Aled Edwards - Aled Edwards

Aled Edwards (narozen 1. června 1962) je zakladatel a generální ředitel společnosti Konsorcium pro strukturální genomiku charitativní partnerství veřejného a soukromého sektoru. Je profesorem lékařské genetiky a lékařské biofyziky na University of Toronto, Hostující profesor chemické biologie na University of Oxford a mimořádným profesorem v McGill University.

Časný život

Narozen v Holyhead, Wales, Edwards se přestěhoval do Kanady v roce 1965 se svými rodiči Undeg a Iwan Edwards, sborový dirigent, který získal cenu Řád Kanady v roce 1995 za své příspěvky do kanadské hudby.[1]

Vzdělávání

Edwards si vysloužil své bakalářský titul (1983) a jeho Ph.D. (1988) v biochemii z McGill University pod dohledem Petera Brauna. Postdoktorandské studium absolvoval na Stanfordské univerzitě v laboratoři Rogera Kornberga, kde nejprve krystalizoval RNA polymerázu II,[2][3][4][5] struktura, za kterou byla Kornbergovi v roce 2006 udělena Nobelova cena za chemii.

Výzkumné příspěvky

Od roku 1992 do roku 1997 působil jako profesor na McMaster University, Edwards se začal zajímat o vývoj metod strukturní biologie a byl mezi prvními, kdo je použil hmotnostní spektrometrie identifikovat oblasti proteinů náchylných ke krystalizaci.[6] Tuto techniku ​​použil k usnadnění krystalografie klíčových proteinů zapojených do replikace a opravy DNA[7][8][9] než se začne zajímat o použití této a dalších metod strukturní biologie v proteomovém měřítku.

V roce 1997, nyní na univerzitě v Torontu, Edwards, spolu se svým kolegou Cheryl Arrowsmith, spolupracoval na zahájení jednoho z prvních projektů strukturální genomiky a brzy publikoval jeden z článků, které definovaly toto nové pole.[10] Jako centrální hráč v iniciativě Protein Structure Initiative přispěl jejich tým v Torontu k více než tisíci nových struktur mikrobiálních proteinů v příštím desetiletí a vyvinul nové krystalizační metody,[11][12] a použili strukturální metody k de-orfanizaci několika jaderných receptorů[13][14] a studovat transport iontů přes membrány.[15]

Od roku 2019 přispěl Edwards do Protein Data Bank více datovými soubory než kterýkoli jiný vědec.[16]

Obchodní aktivity

Na konci 90. let Edwards spoluzaložil a působil jako generální ředitel společností Borealis Biosciences a Chalon Biotech, které spojil a vytvořil Affinium Pharmaceuticals, společnost se sídlem v Torontu. Affinium se vyvinulo afabicin, nové úzkopásmové antibiotikum, které je nyní v klinickém vývoji na DebioPharm. Z jeho výzkumných programů bylo vyčleněno několik dalších společností, včetně Harbinger Biotechnology and Engineering, který získal Epifyt3 a 1DegreeBio, který byl získané podle LabX Media Group.  

V poslední době založil Edwards M4K Pharma, společnost, která vyvíjí lék pronikající mozkem zaměřený na ALK2 kinázu, s cílem léčit děti nevyléčitelnými difúzní-vnitřní pontinový gliom (DIPG). Nový obchodní model otevřené vědy[17] vyvinutá společností M4K Pharma umožňuje průběžně zveřejňovat její vědu a cenově dostupný jakýkoli schválený lék. Edwards je členem správní rady Agora Open Science Trust.

