Bodo (vyhloubit) - Bodo (excavate)

Bodo
Bodo saltans - 400x (13895749563) .jpg
Bodo saltans
Vědecká klasifikace
Doména:
Eukaryota
(bez hodnocení):
Excavata
Kmen:
Euglenozoa
Třída:
Kinetoplastida
Objednat:
Eubodonida
Rodina:
Bodonida
Rod:
Bodo

Ehrenberg, 1831.

Bodo (/ˈboʊdoʊ/) je rod mikroskopický kinetoplastidy, bičíkatý vyhloubí poprvé popsán v roce 1831 autorem Christian Gottfried Ehrenberg.[1] Rod je malý, protože byl nedávno předefinován tak, aby zahrnoval pouze čtyři druhy.[2] Bodo zahrnuje volně žijící, fagotrofní organismy, které lze nalézt v mnoha mořských a sladkovodních prostředích i v některých suchozemských prostředích. Být fagotrofní, Bodo živí se bakteriemi a jinými mikroorganismy, které najde při plavání ve svých vodních stanovištích.[3] Plavecký pohyb usnadňují dva nerovné bičíky Bodo držení, které vycházejí z anteriorně umístěné bičíkové kapsy.[4] Bodo je zhruba ve tvaru fazole a kvůli své malé velikosti často chybí ve vzorcích z vody nebo suchozemského prostředí.

Dějiny

Rod byl původně popsán v roce 1831 Christianem Gottfriedem Ehrenbergem jako plodovité tělo, velmi krátký ocas, průhledný a schopný ukázat barvu jídla, které konzumuje.[1] Ehrenberg také popsal druhové druhy, Bodo saltans, jako zelená, ale toto bylo později vyvráceno, protože bylo zjištěno, že zelené zabarvení pochází z fotosyntetických bakterií, které požívá.[4] V roce 1988 se zjistilo, že Bodo je fagotrof, který se živí bakteriemi mnoha druhů, některé bakterie jsou přitažlivější než jiné.[4] V roce 2002 Simpson et al. rozdělil bodonidy, což vedlo ke zmenšení rodu Bodo protože většina jeho druhů byla přenesena do jiných rodů.[5] Bodo byl zadán do nové objednávky,Eubodonida Během této výměny bylo původních 149 druhů sníženo na pouhé 4.[5] Od roku 2002 bylo do rodu přidáno 11 nových druhů, ale 9 z nich je považováno za kontroverzní.[2] Po 130 letech Bodo byl vylepšen a nyní je jediným rodem v rodině Bodonidae což z něj dělá homogenní seskupení, ale jak se bude více studovat na druhu, pravděpodobně dojde k dalším změnám.[2] Dosažení tohoto bodu trvalo 130 let, protože i po použití analýzy více genů stále existují velké spory ohledně umístění určitých druhů do rodu.[6]

Stanoviště a ekologický význam

V přírodě, Bodo se vyskytuje v mořské nebo sladké vodě a v suchozemských prostředích s vysokou úrovní vlhkosti, například v hnoji.[4] Bodo sedí blízko dna potravinové sítě, od které je oddělená. Jako fagotrofové Bodo živí se bakteriemi požitím, které může způsobit změnu barvy organismů jako Bodo je transparentní.[4] Bakterie jsou často fototrofní, což znamená Bodo jsou součástí druhé vrstvy potravinových sítí, protože jim chybí schopnost vyrábět vlastní energii. Několik členů rodu Bodo jsou postiženi a obří virus známý jako Bodo saltans virus (BsV), nejhojnější obří viry v oceánu.[7] Různé kmeny viru jsou schopné infikovat pouze konkrétní druhy, nebo v případě Bodo saltans dokonce konkrétní kmeny tohoto velmi heterogenního taxonu.[7]

Morfologie

Bodo je mikroskopický, biflagelovaný, jednobuněčný organismus ve tvaru ledvin, s největšími buňkami o délce 8 μm a šířce 5 μm.[4] Některé z menších organismů mohou mít délku jen 3 μm a šířku 2 μm. Organismy jsou průhledné, ale vzhledem k jejich absorpci fotosyntetických bakterií často připomínají zelené hrozny.[1] Bodo zahrnuje volně žijící organismy se schopností také se připojit k substrátu pomocí špičky svého delšího bičíku. Normální funkcí tohoto bičíku je pohyb, ale připojení nastává, aby bylo možné vytvořit napájecí proudy.[4] Během krmení je kratší ze dvou bičíků, které obvykle mají mastigonémy připojený, se používá zametacím pohybem k pohybu bakterií směrem k cirkumbukálním klopám, které leží těsně pod buněčnou membránou. Cirkumbukální lappety se pak stočí kolem membrány, aby pohltily bakterie do ústní dutiny, kde je pak lze transportovat do cytofaryngu. V cytofaryngu jsou bakterie baleny do potravinářských vakuol, což umožňuje trávení a skladování.[4]

