Motiv anti-hemB RNA - Anti-hemB RNA motif
| anti-hemB | |
|---|---|
 Shoda sekundární struktura a zachování sekvence Burkholderia RNA 7 (anti-hemB) | |
| Identifikátory | |
| Symbol | anti-hemB |
| Rfam | RF02837 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen; sRNA |
| JÍT | GO termín musí začínat GO:,GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000370 |
| PDB struktur | PDBe |
The anti-hemB RNA motiv je konzervovaný RNA struktura, která byla nalezena ve všech známých bakterie v rodu Burkholderia a v mnoha dalších betaproteobakterie.[1] Motiv anti-hemB RNA se skládá primárně ze dvou kmenové smyčky, následovaný předpovědí rho nezávislé ukončení transkripce kmenová smyčka. Protože anti-hemB RNA se obecně nenacházejí v a 5 'UTR, předpokládá se, že jsou RNA nekódující RNA. Z terminátorové smyčky vyplývá, že anti-hemB RNA jsou transkribovány jako nezávislé molekuly.
Název „anti-hemB“ má odlišit motiv od jeho reverzního doplňku, kterému se říká motiv „hemB“, což je motiv, který je často ve zjevných 5 'UTR lemB geny. Bylo považováno za nejednoznačné, která z těchto orientací je správná, protože oba směry vykazují kovariace (viz predikce sekundární struktury ) a oba se skládají do věrohodných struktur RNA. Avšak anti-hemB byl posouzen jako pravděpodobnější orientace, protože měl méně A-C základní páry, které nepřispívají ke stabilitě RNA. V opačném doplňku se pár A-C stává stabilním párem G-U wobble.
Reference
- ^ Weinberg Z, Barrick JE, Yao Z a kol. (2007). „Identifikace 22 kandidátských strukturovaných RNA v bakteriích pomocí komparativního genomického potrubí CMfinder“. Nucleic Acids Res. 35 (14): 4809–4819. doi:10.1093 / nar / gkm487. PMC 1950547. PMID 17621584.
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |