Základna J - Base J
 | |
| Jména | |
|---|---|
| Název IUPAC 5-[[(3R,4S,5S,6R) -3,4,5-Trihydroxy-6- (hydroxymethyl) tetrahydropyran-2-yl] oxymethyl] -1H-pyrimidin-2,4-dion | |
| Ostatní jména β-D-Glukosyl-5-hydroxymethyluracil β-D-Glukosyl-hydroxymethyluracil | |
| Identifikátory | |
3D model (JSmol ) | |
| ChemSpider | |
PubChem CID | |
| |
| |
| Vlastnosti | |
| C11H16N2Ó8 | |
| Molární hmotnost | 304.255 g · mol−1 |
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
| Reference Infoboxu | |
β-D-Glukopyranosyloxymethyluracil nebo základna J je hypermodifikovaný nukleobáze nalezen v DNA z kinetoplastidy včetně člověka patogenní trypanosomy. Bylo objeveno v roce 1993 v trypanosomu Trypanosoma brucei a byla první hypermodifikovanou nukleobází nalezenou v eukaryotické DNA; od té doby byl nalezen v jiných kinetoplastidech, včetně Leishmania.[1]V těchto organismech působí Base J jako a RNA polymeráza II terminátor transkripce s jeho odstraněním v vyřazovací buňky je doprovázeno masivním čtením přes terminační místa RNA polymerázy II, což se nakonec ukáže jako smrtelné pro buňku.[2][3]
Základna J je tvořena iniciálou hydroxylace z thymidin a následující glykosylace dosud neznámým glykosyltransferáza.[1]
Biosyntéza báze J. A: thymidinhydroxyláza; B: beta-glukosyltranferáza; 1: dT (desoxy thymidin); 2: HOCH3dU; 3: dJ
Reference
- ^ A b Borst, Piet; Sabatini, Robert (říjen 2008). „Base J: Discovery, Biosynthesis, and Možné funkce“. Výroční přehled mikrobiologie. 62 (1): 235–251. doi:10.1146 / annurev.micro.62.081307.162750. PMID 18729733.
- ^ van Luenen, Henri G.A.M .; Farris, Carol; Jan, Sabrina; Genest, Paul-Andre; Tripathi, Pankaj; Velds, Arno; Kerkhoven, Ron M .; Nieuwland, Marja; Haydock, Andrew; Ramasamy, Gowthaman; Vainio, Saara; Heidebrecht, Tatjana; Perrakis, Anastassis; Pagie, Ludo; van Steensel, Bas; Myler, Peter J .; Borst, Piet (srpen 2012). „Glukosylovaný hydroxymethyluracil, DNA Base J, brání transkripčnímu přečtení v Leishmanii“. Buňka. 150 (5): 909–921. doi:10.1016 / j.cell.2012.07.030. PMC 3684241. PMID 22939620.
- ^ Hazelbaker, Dane Z .; Buratowski, Stephen (listopad 2012). „Přepis: Base J blokuje cestu“. Aktuální biologie. 22 (22): R960 – R962. doi:10.1016 / j.cub.2012.10.010. PMC 3648658. PMID 23174300.