CACNA1B - CACNA1B

CACNA1B
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2LCM
Identifikátory
Aliasy	CACNA1B, BIII, CACNL1A5, CACNN, Cav2.2, DYT23, kalciová napěťově řízená kanálová podjednotka alfa1 B, NEDNEH
Externí ID	OMIM: 601012 MGI: 88296 HomoloGene: 20184 Genové karty: CACNA1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 9 (lidský)
Konec	138,124,624 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	24,763,152 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na C-konec proteinu; • vazba kovových iontů; • vazba nukleotidů; • vazba iontů vápníku; • napěťově řízená aktivita vápníkového kanálu; • vysoká aktivita vápníkového kanálu s vápníkem; • aktivita iontového kanálu; • ATP vazba; • napěťově řízená aktivita iontového kanálu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita vápníkového kanálu; • vazba amyloid-beta;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • presynapse; • membrána; • tělo neuronových buněk; • dendrit; • komplex vápníkového kanálu s napětím; • buněčná membrána;
Biologický proces	• transport iontů vápníku; • chemický synaptický přenos; • transmembránová doprava; • membránová depolarizace během akčního potenciálu; • pohybové chování; • regulace iontového transmembránového transportu; • regulace krevního tlaku; • regulace transportu iontů vápníku; • iontový transport; • regulace srdeční kontrakce; • transmembránový transport vápenatých iontů; • reakce na bolest; • membránová depolarizace; • GO: Sekrece neurotransmiteru 0010554; • dovoz iontů vápníku; • modulace chemického synaptického přenosu; • reakce na amyloid-beta;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	774
	12287
	ENSG00000148408
	ENSMUSG00000004113
	Q00975
	O55017
	NM_000718; NM_001243812
	NM_001042528; NM_007579
	NP_000709; NP_001230741
	NP_001035993; NP_031605
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

The napěťově závislá podjednotka vápníkového kanálu typu N alfa-1B je protein že u lidí je kódován CACNA1B gen.^[5]^[6]^[7] Protein α1B spolu s podjednotkami β a α2δ tvoří vápníkový kanál typu N (Ca_proti2,2 kanálu) PMID 26386135

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148408 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004113 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: CACNA1B vápníkový kanál, závislý na napětí, typ N, podjednotka alfa 1B“.
^ Diriong S, Lory P, Williams ME, Ellis SB, Harpold MM, Taviaux S (prosinec 1995). "Chromozomální lokalizace lidských genů pro alfa 1A, alfa 1B a alfa 1E napěťově závislé podjednotky kanálu Ca2 +". Genomika. 30 (3): 605–9. doi:10.1006 / geno.1995.1284. PMID 8825650.
^ Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (prosinec 2005). „International Union of Pharmacology. XLVIII. Nomenklatura a strukturně-funkční vztahy napěťově řízených vápníkových kanálů“. Farmakologické recenze. 57 (4): 411–25. doi:10.1124 / pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.

