B4GALT5 - B4GALT5

B4GALT5
Identifikátory
Aliasy	B4GALT5, B4Gal-T5, BETA4-GALT-IV, beta4Gal-T5, beta4GalT-V, gt-V, beta-1,4-galaktosyltransferáza 5
Externí ID	OMIM: 604016 MGI: 1927169 HomoloGene: 3507 Genové karty: B4GALT5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 20 (lidský)
Konec	49,713,878 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	167,349,183 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • aktivita transferázy; • aktivita galaktosyltransferázy; • vazba kovových iontů; • aktivita beta-N-acetylglukosaminylglykopeptidu beta-1,4-galaktosyltransferázy; • Aktivita N-acetyllaktosamin syntázy; • UDP-galaktóza: aktivita glukosylceramidu beta-1,4-galaktosyltransferázy;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • Golgiho cisterna membrána; • Golgiho membrána; • Golgiho aparát; • membrána;
Biologický proces	• glykosylace proteinů; • proces biosyntézy keratansulfátu; • Zpracování O-glykanu; • metabolický proces sacharidů; • biosyntetický proces poly-N-acetyllaktosaminu; • gangliozidový biosyntetický proces prostřednictvím laktosylceramidu; • axonogeneze neuronů centrálního nervového systému; • myelinace centrálního nervového systému; • regulace stability proteinu; • pozitivní regulace embryonálního vývoje; • zrání neuronů; • metabolismus lipidů; • sfingolipidový metabolický proces;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9334
	56336
	ENSG00000158470
	ENSMUSG00000017929
	O43286
	Q9JMK0
	NM_004776
	NM_019835
	NP_004767
	NP_062809
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Beta-1,4-galaktosyltransferáza 5 je enzym že u lidí je kódován B4GALT5 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen je jedním ze sedmi genů beta-1,4-galaktosyltransferázy (beta4GalT). Kódují glykoproteiny vázané na membránu typu II, které mají výlučnou specificitu pro dárcovský substrát UDP-galaktóza; všechny přenášejí galaktózu ve vazbě beta 1,4 na podobné akceptorové cukry: GlcNAc, Glc a Xyl. Každý beta4GalT má odlišnou funkci v biosyntéze různých glykokonjugátů a sacharidových struktur. Jako membránové proteiny typu II mají N-koncovou hydrofobní signální sekvenci, která směruje protein na Golgiho aparát a který poté zůstává neštěpený, aby fungoval jako transmembránová kotva. Podle podobnosti sekvence tvoří beta4GalTs čtyři skupiny: beta4GalT1 a beta4GalT2, beta4GalT3 a beta4GalT4, beta4GalT5 a beta4GalT6 a beta4GalT7. Funkce enzymu kódovaného tímto genem není jasná. Tento gen byl dříve označen jako B4GALT4, ale byl přejmenován na B4GALT5. V literatuře se také označuje jako beta4GalT2.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158470 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017929 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Lo NW, Shaper JH, Pevsner J, Shaper NL (srpen 1998). „Rozšiřující se rodina genů beta 4-galaktosyltransferázy: zprávy z databází“. Glykobiologie. 8 (5): 517–26. doi:10.1093 / glycob / 8.5.517. PMID 9597550.
^ Sato T, Furukawa K, Bakker H, Van den Eijnden DH, Van Die I (únor 1998). „Molekulární klonování lidské cDNA kódující β-1,4-galaktosyltransferázu s 37% identitou se savčí UDP-Gal: GlcNAc β-1,4-galaktosyltransferáza“. Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (2): 472–7. doi:10.1073 / pnas.95.2.472. PMC 18444. PMID 9435216.
^ ^A ^b „Entrez Gene: B4GALT5 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,4- galaktosyltransferáza, polypeptid 5“.

externí odkazy

Člověk B4GALT5 umístění genomu a B4GALT5 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Amado M, Almeida R, Schwientek T, Clausen H (2000). "Identifikace a charakterizace velkých genových rodin galaktosyltransferáz: galaktosyltransferázy pro všechny funkce". Biochim. Biophys. Acta. 1473 (1): 35–53. doi:10.1016 / S0304-4165 (99) 00168-3. PMID 10580128.
Sato T, Aoki N, Matsuda T, Furukawa K (1998). „Diferenciální účinek alfa-laktalbuminu na aktivity beta-1,4-galaktosyltransferázy IV“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 244 (3): 637–41. doi:10.1006 / bbrc.1998.8327. PMID 9535717.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Jia L, Young MF, Powell J a kol. (2002). "Profil genové exprese stromálních buněk lidské kostní dřeně: vysoce výkonná exprimovaná sekvenční analýza sekvenční značky". Genomika. 79 (1): 7–17. doi:10.1006 / geno.2001.6683. PMID 11827452.
Xu S, Zhang S, Chen C a kol. (2003). „Nadměrná exprese beta-1,4-galaktosyltransferázy V zvyšuje růst buněčné linie astrocytomu“. J. Exp. Clin. Cancer Res. 21 (3): 409–14. PMID 12385586.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Sato T, Furukawa K (2004). „Transkripční regulace lidského genu beta-1,4-galaktosyltransferázy V v rakovinných buňkách: základní úloha transkripčního faktoru Sp1“. J. Biol. Chem. 279 (38): 39574–83. doi:10,1074 / jbc.M405805200. PMID 15263012.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Jiang J, Chen X, Shen J a kol. (2006). „Beta1,4-galaktosyltransferáza V funguje jako pozitivní regulátor růstu v gliomu“. J. Biol. Chem. 281 (14): 9482–9. doi:10,1074 / jbc.M504489200. PMID 16461357.
Sato T, Furukawa K (2007). „Sekvenční působení Ets-1 a Sp1 při aktivaci lidského genu beta-1,4-galaktosyltransferázy V podílejícího se na abnormální glykosylaci charakteristické pro rakovinné buňky“. J. Biol. Chem. 282 (38): 27702–12. doi:10,1074 / jbc.M611862200. PMID 17656364.
Kitayama K, Hayashida Y, Nishida K, Akama TO (2007). „Enzymy odpovědné za syntézu glykosaminoglykanů rohovkového keratansulfátu“. J. Biol. Chem. 282 (41): 30085–96. doi:10,1074 / jbc.M703695200. PMID 17690104.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000158470 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000017929 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9597550-5] Lo NW, Shaper JH, Pevsner J, Shaper NL (srpen 1998). „Rozšiřující se rodina genů beta 4-galaktosyltransferázy: zprávy z databází“. Glykobiologie. 8 (5): 517–26. doi:10.1093 / glycob / 8.5.517. PMID 9597550.

[pmid9435216-6] Sato T, Furukawa K, Bakker H, Van den Eijnden DH, Van Die I (únor 1998). „Molekulární klonování lidské cDNA kódující β-1,4-galaktosyltransferázu s 37% identitou se savčí UDP-Gal: GlcNAc β-1,4-galaktosyltransferáza“. Proc Natl Acad Sci U S A. 95 (2): 472–7. doi:10.1073 / pnas.95.2.472. PMC 18444. PMID 9435216.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: B4GALT5 UDP-Gal: betaGlcNAc beta 1,4- galaktosyltransferáza, polypeptid 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]