BDP1 - BDP1

BDP1
Identifikátory
Aliasy	BDP1, HSA238520, TAF3B1, TFC5, TFIIIB, TFIIIB150, TFIIIB90, TFNR, B dvojitý prime 1, podjednotka RNA polymerázy III transkripčního iniciačního faktoru IIIB, DFNB112
Externí ID	OMIM: 607012 MGI: 1347077 HomoloGene: 34582 Genové karty: BDP1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	71,567,820 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	100,104,070 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • Vazba transkripčního faktoru třídy TFIIIC; • aktivita transkripčního faktoru, vazba jádrové RNA polymerázy III;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • komplex transkripčního faktoru TFIIIB; • nukleoplazma;
Biologický proces	• regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy III; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA; • Sestava transkripčního preiniciačního komplexu RNA polymeráza III; • transkripce z promotoru RNA polymerázy III;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	55814
	544971
	ENSG00000274803; ENSG00000273873; ENSG00000145734
	ENSMUSG00000049658
	A6H8Y1; H7C5U4
	Q571C7
	NM_018429
	NM_001081061
	NP_060899
	NP_001074530
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Transkripční faktor TFIIIB složka B ″ homolog také známý jako TFIIIB150 je protein že u lidí je kódován BDP1 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

TFIIIB150 je podjednotka iniciačního komplexu transkripce TFIIIB, která rekrutuje RNA polymeráza III zacílit promotory za účelem zahájení transkripce. Kódovaný protein se lokalizuje do koncentrovaných agregátů v jádru a je vyžadován pro transkripci ze všech tří typů promotorů polymerázy III. Je fosforylován kasein kináza 2 v době mitóza, což má za následek jeho uvolnění z chromatin a potlačení transkripce polymerázy III.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000273873, ENSG00000145734 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000274803, ENSG00000273873, ENSG00000145734 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049658 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (únor 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.
^ Schramm L, Pendergrast PS, Sun Y, Hernandez N (listopad 2000). „Různé lidské aktivity TFIIIB řídí transkripci RNA polymerázy III z promotorů obsahujících TATA a bez TATA“. Genes Dev. 14 (20): 2650–63. doi:10,1101 / gad.836400. PMC 316990. PMID 11040218.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BDP1 B double prime 1, podjednotka RNA polymerázy III transkripčního iniciačního faktoru IIIB“.

Další čtení

Chu WM, Wang Z, Roeder RG, Schmid CW (1997). „RNA polymeráza III transkripce potlačena Rb prostřednictvím svých interakcí s TFIIIB a TFIIIC2“. J. Biol. Chem. 272 (23): 14755–61. doi:10.1074 / jbc.272.23.14755. PMID 9169441.
Wang Z, Roeder RG (1997). „Tři lidské podjednotky specifické pro RNA polymerázu III tvoří subkomplex se selektivní funkcí při specifické iniciaci transkripce“. Genes Dev. 11 (10): 1315–26. doi:10.1101 / gad.11.10.1315. PMID 9171375.
Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (5): 337–45. doi:10.1093 / dnares / 6.5.337. PMID 10574462.
Kelter AR, Herchenbach J, Wirth B (2001). „Jaderný regulátor podobný transkripčnímu faktoru (TFNR) obsahuje nový motiv 55 aminokyselin opakovaný devětkrát a úzce se mapuje na SMN1“. Genomika. 70 (3): 315–26. doi:10,1006 / geno.2000.6396. PMID 11161782.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Hu P, Wu S, Hernandez N (2003). „Minimální transkripční systém RNA polymerázy III z lidských buněk odhaluje pozitivní a negativní regulační role pro CK2.“ Mol. Buňka. 12 (3): 699–709. doi:10.1016 / j.molcel.2003.08.011. PMID 14527415.
Fairley JA, Scott PH, White RJ (2003). „TFIIIB je fosforylován, narušen a selektivně uvolňován z promotorů tRNA během mitózy in vivo“. EMBO J.. 22 (21): 5841–50. doi:10.1093 / emboj / cdg544. PMC 275401. PMID 14592981.
Weser S, Gruber C, Hafner HM a kol. (2004). „Jaderný regulátor podobný transkripčnímu faktoru (TF), 250 kDa forma Homo sapiens TFIIIB“, je nezbytnou součástí lidské aktivity TFIIIC1. “. J. Biol. Chem. 279 (26): 27022–9. doi:10,1074 / jbc.M312790200. PMID 15096501.
Suzuki Y, Yamashita R, Shirota M a kol. (2004). „Porovnání sekvencí lidských a myších genů odhaluje homologní blokovou strukturu v promotorových oblastech“. Genome Res. 14 (9): 1711–8. doi:10,1101 / gr. 2435604. PMC 515316. PMID 15342556.
Hu P, Samudre K, Wu S a kol. (2004). „Fosforylace CK2 Bdp1 provádí transkripční represi specifickou pro buněčný cyklus RNA polymerázy III“. Mol. Buňka. 16 (1): 81–92. doi:10.1016 / j.molcel.2004.09.008. PMID 15469824.
Schoenen F, Wirth B (2006). "Protein se zinkovým prstem ZNF297B interaguje s BDP1, podjednotkou TFIIIB". Biol. Chem. 387 (3): 277–84. doi:10.1515 / BC.2006.037. PMID 16542149. S2CID 28560128.
Johnson SS, Zhang C, Fromm J a kol. (2007). „Savčí Maf1 je negativní regulátor transkripce všemi třemi nukleárními RNA polymerázami“. Mol. Buňka. 26 (3): 367–79. doi:10.1016 / j.molcel.2007.03.021. PMID 17499043.

externí odkazy

FactorBook BDP1
Člověk BDP1 umístění genomu a BDP1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000273873, ENSG00000145734 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000274803, ENSG00000273873, ENSG00000145734 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000049658 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11214970-5] Nagase T, Kikuno R, Hattori A, Kondo Y, Okumura K, Ohara O (únor 2001). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XIX. Kompletní sekvence 100 nových klonů cDNA z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (6): 347–55. doi:10.1093 / dnares / 7.6.347. PMID 11214970.

[pmid11040218-6] Schramm L, Pendergrast PS, Sun Y, Hernandez N (listopad 2000). „Různé lidské aktivity TFIIIB řídí transkripci RNA polymerázy III z promotorů obsahujících TATA a bez TATA“. Genes Dev. 14 (20): 2650–63. doi:10,1101 / gad.836400. PMC 316990. PMID 11040218.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: BDP1 B double prime 1, podjednotka RNA polymerázy III transkripčního iniciačního faktoru IIIB“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]