Beta defensin 1 - Beta defensin 1 - Wikipedia

DEFB1
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1E4S, 1IJU, 1 IJV, 1KJ5, 2NLB, 2NLC, 2NLD, 2NLE, 2NLF, 2NLG, 2NLH, 2NLP, 2NLQ, 2NLS, 2PLZ
Identifikátory
Aliasy	DEFB1, BD1, DEFB-1, DEFB101, HBD1, defensin beta 1
Externí ID	OMIM: 602056 HomoloGene: 88476 Genové karty: DEFB1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	6,877,936 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na chemokinový receptor CCR6; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• Golgiho lumen; • extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • spermie; • extracelulární; • vnější složka membrány; • mikrovezikul; • membrána;
Biologický proces	• chemotaxe; • Signální dráha receptoru spřaženého s G-proteinem; • obranná reakce; • vrozená imunitní odpověď na sliznici; • akutní zánětlivá odpověď; • reakce na bakterii; • imunitní odpověď; • reakce na testosteron; • pozitivní regulace motility bičíkovitých spermií zapojených do kapacitace; • obranná reakce na bakterii; • vápníkem zprostředkovaná signalizace pomocí intracelulárního zdroje vápníku; • cAMP zprostředkovaná signalizace; • obranná reakce na gramnegativní bakterii; • antimikrobiální humorální odpověď; • vrozený imunitní systém; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem; • obranná odpověď na grampozitivní bakterii;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1672
	n / a
	ENSG00000164825; ENSG00000284881
	n / a
	P60022
	n / a
	NM_005218
	n / a
	NP_005209
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Beta-defensin 1 je protein že u lidí je kódován DEFB1 gen.^[3]^[4]

Defensiny tvoří rodinu mikrobicidních a cytotoxických peptidů vyrobených neutrofily. Členové rodiny defensinu jsou velmi podobní v proteinové sekvenci. Tento gen kóduje defensin, beta 1, antimikrobiální peptid podílející se na rezistenci epiteliální povrchy na mikrobiální kolonizaci. Tento gen se mapuje v těsné blízkosti defensinu člena rodiny defensinu, alfa 1, a podílí se na patogenezi cystická fibróza.^[4] Jednonukleotidové polymorfismy v DEFB1 gen byly spojeny s plazmou kynurenin koncentrace v velká depresivní porucha pacienti v GWAS.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000284881 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bensch KW, Raida M, Mägert HJ, Schulz-Knappe P, Forssmann WG (červenec 1995). „hBD-1: nový beta-defensin z lidské plazmy“. FEBS Dopisy. 368 (2): 331–5. doi:10.1016/0014-5793(95)00687-5. PMID 7628632. S2CID 84766207.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DEFB1 defensin, beta 1“.
^ Liu D, Ray B, Neavin DR, Zhang J, Athreya AP, Biernacka JM a kol. (Leden 2018). „Beta-defensin 1, arylový uhlovodíkový receptor a plazmatický kynurenin u depresivní poruchy: genomika informovaná metabolomiky“. Translační psychiatrie. 8 (1): 10. doi:10.1038 / s41398-017-0056-8. PMC 5802574. PMID 29317604.