Další čtení

Mold J, Yasuda T, Schroeder CI, Beedle AM, Doering CJ, Zamponi GW, Adams DJ, Lewis RJ (srpen 2004). „Pomocná podjednotka alfa2delta snižuje afinitu omega-konotoxinů k vápníkovým kanálům rekombinantního typu N (Cav2.2)“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (33): 34705–14. doi:10,1074 / jbc.M310848200. PMID 15166237.
Park SY, Park YT, Kim KE, Rhee MC, Cho HJ, Kim DS (duben 2002). „Přímé opakování genu Ca2 + kanálu N-typu alfa1B funguje jako negativní regulační prvek v buňkách HeLa“. Molekuly a buňky. 13 (2): 341–6. PMID 12018859.
Calabrese B, Tabarean IV, Juranka P, Morris CE (listopad 2002). "Mechanosenzitivita proudů vápníkového kanálu typu N". Biofyzikální deník. 83 (5): 2560–74. Bibcode:2002BpJ .... 83,2560C. doi:10.1016 / S0006-3495 (02) 75267-3. PMC 1302342. PMID 12414690.
Moskvina V, Craddock N, Holmans P, Nikolov I, Pahwa JS, Green E, Owen MJ, O'Donovan MC (březen 2009). „Genové analýzy asociačních datových souborů v celém genomu: důkazy o mnoha běžných rizikových alelách pro schizofrenii a bipolární poruchu a o překrývání genetického rizika“. Molekulární psychiatrie. 14 (3): 252–60. doi:10.1038 / mp.2008.133. PMC 3970088. PMID 19065143.
Castiglioni AJ, Raingo J, Lipscombe D (říjen 2006). „Alternativní sestřih na C-konci CaV2.2 řídí expresi a hradlování vápníkových kanálů typu N“. The Journal of Physiology. 576 (Pt 1): 119–34. doi:10.1113 / jphysiol.2006.115030. PMC 1995641. PMID 16857708.
Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (prosinec 2005). „International Union of Pharmacology. XLVIII. Nomenklatura a strukturně-funkční vztahy napěťově řízených vápníkových kanálů“. Farmakologické recenze. 57 (4): 411–25. doi:10.1124 / pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.
Yokoyama CT, Myers SJ, Fu J, Mockus SM, Scheuer T, Catterall WA (leden 2005). "Mechanismus vazby na SNARE protein a regulace kanálů Cav2 fosforylací místa interakce synaptického proteinu". Molekulární a buněčné neurovědy. 28 (1): 1–17. doi:10.1016 / j.mcn.2004.08.019. PMID 15607937. S2CID 38370138.
Maeno-Hikichi Y, Chang S, Matsumura K, Lai M, Lin H, Nakagawa N, Kuroda S, Zhang JF (květen 2003). „Komplex PKC epsilon-ENH-kanál specificky moduluje Ca2 + kanály typu N“. Přírodní neurovědy. 6 (5): 468–75. doi:10.1038 / nn1041. PMID 12665800. S2CID 19964052.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). "Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích". Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Li D, Wang F, Lai M, Chen Y, Zhang JF (únor 2005). „Komplex proteinových fosfatázových 2kalpha-Ca2 + kanálů pro defosforylaci neuronálních Ca2 + kanálů fosforylovaných proteinkinázou C“. The Journal of Neuroscience. 25 (8): 1914–23. doi:10.1523 / JNEUROSCI.4790-04.2005. PMC 6726054. PMID 15728831.
Butcher AJ, Leroy J, Richards MW, Pratt WS, Dolphin AC (červenec 2006). „Důležitost obsazení spíše než afinita podjednotek CaV (beta) pro linker vápníkového kanálu I-II ve vztahu k funkci vápníkového kanálu“. The Journal of Physiology. 574 (Pt 2): 387–98. doi:10.1113 / jphysiol.2006.109744. PMC 1817768. PMID 16627564.
Stotz SC, Barr W, McRory JE, Chen L, Jarvis SE, Zamponi GW (leden 2004). „Několik strukturálních domén přispívá k regulaci deaktivace vápníkového kanálu typu N podjednotkou beta 3“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (5): 3793–800. doi:10,1074 / jbc.M308991200. PMID 14602720.
Maximov A, Bezprozvanny I (srpen 2002). „Synaptické cílení vápníkových kanálů typu N v hipokampálních neuronech“. The Journal of Neuroscience. 22 (16): 6939–52. doi:10.1523 / JNEUROSCI.22-16-06939.2002. PMC 3307533. PMID 12177192.
Peng S, Hajela RK, Atchison WD (prosinec 2002). "Charakteristiky blokování Pb2 + funkce lidských neuronálních L-, N- a R-typů Ca2 + kanálů přechodně exprimovaných v lidských embryonálních ledvinových buňkách 293". Molekulární farmakologie. 62 (6): 1418–30. doi:10,1124 / mol. 62.6.1418. PMID 12435810.
Murakami M, Fleischmann B, De Felipe C, Freichel M, Trost C, Ludwig A, Wissenbach U, Schwegler H, Hofmann F, Hescheler J, Flockerzi V, Cavalié A (říjen 2002). „Vnímání bolesti u myší postrádajících podjednotku beta3 napěťově aktivovaných vápníkových kanálů“. The Journal of Biological Chemistry. 277 (43): 40342–51. doi:10,1074 / jbc.M203425200. PMID 12161429.
Vitko I, Shcheglovitov A, Baumgart JP, Arias-Olguín II, Murbartián J, Arias JM, Perez-Reyes E (2008). Schwartz A (ed.). „Orientace beta kanálu vápníku vzhledem k podjednotce alfa (1) 2.2 je zásadní pro jeho regulaci aktivity kanálu“. PLOS ONE. 3 (10): e3560. Bibcode:2008PLoSO ... 3,3560V. doi:10,1371 / journal.pone.0003560. PMC 2570331. PMID 18958281.
Coppola T, Magnin-Luthi S, Perret-Menoud V, Gattesco S, Schiavo G, Regazzi R (srpen 2001). „Přímá interakce Rab3 efektorového RIM s kanály Ca2 +, SNAP-25 a synaptotagmin“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (35): 32756–62. doi:10,1074 / jbc.M100929200. PMID 11438518.
Johnson JM, Castle J, Garrett-Engele P, Kan Z, Loerch PM, Armor CD, Santos R, Schadt EE, Stoughton R, Shoemaker DD (prosinec 2003). „Průzkum celého genomu humánních alternativních sestřihů pre-mRNA s mikročipy exonového spojení“. Věda. 302 (5653): 2141–4. Bibcode:2003Sci ... 302.2141J. doi:10.1126 / science.1090100. PMID 14684825. S2CID 10007258.
Agler HL, Evans J, Tay LH, Anderson MJ, Colecraft HM, Yue DT (červen 2005). "Inhibiční modul řízený G proteinem kanálů typu N (ca (v) 2.2) ca2 +". Neuron. 46 (6): 891–904. doi:10.1016 / j.neuron.2005.05.011. PMID 15953418. S2CID 16963916.

externí odkazy

CACNA1B + protein, + člověk v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000148408 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004113 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: CACNA1B vápníkový kanál, závislý na napětí, typ N, podjednotka alfa 1B“.

[pmid8825650-6] Diriong S, Lory P, Williams ME, Ellis SB, Harpold MM, Taviaux S (prosinec 1995). "Chromozomální lokalizace lidských genů pro alfa 1A, alfa 1B a alfa 1E napěťově závislé podjednotky kanálu Ca2 +". Genomika. 30 (3): 605–9. doi:10.1006 / geno.1995.1284. PMID 8825650.

[pmid16382099-7] Catterall WA, Perez-Reyes E, Snutch TP, Striessnig J (prosinec 2005). „International Union of Pharmacology. XLVIII. Nomenklatura a strukturně-funkční vztahy napěťově řízených vápníkových kanálů“. Farmakologické recenze. 57 (4): 411–25. doi:10.1124 / pr.57.4.5. PMID 16382099. S2CID 10386627.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]