BICD1 - BICD1

BICD1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4YTD
Identifikátory
Aliasy	BICD1, BICD, BICD nákladní adaptér 1, bic-D 1
Externí ID	OMIM: 602204 MGI: 1101760 HomoloGene: 37518 Genové karty: BICD1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	32,383,633 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	149,563,329 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání dynaktinu; • Vazba Rab GTPázy; • strukturní složka cytoskeletu; • vazba na receptor aktivovaný proteinázou; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita cytoskeletálního adaptéru; • vazba komplexu dynein; • vazba protein kinázy; • dyneinová vazba mezi řetězci;
Buněčná složka	• Golgiho aparát; • membrána; • kompartment virové sestavy hostitelské buňky; • trans-Golgiho síť; • tubulinový komplex; • perinukleární oblast cytoplazmy; • cytoplazmatický mikrotubul; • cytoskelet; • cytoplazmatický váček; • cytosol; • centrosome;
Biologický proces	• lokalizace proteinu na organelu; • regulace aktivity receptoru aktivovaného proteinázou; • pozitivní regulace receptorem zprostředkované endocytózy; • Zpracování RNA; • ukotvení mikrotubulů v organizačním centru mikrotubulů; • negativní regulace signální dráhy receptoru spojeného s G-proteinem aktivujícím fosfolipázu C; • negativní regulace aktivity fosfolipázy C.; • anatomická struktura morfogeneze; • intracelulární lokalizace mRNA; • minus-end-směrovaný transport organel podél mikrotubulů; • GO: virový proces 0022415; • sestava stresových granulí; • doprava; • regulace organizace mikrotubulárního cytoskeletu; • pozitivní regulace lokalizace proteinu do centrosomu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	636
	12121
	ENSG00000151746
	ENSMUSG00000003452
	Q96G01
	Q8BR07
NM_001003398; NM_001714; NM_001354186; NM_001354187; NM_001354188;
	NM_001354189; NM_001363603
	NM_001112796; NM_009753
NP_001003398; NP_001705; NP_001341115; NP_001341116; NP_001341117;
	NP_001341118; NP_001350532
	NP_001106267; NP_033883
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Bicaudal D nákladní adaptér 1 je protein že u lidí je kódován BICD1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Tento gen je jedním ze dvou lidských homologů Drosophila bicaudal-D. Podílí se na transportu membrány nezávislé na COPI z Golgiho aparátu do endoplazmatického retikula. Byly popsány dvě alternativní varianty sestřihu. Byly popsány další alternativní varianty sestřihu, které kódují různé proteinové izoformy, ale jejich úplná povaha nebyla stanovena.^[6]

Interakce

BICD1 bylo prokázáno komunikovat s RAB6A.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151746 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003452 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Baens M, Marynen P (listopad 1997). "Lidský homolog (BICD1) genu Drosophila bicaudal-D". Genomika. 45 (3): 601–6. doi:10.1006 / geno.1997.4971. PMID 9367685.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BICD1 bicaudal D homolog 1 (Drosophila)“.
^ Short B, Preisinger C, Schaletzky J, Kopajtich R, Barr FA (říjen 2002). „GTPáza Rab6 reguluje nábor komplexu dynaktinu na Golgiho membrány“. Aktuální biologie. 12 (20): 1792–5. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 01221-6. PMID 12401177. S2CID 14031165.
^ Matanis T, Akhmanova A, Wulf P, Del Nery E, Weide T, Stepanova T, Galjart N, Grosveld F, Goud B, De Zeeuw CI, Barnekow A, Hoogenraad CC (prosinec 2002). „Bicaudal-D reguluje transport Golgi-ER nezávislý na COPI náborem motorového komplexu dynein-dynaktin“. Přírodní buněčná biologie. 4 (12): 986–92. doi:10.1038 / ncb891. PMID 12447383. S2CID 7953140.