Další čtení

Ganz T, Lehrer RI (květen 1995). "Defensins". Farmakologie a terapeutika. 66 (2): 191–205. doi:10.1016 / 0163-7258 (94) 00076-F. PMID 7667395.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (září 1996). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Výzkum genomu. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Goldman MJ, Anderson GM, Stolzenberg ED, Kari UP, Zasloff M, Wilson JM (únor 1997). „Lidský beta-defensin-1 je antibiotikum citlivé na sůl v plicích, které je inaktivováno při cystické fibróze.“ Buňka. 88 (4): 553–60. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 81895-4. PMID 9038346. S2CID 6614946.
McCray PB, Bentley L (březen 1997). „Lidské epitelie dýchacích cest exprimují beta-defensin“. American Journal of Respiratory Cell and Molecular Biology. 16 (3): 343–9. doi:10.1165 / ajrcmb.16.3.9070620. PMID 9070620.
Liu L, Zhao C, Heng HH, Ganz T (srpen 1997). „Lidský beta-defensin-1 a alfa-defensiny jsou kódovány sousedními geny: dvě rodiny peptidů s odlišnou disulfidovou topologií mají společný původ.“ Genomika. 43 (3): 316–20. doi:10.1006 / geno.1997.4801. PMID 9268634.
Valore EV, Park CH, Quayle AJ, Wiles KR, McCray PB, Ganz T (duben 1998). „Lidský beta-defensin-1: antimikrobiální peptid urogenitálních tkání“. The Journal of Clinical Investigation. 101 (8): 1633–42. doi:10.1172 / JCI1861. PMC 508744. PMID 9541493.
Schnapp D, Reid CJ, Harris A (září 1998). "Lokalizace exprese lidského beta defensinu-1 v pankreatu a ledvinách". The Journal of Pathology. 186 (1): 99–103. doi:10.1002 / (SICI) 1096-9896 (199809) 186: 1 <99 :: AID-PATH133> 3.0.CO; 2- #. PMID 9875146.
Hiratsuka T, Nakazato M, Ashitani J, Matsukura S (únor 1999). „[Studie lidského beta-defensinu-1 a lidského beta-defensinu-2 v obraně sliznic dýchacích cest]“ “. Kansenshogaku Zasshi. The Journal of the Japanese Association for Infectious Diseases. 73 (2): 156–62. doi:10.11150 / kansenshogakuzasshi1970.73.156. PMID 10213993.
Gropp R, Frye M, Wagner TO, Bargon J (duben 1999). „Epiteliální defensiny zhoršují adenovirovou infekci: důsledky pro genovou terapii zprostředkovanou adenovirem“. Lidská genová terapie. 10 (6): 957–64. doi:10.1089/10430349950018355. PMID 10223729.
Mathews M, Jia HP, Guthmiller JM, Losh G, Graham S, Johnson GK a kol. (Červen 1999). „Produkce antimikrobiálních peptidů beta-defensinu ústní sliznicí a slinnými žlázami“. Infekce a imunita. 67 (6): 2740–5. doi:10.1128 / IAI.67.6.2740-2745.1999. PMC 96577. PMID 10338476.
Bøe R, Silvola J, Yang J, Moens U, McCray PB, Stenfors LE, Seljfelid R (září 1999). „Lidská mRNA beta-defensinu-1 je transkribována do bubínku a sousedního epitelu zvukovodu“. Infekce a imunita. 67 (9): 4843–6. doi:10.1128 / IAI.67.9.4843-4846.1999. PMC 96817. PMID 10456939.
Yang D, Chertov O, Bykovskaia SN, Chen Q, Buffo MJ, Shogan J a kol. (Říjen 1999). „Beta-defensiny: propojení vrozené a adaptivní imunity prostřednictvím dendritických a T buněk CCR6“. Věda. 286 (5439): 525–8. doi:10.1126 / science.286.5439.525. PMID 10521347.
Tunzi CR, Harper PA, Bar-Oz B, Valore EV, Semple JL, Watson-MacDonell J a kol. (Červenec 2000). "Exprese beta-defensinu v epitelu lidské mléčné žlázy". Pediatrický výzkum. 48 (1): 30–5. doi:10.1203/00006450-200007000-00008. PMID 10879797.
Sahasrabudhe KS, Kimball JR, Morton TH, Weinberg A, Dale BA (září 2000). "Exprese antimikrobiálního peptidu, lidského beta-defensinu 1, v buňkách kanálku menších slinných žláz a detekce ve slinách". Journal of Dental Research. 79 (9): 1669–74. doi:10.1177/00220345000790090601. PMID 11023262. S2CID 2364914.
Jia HP, Starner T, Ackermann M, Kirby P, Tack BF, McCray PB (leden 2001). "Bohatá lidská exprese beta-defensinu-1 v mléku a mléčné žláze epitelu". The Journal of Pediatrics. 138 (1): 109–12. doi:10.1067 / mpd.2001.109375. PMID 11148522.
Ali RS, Falconer A, Ikram M, Bissett CE, Cerio R, Quinn AG (červenec 2001). "Exprese peptidových antibiotik lidský beta defensin-1 a lidský beta defensin-2 v normální lidské kůži". The Journal of Investigative Dermatology. 117 (1): 106–11. doi:10.1046 / j.0022-202x.2001.01401.x. PMID 11442756.
Carothers DG, Graham SM, Jia HP, Ackermann MR, Tack BF, McCray PB (2001). „Produkce beta-defensinových antimikrobiálních peptidů sliznicí maxilárního sinu“. American Journal of Rhinology. 15 (3): 175–9. doi:10.2500/105065801779954238. PMID 11453504. S2CID 31583849.
Hoover DM, Chertov O, Lubkowski J (říjen 2001). „Struktura lidského beta-defensinu-1: nové poznatky o strukturních vlastnostech beta-defensinu“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (42): 39021–6. doi:10,1074 / jbc.M103830200. PMID 11486002.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000284881 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000164825, ENSG00000284881 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7628632-3] Bensch KW, Raida M, Mägert HJ, Schulz-Knappe P, Forssmann WG (červenec 1995). „hBD-1: nový beta-defensin z lidské plazmy“. FEBS Dopisy. 368 (2): 331–5. doi:10.1016/0014-5793(95)00687-5. PMID 7628632. S2CID 84766207.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: DEFB1 defensin, beta 1“.

[5] Liu D, Ray B, Neavin DR, Zhang J, Athreya AP, Biernacka JM a kol. (Leden 2018). „Beta-defensin 1, arylový uhlovodíkový receptor a plazmatický kynurenin u depresivní poruchy: genomika informovaná metabolomiky“. Translační psychiatrie. 8 (1): 10. doi:10.1038 / s41398-017-0056-8. PMC 5802574. PMID 29317604.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]