AlleleID - AlleleID
| Vývojáři | PREMIER Biosoft |
|---|---|
| Stabilní uvolnění | 7.80 / 29. června 2013 |
| Operační systém | Windows, Macintosh |
| Typ | Bioinformatika |
| Licence | komerční |
| webová stránka | http://www.premierbiosoft.com |
AlleleID vzory oliga pro diferenciaci kmenů a testy specifické pro taxony. To pomáhá při identifikaci bakterií, detekci patogenů a identifikaci druhů. Tento software je navržen pro provoz v operačních systémech Windows a Macintosh.
AlleleID zarovná sekvence tak, aby lokalizoval rozdíly v DNA a našel konzervované oblasti, a poté navrhne oliga pro amplifikaci a detekci pouze druhů nebo kmenů, které jsou předmětem zájmu ze směsi. Platformy, pro které AlleleID zahrnuje podporu, jsou:
- Kvantitativní PCR: Navrhuje testy qPCR specifické pro druhy a taxony
- Microarrays: Navrhuje mikroarray specifické pro druhy a taxony
- xMAP: Navrhuje oliga pro testy přímé hybridizace (DHA) a ASPE
- MLPA: Navrhuje sondy pro detekci počtu kopií a SNP studie