Arrowsmith System - Arrowsmith System

Arrowsmith byl Objev založený na literatuře systém postavený Don R. Swanson pomocí konceptu Neobjevené veřejné znalosti. Nazval jej Arrowsmith: „Intelektuální dobrodružství“[1]

„Představte si, že kousky skládačky jsou nezávisle navrženy a vytvořeny a že po načtení a sestavení odhalí vzor - neprojevený, nezamýšlený a nikdy předtím neviděný, přesto vzor, ​​který vzbuzuje zájem a vybízí k interpretaci. Tvrdím, že nezávisle vytvořené části znalostí mohou skrývat neviditelný, neznámý a nezamýšlený vzorec. A tak svět zaznamenaných znalostí může přinést skutečně nové objevy. “

— Don R. Swanson, Swanson DR: Neobjevené veřejné povědomí. Knihovna Quarterly 1986, 56: 103-118.[2]

Úvod

Nástroj má a Vyhledávání režim, který pomáhá uživatel při hledání předmětů nebo konceptů, které mohou být společné pro dvě odlišné sady článků. Dalším kontextem pro použití režimu vyhledávání je situace, kdy uživatel chce najít informace, které jsou přítomny v jednom poli a které by mohly být relevantní pro jiné pole dotazu. Uživatel bude veden dvěma PubMed vyhledávání za účelem získání biomedicínských článků z MEDLINE databáze: první vyhledávání definuje „literaturu A“ a druhé definuje „literaturu C.“ The program poté vygeneruje „B-seznam“ slov a frází nalezených v názvech obou sad literatury.

Zobrazí se seznam B. zařadil podle relevance a lze je omezit na určité sémantický kategorie (např. anatomický regiony nebo poruchy nebo léky ). U každého sledovaného období B lze zobrazit tituly obsahující A a B („tituly AB“) vedle titulů obsahujících B a C („BC tituly“). Tímto způsobem lze snadno posoudit, zda se zdá, že existuje biologicky významná shodnost nebo vztah mezi těmito dvěma soubory článků.[3]

Dějiny

Swanson hledal databáze MEDLINE, když našel a vlákno o Raynaudova nemoc a dietní rybí tuk, což ho vedlo k otázce, zda má rybí olej hodnotu při léčbě Raynaudovy choroby. Tento hypotéza se později ukázalo jako klinicky pravdivé. Potom Swanson předpokládal souvislost mezi migréna a hořčík nedostatek, u kterého se také klinicky prokázalo, že existuje.

Tyto informace zaujaly Swansona a Neila Smalheisera z University of Illinois v Chicagu vyvinul Arrowsmith, kousek software pro identifikaci spojení mezi dvěma články Medline. Pojmenováno po roce 1925 Román Sinclaira Lewise, bylo zaměřeno na vybudování systematické a výpočetní metody hledání možných vazeb mezi články.[1]

Dopad

Model Arrowsmith se ukázal jako vlivný a přístup, který vyvinuli Swanson a Smalheiser, byl upraven tak, aby studoval korelace z geny s nemoci a najít možná nová využití pro léky.[1]

Související projekty

  • Autorita: identifikujte články MEDLINE napsané konkrétním jednotlivcem
  • Anne O'Tate: shrnutí, rozbalení a procházení výsledků dotazu PubMed
  • WETLAB: an otevřený zdroj elektronický laboratorní notebook
  • ADAM: další databáze zkratek v MEDLINE[3]

Viz také

Reference

  1. ^ A b C „Don R. Swanson, průkopník informační vědy, 1924–2012 | UChicago News“.
  2. ^ Smalheiser, Neil R; Torvik, Vetle I; Bischoff-Grethe, Amanda; Burhans, Lauren B; Gabriel, Michael; Homayouni, Ramin; Kashef, Alireza; Martone, Maryann E; Perkins, Guy A; Cena, Diana L; Talk, Andrew C; West, Ruth (1. ledna 2006). „Spolupráce na vývoji dvouuzlového vyhledávacího rozhraní Arrowsmith určeného pro laboratorní vyšetřovatele“. Journal of Biomedical Discovery and Collaboration. 1 (1): 8. doi:10.1186/1747-5333-1-8. PMC  1559644. PMID  16817965.
  3. ^ A b „ArrowSmith“.