Otevřená věda a vědecká politika

Otevřená věda

Edwards je považován za jednoho z průkopníků otevřené vědy,[18] zejména pokud jde o biomedicínu a objevování drog. Od roku 2003 byly všechny strukturní informace o lidských proteinech odvozené z SGC zveřejněny, před zveřejněním a bez omezení použití. V roce 2007 vytvořil společně s Richardem Goldem principy otevřené vědy SGC, podle nichž se SGC stala první organizací pro biomedicínský výzkum, která přijala principy otevřené vědy, které vyžadovaly sdílení a vyvarovaly se patentování jakékoli činnosti, včetně nové chemie. V roce 2016 Edwards stál v čele Otevřete laboratorní notebook iniciativa, která nyní zahrnuje více než 20 vědců, kteří sdílejí své experimenty, jak jsou prováděny, stejně jako spolupracovali s Guyem Rouleauem na Montrealský neurologický institut (Neuro) k vytvoření konceptu otevřeného výzkumného ústavu. Tato spolupráce vedla k založení Tanenbaum Open Science Institute,[19] a na širší institucionální závazek The Neuro k otevřené vědě. V roce 2017 Edwards a kolegové vytvořili koncept otevřeného mechanismu důvěry ke sdílení výzkumných činidel,[20] a SGC používá tento mechanismus od roku. A konečně v roce 2018 Edwards, Max Morgan a Owen Roberts uvedli na trh první světovou společnost zabývající se objevováním léčiv M4K (Meds for Kids) Pharma a vyvinuli obchodní model, který je v souladu s otevřenou vědou a dostupnými cenami. V roce 2019 uvedli Morgan a Edwards M4ND Pharma na řešení neurologických onemocnění pomocí otevřených přístupů k objevování léků. Za svou vedoucí roli v propagaci objevování drog s otevřeným přístupem byl Edwards v roce 2015 jmenován vyšším členem Ashoka.[21]

Vědecká a inovační politika

U 10. výročí zveřejnění konceptu sekvence lidského genomu byli Edwards a kolegové požádáni o jejich perspektivu. Jejich papír „Roads Not Takeen“,[22] který kvantifikoval „nedostatečně prozkoumané“ části lidského genomu, vedl k řadě iniciativ financování, včetně iniciativy Illuminating the Druggable Genome[23] na NIH a předznamenal řadu studií, které zkoumají nezamýšlené důsledky systému vzájemného hodnocení.[24]

Edwards je zastáncem reprodukovatelnosti vědy a zaměřuje značnou pozornost na kvalitu výzkumných činidel[25] a potřeba transparentních norem.

Edwards také přispěl k vědecké komunikaci; působil jako vědecký poradce pro televizní seriál oceněný Gemini ReGenesis.

Osobní

Edwards je ženatý s Elizabeth Edwardsovou od roku 1985 a mají tři děti a jedno vnouče. Elizabeth je ředitelkou společnosti BioZone a profesorem chemického inženýrství a aplikované chemie na University of Toronto a mimo jiné držitelkou kanadské ceny Killam za inženýrství za rok 2016. Je dcerou Leonharda a Jeanne Wolfe, která byla v roce 2009 vyznamenána Řádem Kanady za příspěvky do kanadského plánování.[26] Aledův bratr, Owain Edwards, je entomolog v CSIRO v Austrálii.

Reference

  1. ^ "Řád Kanady". archive.gg.ca. Citováno 2019-07-12.
  2. ^ Edwards, A. M .; Darst, S. A .; Feaver, W. J .; Thompson, N.E .; Burgess, R. R .; Kornberg, R. D. (březen 1990). „Čištění a krystalizace lipidové vrstvy kvasinkové RNA polymerázy II“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 87 (6): 2122–2126. Bibcode:1990PNAS ... 87.2122E. doi:10.1073 / pnas.87.6.2122. ISSN  0027-8424. PMC  53638. PMID  2179949.
  3. ^ Darst, S. A .; Edwards, A. M .; Kubalek, E. W .; Kornberg, R. D. (1991-07-12). "Trojrozměrná struktura kvasinkové RNA polymerázy II při rozlišení 16 A". Buňka. 66 (1): 121–128. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90144-n. ISSN  0092-8674. PMID  2070414.
  4. ^ Darst, S. A .; Kubalek, E. W .; Edwards, A. M .; Kornberg, R. D. (05.09.1991). „Dvojrozměrná a epitaxní krystalizace mutantní formy kvasinkové RNA polymerázy II“. Journal of Molecular Biology. 221 (1): 347–357. doi:10.1016 / 0022-2836 (91) 80223-h. ISSN  0022-2836. PMID  1920413.
  5. ^ Cramer, P .; Bushnell, D. A .; Fu, J .; Gnatt, A. L .; Maier-Davis, B .; Thompson, N.E .; Burgess, R. R .; Edwards, A. M .; David, P. R. (2000-04-28). "Architektura RNA polymerázy II a důsledky pro transkripční mechanismus". Věda. 288 (5466): 640–649. Bibcode:2000Sci ... 288..640C. doi:10.1126 / science.288.5466.640. hdl:11858 / 00-001M-0000-0015-872F-3. ISSN  0036-8075. PMID  10784442.
  6. ^ Barwell, J. A .; Bochkarev, A .; Pfuetzner, R. A .; Tong, H .; Yang, D. S .; Frappier, L .; Edwards, A. M. (01.09.1995). „Nadměrná exprese, čištění a krystalizace vazebných a dimerizačních domén DNA jaderného antigenu viru Epstein-Barr 1“. The Journal of Biological Chemistry. 270 (35): 20556–20559. doi:10.1074 / jbc.270.35.20556. ISSN  0021-9258. PMID  7657632.
  7. ^ Bochkarev, A .; Barwell, J. A .; Pfuetzner, R. A .; Furey, W .; Edwards, A. M .; Frappier, L. (06.10.1995). „Krystalová struktura domény vázající DNA proteinu EBNA 1 vázajícího původ viru Epstein-Barrové“. Buňka. 83 (1): 39–46. doi:10.1016/0092-8674(95)90232-5. ISSN  0092-8674. PMID  7553871.
  8. ^ Bochkarev, A .; Barwell, J. A .; Pfuetzner, R. A .; Bochkareva, E .; Frappier, L .; Edwards, A. M. (08.03.1996). „Krystalová struktura vazebné domény DNA proteinu vázajícího původ viru Epstein-Barrové, EBNA1, vázaného na DNA“. Buňka. 84 (5): 791–800. doi:10.1016 / s0092-8674 (00) 81056-9. ISSN  0092-8674. PMID  8625416.
  9. ^ Bochkarev, A .; Pfuetzner, R. A .; Edwards, A. M .; Frappier, L. (01.01.1997). "Struktura jednořetězcové domény vázající DNA replikačního proteinu A navázaného na DNA". Příroda. 385 (6612): 176–181. Bibcode:1997 Natur.385..176B. doi:10.1038 / 385176a0. ISSN  0028-0836. PMID  8990123.
  10. ^ Christendat, D .; Yee, A .; Dharamsi, A .; Kluger, Y .; Savchenko, A .; Cort, J. R .; Booth, V .; Mackereth, C. D .; Saridakis, V. (říjen 2000). "Strukturní proteomika archeona". Přírodní strukturní biologie. 7 (10): 903–909. doi:10.1038/82823. ISSN  1072-8368. PMID  11017201.
