperoninu obsahujícího TCP-1". Aktuální biologie. 4 (2): 89–99. doi:10.1016 / S0960-9822 (94) 00024-2. PMID 7953530. S2CID 31300131.
Llorca O, Smyth MG, Carrascosa JL, Willison KR, Radermacher M, Steinbacher S, Valpuesta JM (červenec 1999). „3D rekonstrukce formy CCT vázané na ATP odhaluje asymetrickou skládací konformaci chaperoninu typu II“. Přírodní strukturní biologie. 6 (7): 639–42. doi:10.1038/10689. PMID 10404219. S2CID 11838115.
Hynes GM, Willison KR (červen 2000). „Jednotlivé podjednotky eukaryotického cytosolického chaperoninu zprostředkovávají interakce s vazebnými místy umístěnými na subdoménách beta-aktinu“. The Journal of Biological Chemistry. 275 (25): 18985–94. doi:10.1074 / jbc.M910297199. PMID 10748209.
Yokota S, Yanagi H, Yura T, Kubota H (září 2001). „Polypeptid 1 obsahující cytosolický chaperonin t-komplex 1 mění obsah konkrétního druhu podjednotky současně s vazbou na substrát a sbalením během buněčného cyklu.“ European Journal of Biochemistry / FEBS. 268 (17): 4664–73. doi:10.1046 / j.1432-1327.2001.02393.x. PMID 11532003.
McCormack EA, Llorca O, Carrascosa JL, Valpuesta JM, Willison KR (srpen 2001). „Bodové mutace v závěsu spojujícím malou a velkou doménu beta-aktinu vedou k zachyceným skládacím meziproduktům navázaným na cytosolický chaperonin CCT“. Journal of Structural Biology. 135 (2): 198–204. doi:10.1006 / jsbi.2001.4385. PMID 11580269.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Imai Y, Soda M, Murakami T, Shoji M, Abe K, Takahashi R (prosinec 2003). „Produkt lidského genu sousedící s parkinem je součástí Lewyho těl a potlačuje buněčnou smrt vyvolanou receptorem Pael“. The Journal of Biological Chemistry. 278 (51): 51901–10. doi:10,1074 / jbc.M309655200. PMID 14532270.
Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (srpen 2004) . "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Aktuální biologie. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660. S2CID 2371325.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Guo D, Han J, Adam BL, Colburn NH, Wang MH, Dong Z, Eizirik DL, She JX, Wang CY (prosinec 2005). "Proteomická analýza substrátů SUMO4 v buňkách HEK293 pod stresem vyvolaným hladovým sérovým účinkem". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 337 (4): 1308–18. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.09.191. PMID 16236267.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166226 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034024 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9819444-5] Vyhrál KA, Schumacher RJ, Farr GW, Horwich AL, Reed SI (prosinec 1998). „Zrání lidského cyklinu E vyžaduje funkci eukaryotického chaperoninu CCT“. Molekulární a buněčná biologie. 18 (12): 7584–9. doi:10.1128 / mcb.18.12.7584. PMC 109339. PMID 9819444.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: CCT2 chaperonin obsahující TCP1, podjednotka 2 (beta)“.

[pmid18715871-7] Chen GI, Tisayakorn S, Jorgensen C, D'Ambrosio LM, Goudreault M, Gingras AC (říjen 2008). „PP4R4 / KIAA1622 tvoří nový stabilní cytosolický komplex s fosfoprotein fosfatázou 4“. The Journal of Biological Chemistry. 283 (43): 29273–84. doi:10,1074 / jbc.M803443200. PMC 2662017. PMID 18715871.

[pmid16085932-8] Gingras AC, Caballero M, Zarske M, Sanchez A, Hazbun TR, Fields S, Sonenberg N, Hafen E, Raught B, Aebersold R (listopad 2005). „Nový, evolučně konzervovaný komplex protein-fosfatáza zapojený do citlivosti na cisplatinu“. Molekulární a buněčná proteomika. 4 (11): 1725–40. doi:10,1074 / mcp.M500231-MCP200. PMID 16085932.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]