Alkb homolog 3, alfa-ketoglutarátem závislá dioxygenáza - Alkb homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase - Wikipedia

ALKBH3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2IUW
Identifikátory
Aliasy	ALKBH3, ABH3, DEPC-1, DEPC1, PCA1, hABH3, alkB homolog 3, alfa-ketoglutarát-závislá dioxygenáza, alkB homolog 3, alfa-ketoglutarát-závislá dioxygenáza, alkB homolog 3, alfa-ketoglutarát-závislá dioxygenáza
Externí ID	OMIM: 610603 MGI: 1916363 HomoloGene: 16393 Genové karty: ALKBH3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	43,920,274 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 2 (myš)
Konec	94,010,807 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na kyselinu L-askorbovou; • aktivita dioxygenázy; • vazba kovových iontů; • Aktivita DNA-N1-methyladenin dioxygenázy; • aktivita oxidoreduktázy; • vazba železného železa; • Aktivita RNA N1-methyladenosindioxygenázy; • aktivita oxidoreduktázy, působící na spárované dárce, s inkorporací nebo redukcí molekulárního kyslíku, 2-oxoglutarát jako jeden donor, a inkorporace jednoho atomu každého kyslíku do obou dárců; • aktivita cytosinu C-5 DNA demetylázy;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • mitochondrie; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• oxidačně-redukční proces; • buněčná proliferace; • buněčná odpověď na stimul poškození DNA; • Dealkylace DNA zapojená do opravy DNA; • oxidační demetylace jednovláknové DNA; • oxidační demetylace jednovláknové RNA; • Oprava DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	221120
	69113
	ENSG00000166199
	ENSMUSG00000040174
	Q96Q83
	Q8K1E6
	NM_139178
	NM_026944
	NP_631917
	NP_081220
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

AlkB homolog 3, alfa-ketoglutarátem závislá dioxygenáza je protein že u lidí je kódován ALKBH3 gen.^[5]

Funkce

Protein AlkB Escherichia coli chrání před cytotoxicitou metylačních činidel opravou specifických lézí DNA generovaných v jednořetězcové DNA. ALKBH2 (MIM 610602) a ALKBH3 jsou E. coli AlkB homology, které katalyzují odstranění 1-methyladeninu a 3-methylcytosinu (Duncan et al., 2002 [PubMed 12486230]).

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166199 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040174 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: AlkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase“. Citováno 2017-03-04.

Další čtení

Sundheim O, Vågbø CB, Bjørås M, Sousa MM, Talstad V, Aas PA, Drabløs F, Krokan HE, Tainer JA, Slupphaug G (2006). „Lidská struktura ABH3 a klíčové zbytky pro oxidativní demetylaci pro zvrácení poškození DNA / RNA“. EMBO J.. 25 (14): 3389–97. doi:10.1038 / sj.emboj.7601219. PMC 1523172. PMID 16858410.
Liu BQ, Wu YD, Li PH, Wei JX, Zhang T, Liu RL (2007). „Antigen pro rakovinu prostaty jako potenciální nový marker pro rakovinu prostaty“. Asian J. Androl. 9 (6): 821–6. doi:10.1111 / j.1745-7262.2007.00279.x. PMID 17968469.
Monsen VT, Sundheim O, Aas PA, Westbye MP, Sousa MM, Slupphaug G, Krokan HE (2010). „Rozdílné ß-vlásenky určují rozpoznávání dvouřetězcových a jednovláknových substrátů u lidských AlkB-homologů 2 a 3“. Nucleic Acids Res. 38 (19): 6447–55. doi:10.1093 / nar / gkq518. PMC 2965238. PMID 20525795.
Chen B, Liu H, Sun X, Yang CG (2010). „Mechanický pohled na rozpoznávání jednořetězcových a dvouřetězcových DNA substrátů ABH2 a ABH3“. Mol Biosyst. 6 (11): 2143–9. doi:10.1039 / c005148a. PMID 20714506.
Malki K, Uher R, Paya-Cano J, Binder E, Rietschel M, Zobel A, Mors O, Hauser J, Henigsberg N, Jerman B, Souery D, Placentino A, Ng MY, Cohen-Woods S, Sluyter F, Farmář A, Aitchison KJ, Craig IW, Lewis CM, McGuffin P, Schalkwyk LC (2011). „Konvergentní důkazy u zvířat a lidí naznačují roli genu PPM1A v reakci na antidepresiva“. Biol. Psychiatrie. 69 (4): 360–5. doi:10.1016 / j.biopsych.2010.08.011. PMID 20970119. S2CID 41571515.
Tasaki M, Shimada K, Kimura H, Tsujikawa K, Konishi N (2011). „ALKBH3, lidský homolog AlkB, přispívá k přežití buněk u lidské nemalobuněčné rakoviny plic“. Br. J. Cancer. 104 (4): 700–6. doi:10.1038 / sj.bjc.6606012. PMC 3049579. PMID 21285982.
Dango S, Mosammaparast N, Sowa ME, Xiong LJ, Wu F, Park K, Rubin M, Gygi S, Harper JW, Shi Y (2011). „Odvíjení DNA pomocí ASCC3 helikázy je spojeno s ALKBH3-dependentní DNA alkylační opravou a proliferací rakovinných buněk“. Mol. Buňka. 44 (3): 373–84. doi:10.1016 / j.molcel.2011.08.039. PMC 3258846. PMID 22055184.
Koike K, Ueda Y, Hase H, Kitae K, Fusamae Y, Masai S, Inagaki T, Saigo Y, Hirasawa S, Nakajima K, Ohshio I, Makino Y, Konishi N, Yamamoto H, Tsujikawa K (2012). „protinádorový účinek knockdownu AlkB homolog 3 v hormonálně nezávislých buňkách rakoviny prostaty“. Curr Cancer Drug Targets. 12 (7): 847–56. doi:10.2174/156800912802429283. PMID 22515525.
Yamato I, Sho M, Shimada K, Hotta K, Ueda Y, Yasuda S, Shigi N, Konishi N, Tsujikawa K, Nakajima Y (2012). „PCA-1 / ALKBH3 přispívá k rakovině pankreatu podporou apoptotické rezistence a angiogeneze“. Cancer Res. 72 (18): 4829–39. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-12-0328. PMID 22826605.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000166199 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040174 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: AlkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase“. Citováno 2017-03-04.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]