V buňce Bodo saltans také obsahuje kontraktilní vakuolu, kinetoplast, bičíkovou kapsu, smyčkové mitochondrie a jádro. V blízkosti kinetoplastu je přítomno osm mikrotubulů, které jsou odpovědné za podporu cytofaryngu. Předpokládá se, že tyto mikrotubuly jsou zahrnuty do požití, jak je popsáno v Mitchell et al. v roce 1988 však zůstává nepotvrzeno, pokud hrají aktivní roli. Smyčkové mitochondrie zabírají velké množství vnitřního objemu buňky a obsahují kinetoplast, velkou síť kruhové DNA.[4]

Genetika

Dokonce i po nedávné nové definici rodu Bodo, Bodo saltans obsahuje obrovskou genetickou rozmanitost a je pravděpodobné, že tyto druhy budou muset být dále rozděleny. Jiné druhy rodu nebyly molekulárně studovány. Kinetoplastová DNA (kDNA) se skládá z tisíců kruhových kousků DNA, které jsou všechny potřebné ke správné replikaci organismu.[8] Tyto kruhové geny vedou k velmi jedinečnému mitochondriálnímu genomu, protože některé z genů nejsou přítomny v dokončené formě s fragmenty umístěnými na více kruzích. Toto podivné třídění kDNA vede ke zvýšení obtížnosti při pokusu o vytvoření fylogenetických stromů pomocí kDNA.[8]

Druh[9]

  • Bodo celer
  • Bodo rostratus
  • Bodo saltans
  • Bodo uncinatus

  • Bodo sp.

  • Bodo globosus

  • Bodo caudatus

  • Bodo caudatus cysty

Reference

  1. ^ A b C Ehrenberg C.G. 1831. Über die Entwicklung und Lebensdauer der Infusionsthiere nebst ferneren Beiträgen zu einer Vergleichung ihrer organischen Systemen. Physikalische Abhandlungen der Königlichen Akademie der Wissenschaften zu Berlin 1-154.
  2. ^ A b C Cavalier-Smith, T. 2016. Vyšší klasifikace a fylogeneze Euglenozoa. European Journal of Protistology 56, 250–276.
  3. ^ Davidovich, N.A., Davidovich, O.I., Podunay, Yu.A., Polyakova, S.L., Gastineau, R. 2019. Dekontaminace kultur diatomových řas kontaminovaných kinetoplastidem Bodo saltans Ehrenberg, 1832. Moskva Univ. Biol.Sci. Býk. 74, 63–68.
  4. ^ A b C d E F G h i Mitchell, G.C., Baker, J.H., Sleigh, M.A. 1988. Krmení sladkovodního bičíku, Bodo saltans, na různorodých bakteriích 1. The Journal of Protozoology 35, 219–222.
  5. ^ A b Moreira, D., López-García, P., Vickerman, K. 2004. Aktualizovaný pohled na kinetoplastidovou fylogenezi s využitím environmentálních sekvencí a užší skupiny: Návrh nového
  6. ^ Jackson, A.P., Quail, M.A., Berriman, M. 2008. Pohledy na sekvenci genomu volně žijícího kinetoplastidu: Bodo saltans (Kinetoplastida: Euglenozoa). BMC Genomics 9, 594.
  7. ^ A b Deeg, C.M., Chow, C.-E.T., Suttle, C.A. 2018. Infekce kinetoplastidy Bodo saltans virus (BsV), okno do nejhojnějších obřích virů v moři. eLife 7, e33014.
  8. ^ A b Lukeš, J., Lys Guilbride, D., Vot •• pka, J., Zíková, A., Benne, R., Englund, P.T. (2002). Síť Kinetoplast DNA: Vývoj nepravděpodobné struktury. Eukaryot Cell 1, 495–502
  9. ^ Guiry, M.D. a Guiry, G.M. 2020. AlgaeBase. Celosvětová elektronická publikace, National University of Ireland, Galway. http://www.algaebase.org