BTBD2 - BTBD2

BTBD2
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3NO8
Identifikátory
Aliasy	BTBD2, Doména BTB obsahující 2
Externí ID	OMIM: 608531 MGI: 1933831 HomoloGene: 32365 Genové karty: BTBD2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	2,034,881 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 10 (myš)
Konec	80,657,071 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • cytosol; • P-tělo;
Biologický proces	• proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace proteolýzy; • neurogeneze;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55643
	208198
	ENSG00000133243
	ENSMUSG00000003344
	Q9BX70
	n / a
	NM_017797
	NM_145361; NM_001379084
	NP_060267
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující doménu BTB / POZ 2 je protein že u lidí je kódován BTBD2 gen.^[5]^[6]

Funkce

C-konec proteinu kódovaného tímto genem váže topoizomerázu I. N-konec obsahuje oblast bohatou na prolin a doménu BTB / POZ (široký komplex, Tramtrack a bric virus brac / neštovic a zinkový prst), oba z nichž jsou obvykle zapojeny do interakcí protein-protein. Subcelulárně se protein lokalizuje do cytoplazmatických těl.^[6]

Interakce

BTBD2 bylo prokázáno komunikovat s TOP1.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133243 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003344 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Carim-Todd L, Sumoy L, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (leden 2001). "Identifikace a charakterizace BTBD1, nové BTB domény obsahující gen na lidském chromozomu 15q24". Gen. 262 (1–2): 275–81. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00513-8. PMID 11179693.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BTBD2 BTB (POZ) doména obsahující 2“.
^ Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2002). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.

externí odkazy

Člověk BTBD2 umístění genomu a BTBD2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q9BX70 (Protein 2 obsahující doménu BTB / POZ) na PDBe-KB.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2003). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.
Yamada A, Kawano K, Koga M, Takamori S, Nakagawa M, Itoh K (červen 2003). „Genové a peptidové analýzy nově definovaných antigenů rakoviny plic rozpoznávaných HLA-A2402-omezenými nádorově specifickými cytotoxickými T lymfocyty“. Výzkum rakoviny. 63 (11): 2829–35. PMID 12782588.
Xu L, Yang L, Moitra PK, Hashimoto K, Rallabhandi P, Kaul S, Meroni G, Jensen JP, Weissman AM, D'Arpa P (srpen 2003). „BTBD1 a BTBD2 se kolokalizují na cytoplazmatická těla pomocí RBCC / tripartitního motivového proteinu, TRIM5delta“. Experimentální výzkum buněk. 288 (1): 84–93. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00187-3. PMID 12878161.
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (červenec 2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Výzkum genomu. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Barrios-Rodiles M, Brown KR, Ozdamar B, Bose R, Liu Z, Donovan RS, Shinjo F, Liu Y, Dembowy J, Taylor IW, Luga V, Przulj N, Robinson M, Suzuki H, Hayashizaki Y, Jurisica I, Wrana JL (březen 2005). "Vysoce výkonné mapování dynamické signalizační sítě v savčích buňkách". Věda. 307 (5715): 1621–5. doi:10.1126 / science.1105776. PMID 15761153. S2CID 39457788.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E „Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000133243 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003344 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11179693-5] Carim-Todd L, Sumoy L, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (leden 2001). "Identifikace a charakterizace BTBD1, nové BTB domény obsahující gen na lidském chromozomu 15q24". Gen. 262 (1–2): 275–81. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00513-8. PMID 11179693.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: BTBD2 BTB (POZ) doména obsahující 2“.

[pmid11818025-7] Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2002). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]