externí odkazy

Člověk BICD1 umístění genomu a BICD1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Barr FA, Short B (srpen 2003). "Golginy ve struktuře a dynamice Golgiho aparátu". Současný názor na buněčnou biologii. 15 (4): 405–13. doi:10.1016 / S0955-0674 (03) 00054-1. PMID 12892780. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Claussen M, Suter B (listopad 2005). „BicD-dependent localisation processes: from Drosophilia development to human cell biology“. Annals of Anatomy - Anatomischer Anzeiger. 187 (5–6): 539–53. doi:10.1016 / j.aanat.2005.07.004. PMID 16320833. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Baens M, Aerssens J, van Zand K, Van den Berghe H, Marynen P (září 1995). "Izolace a regionální přiřazení 12p cDNA lidského chromozomu". Genomika. 29 (1): 44–52. doi:10.1006 / geno.1995.1213. PMID 8530100. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Short B, Preisinger C, Schaletzky J, Kopajtich R, Barr FA (říjen 2002). „GTPáza Rab6 reguluje nábor komplexu dynaktinu na Golgiho membrány“. Aktuální biologie. 12 (20): 1792–5. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 01221-6. PMID 12401177. S2CID 14031165. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Matanis T, Akhmanova A, Wulf P, Del Nery E, Weide T, Stepanova T, Galjart N, Grosveld F, Goud B, De Zeeuw CI, Barnekow A, Hoogenraad CC (prosinec 2002). „Bicaudal-D reguluje transport Golgi-ER nezávislý na COPI náborem motorového komplexu dynein-dynaktin“. Přírodní buněčná biologie. 4 (12): 986–92. doi:10.1038 / ncb891. PMID 12447383. S2CID 7953140. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Tomsig JL, Snyder SL, Creutz CE (březen 2003). "Identifikace cílů pro vápníkovou signalizaci prostřednictvím kopinové rodiny proteinů. Charakterizace vazebného motivu kopin-vazba na kopin". The Journal of Biological Chemistry. 278 (12): 10048–54. doi:10,1074 / jbc.M212632200. PMID 12522145.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (leden 2006 ). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Výzkum genomu. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Fuchs E, Short B, Barr FA (2006). "Stanovení a vlastnosti interakce rab6 s komplexy dynein-dynaktin". Metody v enzymologii. 403: 607–18. doi:10.1016 / S0076-6879 (05) 03053-3. ISBN 9780121828080. PMID 16473624.
Moorhead AR, Rzomp KA, Scidmore MA (únor 2007). „Rab6 efektor Bicaudal D1 se biologicky specifickým způsobem spojuje s inkluzí Chlamydia trachomatis“. Infekce a imunita. 75 (2): 781–91. doi:10.1128 / IAI.01447-06. PMC 1828475. PMID 17101644.
Fumoto K, Hoogenraad CC, Kikuchi A (prosinec 2006). „GSK-3beta regulovaná interakce BICD s dyneinem se účastní ukotvení mikrotubulů v centrozomu“. Časopis EMBO. 25 (24): 5670–82. doi:10.1038 / sj.emboj.7601459. PMC 1698904. PMID 17139249. Zkontrolujte hodnoty data v: | rok = / | datum = nesoulad (Pomoc)
Wanschers BF, van de Vorstenbosch R, Schlager MA, Splinter D, Akhmanova A, Hoogenraad CC, Wieringa B, Fransen JA (říjen 2007). "Role pro interakci Rab6B Bicaudal-D1 v retrográdním transportu v neuronálních buňkách". Experimentální výzkum buněk. 313 (16): 3408–20. doi:10.1016 / j.yexcr.2007.05.032. PMID 17707369.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151746 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000003452 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9367685-5] Baens M, Marynen P (listopad 1997). "Lidský homolog (BICD1) genu Drosophila bicaudal-D". Genomika. 45 (3): 601–6. doi:10.1006 / geno.1997.4971. PMID 9367685.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: BICD1 bicaudal D homolog 1 (Drosophila)“.

[pmid12401177-7] Short B, Preisinger C, Schaletzky J, Kopajtich R, Barr FA (říjen 2002). „GTPáza Rab6 reguluje nábor komplexu dynaktinu na Golgiho membrány“. Aktuální biologie. 12 (20): 1792–5. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 01221-6. PMID 12401177. S2CID 14031165.

[pmid12447383-8] Matanis T, Akhmanova A, Wulf P, Del Nery E, Weide T, Stepanova T, Galjart N, Grosveld F, Goud B, De Zeeuw CI, Barnekow A, Hoogenraad CC (prosinec 2002). „Bicaudal-D reguluje transport Golgi-ER nezávislý na COPI náborem motorového komplexu dynein-dynaktin“. Přírodní buněčná biologie. 4 (12): 986–92. doi:10.1038 / ncb891. PMID 12447383. S2CID 7953140.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]