Bariéra proti autointegračnímu faktoru 1 - Barrier to autointegration factor 1
Faktor bariéry vůči autointegraci je protein že u lidí je kódován BANF1 gen.[5][6] Je členem faktor bariéry proti autointegraci rodina proteinů.
Funkce
Protein kódovaný tímto genem byl identifikován podle své schopnosti chránit retroviry z intramolekulární integrace, a proto podporují intermolekulární integraci do genomu hostitelské buňky. Endogenní funkce proteinu není známa. Protein tvoří homodimer, který se lokalizuje do jádra a je specificky asociován s chromozomy během mitóza. Tento protein se váže na DNA nespecifickým způsobem a studie na hlodavcích naznačují, že se také váže na polypeptid spojený s laminou 2, součást jaderná vrstva.[6] Také se asociuje s doménou LEM obsahující proteiny LAP2, Emerin, a MAN1. Vazebná schopnost proteinu k DNA je modulována koncentrací ATP.[7]
Interakce
Bylo prokázáno, že je překážkou faktoru 1 autointegrace komunikovat s Thymopoetin.[8]
Klinický význam
Ukázalo se, že mutace v tomto genu způsobují dědičnost progeroidní syndrom.[9]
Viz také
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175334 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024844 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Lee MS, Craigie R (březen 1998). „Dříve neidentifikovaný hostitelský protein chrání retrovirovou DNA před autointegrací“. Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (4): 1528–33. doi:10.1073 / pnas.95.4.1528. PMC 19075. PMID 9465049.
- ^ A b „Entrez Gene: BANF1 bariéra proti autointegračnímu faktoru 1“.
- ^ Sridharan S, Kurzawa N, Werner T, Günthner I, Helm D, Huber W, Bantscheff M, Savitski MM (březen 2019). „Rozpustnost v celém proteinu a profilování tepelné stability odhaluje odlišné regulační role ATP“. Příroda komunikace. 10 (1): 1155. doi:10.1038 / s41467-019-09107-r. PMC 6411743. PMID 30858367.
- ^ Furukawa K (srpen 1999). „LAP2 vazebný protein 1 (L2BP1 / BAF) je kandidátským mediátorem interakce LAP2-chromatin“. J. Cell Sci. 112 (Pt 15): 2485–92. PMID 10393804.
- ^ Puente XS, Quesada V, Osorio FG, Cabanillas R, Cadiñanos J, Fraile JM, Ordóñez GR, Puente DA, Gutiérrez-Fernández A, Fanjul-Fernández M, Lévy N, Freije JM, López-Otín C (květen 2011). „Exome sekvenování a funkční analýza identifikuje mutaci BANF1 jako příčinu dědičného progeroidního syndromu“. Dopoledne. J. Hum. Genet. 88 (5): 650–6. doi:10.1016 / j.ajhg.2011.04.010. PMC 3146734. PMID 21549337.
Další čtení
- Goldberg M, Harel A, Gruenbaum Y (2000). "Jaderná vrstva: molekulární organizace a interakce s chromatinem". Krit. Reverend Eukaryot. Gene Expr. 9 (3–4): 285–93. doi:10.1615 / critreveukargeneexpr.v9.i3-4.130. PMID 10651245.
- Segura-Totten M, Wilson KL (2004). "BAF: role v chromatinu, jaderné struktuře a retrovirové integraci". Trends Cell Biol. 14 (5): 261–6. doi:10.1016 / j.tcb.2004.03.004. PMID 15130582.
- Van Maele B, Debyser Z (2005). „Integrace HIV-1: souhra mezi HIV-1 integrázou, buněčnými a virovými proteiny“. Recenze AIDS. 7 (1): 26–43. PMID 15875659.
- Van Maele B, Busschots K, Vandekerckhove L a kol. (2006). "Buněčné kofaktory integrace HIV-1". Trends Biochem. Sci. 31 (2): 98–105. doi:10.1016 / j.tibs.2005.12.002. PMID 16403635.
- Lee MS, Craigie R (1994). „Ochrana retrovirové DNA před autointegrací: zapojení buněčného faktoru“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (21): 9823–7. doi:10.1073 / pnas.91.21.9823. PMC 44909. PMID 7937898.
- Vážený PH, Bankier AT, Piper MB (1998). "Metrická HAPPY mapa lidského chromozomu 14 s vysokým rozlišením". Genomika. 48 (2): 232–41. doi:10.1006 / geno.1997.5140. PMID 9521877.
- Lynch RA, Piper M, Bankier A a kol. (1999). „Genomická a funkční mapa chromosomové klastrové oblasti 14 t (12; 14) zlomového bodu v děložním leiomyomu“. Genomika. 52 (1): 17–26. doi:10.1006 / geno.1998.5406. PMID 9740667.
- Cai M, Huang Y, Zheng R a kol. (1998). "Struktura řešení buněčného faktoru BAF odpovědného za ochranu retrovirové DNA před autointegrací". Nat. Struct. Biol. 5 (10): 903–9. doi:10.1038/2345. PMID 9783751. S2CID 857675.
- Furukawa K (1999). „LAP2 vazebný protein 1 (L2BP1 / BAF) je kandidátským mediátorem interakce LAP2-chromatin“. J. Cell Sci. 112 (15): 2485–92. PMID 10393804.
- Zheng R, Ghirlando R, Lee MS a kol. (2000). „Barrier-to-autointegration factor (BAF) přemostí DNA v diskrétním nukleoproteinovém komplexu vyššího řádu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (16): 8997–9002. doi:10.1073 / pnas.150240197. PMC 16810. PMID 10908652.
- Umland TC, Wei SQ, Craigie R, Davies DR (2000). "Strukturální základ přemostění DNA faktorem bariéry proti autointegraci". Biochemie. 39 (31): 9130–8. doi:10.1021 / bi000572w. PMID 10924106.
- Harris D, Engelman A (2001). „Struktura i vazebná funkce DNA faktoru bariéry proti autointegraci přispívají k rekonstituci integrace HIV typu 1 in vitro“. J. Biol. Chem. 275 (50): 39671–7. doi:10,1074 / jbc.M002626200. PMID 11005805.
- Lee KK, Haraguchi T, Lee RS a kol. (2002). "Zřetelné funkční domény v emerinu váží lamin A a DNA přemosťující protein BAF". J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4567–73. PMID 11792821.
- Haraguchi T, Koujin T, Segura-Totten M a kol. (2002). "BAF je vyžadován pro montáž emerinů do reformujícího se jaderného obalu". J. Cell Sci. 114 (Pt 24): 4575–85. PMID 11792822.
- Segura-Totten M, Kowalski AK, Craigie R, Wilson KL (2002). „Faktor bariéry vůči autointegraci: hlavní role při dekondenzaci chromatinu a jaderné montáži“. J. Cell Biol. 158 (3): 475–85. doi:10.1083 / jcb.200202019. PMC 2173821. PMID 12163470.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Holaska JM, Lee KK, Kowalski AK, Wilson KL (2003). „Transkripční represor bez zárodečných buněk (GCL) a bariéra proti autointegračnímu faktoru (BAF) soutěží o vazbu na emerin in vitro“. J. Biol. Chem. 278 (9): 6969–75. doi:10,1074 / jbc.M208811200. PMID 12493765.
- Lin CW, Engelman A (2003). „Faktor bariéry vůči autointegraci je součástí funkčních preintegračních komplexů viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Virol. 77 (8): 5030–6. doi:10.1128 / JVI.77.8.5030-5036.2003. PMC 152146. PMID 12663813.
externí odkazy
- Člověk BANF1 umístění genomu a BANF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |