CCL3L1 - CCL3L1
Chemokinový (motiv C-C) ligand podobný 3, také známý jako CCL3L1, je protein který je u lidí kódován CCL3L1 gen.[2][3][4]
Funkce
Tento gen je jedním z několika chemokin geny seskupené na q-rameni chromozomu 17. Chemokiny jsou rodinou vylučovaných proteinů imunoregulační a zánětlivé procesy. Konkrétně chemokiny přitahují lymfocyty na místa infekce nebo poškození. Tento protein se váže na několik chemokinových receptorů, včetně proteinu 2 vázajícího chemokiny (CCBP2 nebo D6) a chemokinový (motiv C-C) receptor 5 (CCR5 ).
CCR5 je koreceptor pro HIV a vazba CCL3L1 na CCR5 inhibuje vstup HIV. Kromě toho vazba způsobí, že receptor bude přijímán uvnitř buňky endocytóza, které budou nakonec znovu zpracovány a znovu vyjádřeny.[2]
Genová organizace
Lidský genom referenční sestava obsahuje dvě plné kopie genu (CCL3L1 a CCL3L3) a další částečnou duplikaci, která má za následek pseudogen, označený CCL3L2. Tento záznam představuje telomernější gen plné délky.[2]
Klinický význam
Počet kopií tohoto genu se u jednotlivců liší. Předpokládá se, že k tomu došlo segmentová duplikace regionu obsahujícího CCL3. Většina lidí má v souboru 1-6 kopií diploidní genom, i když vzácní jedinci mají nula nebo více než šest kopií. Se zvýšeným počtem kopií je více exprimováno CCL3L1, a tak se zvyšuje konkurence pro vazebné místo CCR5. To vede k pomalejšímu postupu onemocnění u jedinců infikovaných HIV, což dává osobám s vyšším počtem kopií větší odolnost.[2]
Interakce
CCL3L1 bylo prokázáno komunikovat s CCR5.[5][6]
Reference
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ A b C d „Entrez Gene: CCL3L1 chemokin (motiv C-C) ligand 3 jako 1“.
- ^ Irving SG, Zipfel PF, Balke J, McBride OW, Morton CC, Burd PR, Siebenlist U, Kelly K (červen 1990). „Dva geny zánětlivých mediátorů pro cytokiny jsou úzce spojeny a variabilně amplifikovány na chromozomu 17q“. Výzkum nukleových kyselin. 18 (11): 3261–70. doi:10.1093 / nar / 18.11.3261. PMC 330932. PMID 1972563.
- ^ Hirashima M, Ono T, Nakao M, Nishi H, Kimura A, Nomiyama H, Hamada F, Yoshida MC, Shimada K (1992). „Nukleotidová sekvence třetího genu LD78 pro cytokiny a mapování všech tří lokusů genu LD78 na lidský chromozom 17“. Sekvence DNA. 3 (4): 203–12. doi:10.3109/10425179209034019. PMID 1296815.
- ^ Miyakawa T, Obaru K, Maeda K, Harada S, Mitsuya H (únor 2002). „Identifikace aminokyselinových zbytků kritických pro LD78beta, varianta lidského makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa, vazba na CCR5 a inhibice replikace viru lidské imunodeficience typu 1 R5“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (7): 4649–55. doi:10,1074 / jbc.M109198200. PMID 11734558.
- ^ Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (červenec 2001). „Odlišné vazebné kapacity přírodních izoforem LD78beta makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa na CC chemokinové receptory 1, 3 a 5 ovlivňují jejich anti-HIV-1 aktivitu a chemotaktickou účinnost pro neutrofily a eosinofily.“ European Journal of Immunology. 31 (7): 2170–8. doi:10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: AID-IMMU2170> 3.0.CO; 2-D. PMID 11449371.
externí odkazy
- Člověk CCL3L1 umístění genomu a CCL3L1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Další čtení
- Hirashima M, Ono T, Nakao M, Nishi H, Kimura A, Nomiyama H, Hamada F, Yoshida MC, Shimada K (1993). „Nukleotidová sekvence třetího genu LD78 pro cytokiny a mapování všech tří lokusů genu LD78 na lidský chromozom 17“. Sekvence DNA. 3 (4): 203–12. doi:10.3109/10425179209034019. PMID 1296815.
- Nakao M, Nomiyama H, Shimada K (červenec 1990). "Struktury lidských genů kódujících cytokin LD78 a jejich exprese". Molekulární a buněčná biologie. 10 (7): 3646–58. doi:10.1128 / MCB.10.7.3646. PMC 360801. PMID 1694014.
- Irving SG, Zipfel PF, Balke J, McBride OW, Morton CC, Burd PR, Siebenlist U, Kelly K (červen 1990). „Dva geny zánětlivých mediátorů pro cytokiny jsou úzce spojeny a variabilně amplifikovány na chromozomu 17q“. Výzkum nukleových kyselin. 18 (11): 3261–70. doi:10.1093 / nar / 18.11.3261. PMC 330932. PMID 1972563.
- Blum S, Forsdyke RE, Forsdyke DR (březen 2009). "Tři lidské homology myšího genu kódujícího inhibitor proliferace kmenových buněk". DNA a buněčná biologie. 9 (8): 589–602. doi:10.1089 / dna.1990.9.589. PMID 2271120.
- Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (září 1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
- Naruse K, Ueno M, Satoh T, Nomiyama H, Tei H, Takeda M, Ledbetter DH, Coillie EV, Opdenakker G, Gunge N, Sakaki Y, Iio M, Miura R (červen 1996). "YAC kontig humánních CC chemokinových genů seskupených na chromozomu 17q11.2". Genomika. 34 (2): 236–40. doi:10.1006 / geno.1996.0274. PMID 8661057.
- Nibbs RJ, Yang J, Landau NR, Mao JH, Graham GJ (červen 1999). „LD78beta, neallelická varianta lidské MIP-1alfa (LD78alfa), má zvýšené interakce s receptory a silnou aktivitu potlačující HIV“. The Journal of Biological Chemistry. 274 (25): 17478–83. doi:10.1074 / jbc.274.25.17478. PMID 10364178.
- Xin X, Shioda T, Kato A, Liu H, Sakai Y, Nagai Y (srpen 1999). „Enhanced anti-HIV-1 activity of CC-chemokine LD78beta, a non-alelical variant of MIP-1alpha / LD78alpha“. FEBS Dopisy. 457 (2): 219–22. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01035-2. PMID 10471782. S2CID 84114854.
- Proost P, Menten P, Struyf S, Schutyser E, De Meester I, Van Damme J (září 2000). „Štěpení CD26 / dipeptidylpeptidázou IV převádí chemokin LD78beta na nejúčinnější atraktant monocytů a agonistu CCR1“. Krev. 96 (5): 1674–80. doi:10.1182 / krev. V96.5.1674. PMID 10961862.
- Lambeir AM, Proost P, Durinx C, Bal G, Senten K, Augustyns K, Scharpé S, Van Damme J, De Meester I (srpen 2001). „Kinetické zkoumání zkrácení chemokinů pomocí CD26 / dipeptidylpeptidázy IV odhalilo nápadnou selektivitu v rodině chemokinů“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (32): 29839–45. doi:10,1074 / jbc.M103106200. PMID 11390394.
- Struyf S, Menten P, Lenaerts JP, Put W, D'Haese A, De Clercq E, Schols D, Proost P, Van Damme J (červenec 2001). „Odlišné vazebné kapacity přirozených izoforem LD78beta makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa na CC chemokinové receptory 1, 3 a 5 ovlivňují jejich anti-HIV-1 aktivitu a chemotaktickou účinnost pro neutrofily a eosinofily.“ European Journal of Immunology. 31 (7): 2170–8. doi:10.1002 / 1521-4141 (200107) 31: 7 <2170 :: AID-IMMU2170> 3.0.CO; 2-D. PMID 11449371.
- Miyakawa T, Obaru K, Maeda K, Harada S, Mitsuya H (únor 2002). „Identifikace aminokyselinových zbytků kritických pro LD78beta, varianta lidského makrofágového zánětlivého proteinu-1alfa, vazba na CCR5 a inhibice replikace viru lidské imunodeficience typu 1 R5“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (7): 4649–55. doi:10,1074 / jbc.M109198200. PMID 11734558.
- Townson JR, Barcellos LF, Nibbs RJ (říjen 2002). "Počet kopií genu reguluje produkci lidského chemokinu CCL3-L1." European Journal of Immunology. 32 (10): 3016–26. doi:10.1002 / 1521-4141 (2002010) 32:10 <3016 :: AID-IMMU3016> 3.0.CO; 2-D. PMID 12355456.
- Modi WS (duben 2004). „CCL3L1 a CCL4L1 geny pro chemokiny jsou lokalizovány v segmentální duplikaci na chromozomu 17q12“. Genomika. 83 (4): 735–8. doi:10.1016 / j.ygeno.2003.09.019. PMID 15028295.
- Zhang Z, Henzel WJ (říjen 2004). „Predikce signálního peptidu na základě analýzy experimentálně ověřených štěpných míst“. Věda o bílkovinách. 13 (10): 2819–24. doi:10.1110 / ps.04682504. PMC 2286551. PMID 15340161.
- Gonzalez E, Kulkarni H, Bolivar H, Mangano A, Sanchez R, Catano G, Nibbs RJ, Freedman BI, Quinones MP, Bamshad MJ, Murthy KK, Rovin BH, Bradley W, Clark RA, Anderson SA, O'connell RJ, Agan BK, Ahuja SS, Bologna R, Sen L, Dolan MJ, Ahuja SK (březen 2005). "Vliv segmentových duplikací genů obsahujících CCL3L1 na náchylnost k HIV-1 / AIDS". Věda. 307 (5714): 1434–40. Bibcode:2005Sci ... 307.1434G. doi:10.1126 / science.1101160. PMID 15637236. S2CID 8815153.
- Ryu OH, Choi SJ, Firatli E, Choi SW, Hart PS, Shen RF, Wang G, Wu WW, Hart TC (duben 2005). "Proteolýza makrofágových zánětlivých proteinů-1alfa izoforem LD78beta a LD78alfa serinovými proteázami odvozenými od neutrofilů". The Journal of Biological Chemistry. 280 (17): 17415–21. doi:10,1074 / jbc.M500340200. PMID 15728180.
- Burns JC, Shimizu C, Gonzalez E, Kulkarni H, Patel S, Shike H, Sundel RS, Newburger JW, Ahuja SK (červenec 2005). „Genetické variace v páru receptor-ligand CCR5 a CCL3L1 jsou důležitými determinanty citlivosti na Kawasakiho chorobu“. The Journal of Infectious Diseases. 192 (2): 344–9. doi:10.1086/430953. PMC 2894631. PMID 15962231.