BTBD1 - BTBD1 - Wikipedia

BTBD1
Identifikátory
Aliasy	BTBD1, C15orf1, NS5ATP8, doména BTB obsahující 1
Externí ID	OMIM: 608530 MGI: 1933765 HomoloGene: 23529 Genové karty: BTBD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	83,067,252 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	81,829,431 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • P-tělo; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • cytosol; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• regulace vazby na bílkoviny; • ubikvitinace bílkovin; • regulace proteolýzy; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • neurogeneze; • posttranslační modifikace; • vývoj svalových orgánů; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	53339
	83962
	ENSG00000064726
	ENSMUSG00000025103
	Q9H0C5
	P58544
	NM_001011885; NM_025238
	NM_146193
	NP_001011885; NP_079514
	NP_666305
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Proteiny obsahující doménu BTB / POZ 1 je protein že u lidí je kódován BTBD1 gen.^[5]

Funkce

C-konec proteinu kódovaného tímto genem váže topoizomerázu I. N-konec obsahuje oblast bohatou na prolin a doménu BTB / POZ (široký komplex, Tramtrack a bric virus brac / neštovic a zinkový prst), oba z nichž jsou obvykle zapojeny do interakcí protein-protein. Subcelulárně se protein lokalizuje do cytoplazmatických těl. Výsledkem alternativního sestřihu je více variant transkriptu kódujících různé izoformy.^[5]

Interakce

BTBD1 bylo prokázáno komunikovat s TOP1.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000064726 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025103 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BTBD1 BTB (POZ) doména obsahující 1“.
^ Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2002). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.

externí odkazy

Člověk BTBD1 umístění genomu a BTBD1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (leden 1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (říjen 1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (březen 2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Výzkum genomu. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Carim-Todd L, Sumoy L, Andreu N, Estivill X, Escarceller M (leden 2001). "Identifikace a charakterizace BTBD1, nové BTB domény obsahující gen na lidském chromozomu 15q24". Gen. 262 (1–2): 275–81. doi:10.1016 / S0378-1119 (00) 00513-8. PMID 11179693.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Výzkum genomu. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A, Pepperkok R, Wiemann S (září 2000). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. Zprávy EMBO. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2003). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.
Xu L, Yang L, Moitra PK, Hashimoto K, Rallabhandi P, Kaul S, Meroni G, Jensen JP, Weissman AM, D'Arpa P (srpen 2003). „BTBD1 a BTBD2 se kolokalizují na cytoplazmatická těla pomocí RBCC / tripartitního motivového proteinu, TRIM5delta“. Experimentální výzkum buněk. 288 (1): 84–93. doi:10.1016 / S0014-4827 (03) 00187-3. PMID 12878161.
Pisani DF, Cabane C, Derijard B, Dechesne CA (listopad 2004). „Protein BTBD1 interagující s topoizomerázou 1 je nezbytný pro diferenciaci svalových buněk“. Buněčná smrt a diferenciace. 11 (11): 1157–65. doi:10.1038 / sj.cdd.4401479. PMID 15486563. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Wiemann S, Arlt D, Huber W, Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (říjen 2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Výzkum genomu. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I, del Val C, Arlt D, Hahne F, Bechtel S, Simpson J, Hofmann O, Hide W, Glatting KH, Huber W, Pepperkok R, Poustka A, Wiemann S (leden 2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Výzkum nukleových kyselin. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000064726 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025103 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] A ^b „Entrez Gene: BTBD1 BTB (POZ) doména obsahující 1“.

[pmid11818025-6] Xu L, Yang L, Hashimoto K, Anderson M, Kohlhagen G, Pommier Y, D'Arpa P (2002). „Charakterizace BTBD1 a BTBD2, dvou podobných Kelchových proteinů obsahujících doménu BTB, které interagují s topoizomerázou I“. BMC Genomics. 3: 1. doi:10.1186/1471-2164-3-1. PMC 64781. PMID 11818025.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]