  11. ^ Vedadi, Masoud; Niesen, Frank H .; Allali-Hassani, Abdellah; Fedorov, Oleg Y .; Finerty, Patrick J .; Wasney, Gregory A .; Yeung, Ron; Arrowsmith, Cheryl; Ball, Linda J. (2006-10-24). „Chemické screeningové metody k identifikaci ligandů, které podporují stabilitu proteinu, krystalizaci proteinu a stanovení struktury“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 103 (43): 15835–15840. Bibcode:2006PNAS..10315835V. doi:10.1073 / pnas.0605224103. ISSN  0027-8424. PMC  1595307. PMID  17035505.
  12. ^ Dong, Aiping; Xu, Xiaohui; Edwards, Aled M .; Středozápadní centrum pro strukturní genomiku; Konsorcium pro strukturní genomiku; Chang, Changsoo; Chruszcz, Maksymilian; Manžeta, Marianne; Cymborowski, Marcin (prosinec 2007). „Proteolýza in situ pro krystalizaci proteinů a stanovení struktury“. Přírodní metody. 4 (12): 1019–1021. doi:10.1038 / nmeth1118. ISSN  1548-7105. PMC  3366506. PMID  17982461.
  13. ^ Horner, Michael A .; Pardee, Keith; Liu, Suya; King-Jones, Kirst; Lajoie, Gilles; Edwards, Aled; Krause, Henry M .; Thummel, Carl S. (01.12.2009). „Jaderný receptor Drosophila DHR96 váže cholesterol a reguluje homeostázu cholesterolu“. Geny a vývoj. 23 (23): 2711–2716. doi:10.1101 / gad.1833609. ISSN  1549-5477. PMC  2788327. PMID  19952106.
  14. ^ Reinking, Jeff; Lam, Mandy M. S .; Pardee, Keith; Sampson, Heidi M .; Liu, Suya; Yang, Ping; Williams, Shawn; Bílá, Wendy; Lajoie, Gilles (2005-07-29). „Jaderný receptor Drosophila e75 obsahuje hem a reaguje na plyn“. Buňka. 122 (2): 195–207. doi:10.1016 / j.cell.2005.07.005. ISSN  0092-8674. PMID  16051145.
  15. ^ Lunin, Vladimir V .; Dobrovetsky, Elena; Khutoreskaya, Galina; Zhang, Rongguang; Joachimiak, Andrzej; Doyle, Declan A .; Bochkarev, Alexey; Maguire, Michael E .; Edwards, Aled M. (04.06.2006). "Krystalová struktura transportéru CorA Mg2 +". Příroda. 440 (7085): 833–837. Bibcode:2006 Natur.440..833L. doi:10.1038 / nature04642. ISSN  1476-4687. PMC  3836678. PMID  16598263.
  16. ^ "Vyhledávání RCDS PDB".
  17. ^ Morgan, Maxwell Robert; Roberts, Owen Gwilym; Edwards, Aled Morgan (2018). „Myšlenka a implementace obchodního modelu objevování léčiv otevřené vědy - M4K Pharma“. Vítejte v otevřeném výzkumu. 3: 154. doi:10.12688 / wellcomeopenres.14947.1. ISSN  2398-502X. PMC  6346698. PMID  30705971.
  18. ^ Jones, Molly Morgan; Castle-Clarke, Sophie; Brooker, Daniel; Nason, Edward; Huzair, Farah; Chataway, Joanna (2014-12-30). „Konsorcium strukturní genomiky: znalostní platforma pro objevování drog: shrnutí“. Rand Health Quarterly. 4 (3): 19. ISSN  2162-8254. PMC  5396214. PMID  28560088.
  19. ^ „MNI Open Research: přináší novou úroveň transparentnosti neurologickému výzkumu“. Neuro. Citováno 2019-07-12.
  20. ^ Edwards, Aled; Morgan, Max; Al Chawaf, Arij; Andrusiak, Kerry; Charney, Rachel; Cynader, Zarya; ElDessouki, Ahmed; Lee, Yunjeong; Moeser, Andrew (31. května 2017). „Důvěryhodný přístup ke sdílení výzkumných činidel“. Science Translational Medicine. 9 (392): eaai9055. doi:10.1126 / scitranslmed.aai9055. ISSN  1946-6242. PMID  28566431.
  21. ^ "Aled Edwards". Ashoka | Všichni měnič. Citováno 2019-07-12.
  22. ^ Edwards, Aled M .; Isserlin, Ruth; Bader, Gary D .; Frye, Stephen V .; Willson, Timothy M .; Yu, Frank H. (10.02.2011). "Příliš mnoho silnic není obsazeno". Příroda. 470 (7333): 163–165. arXiv:1102.0448. Bibcode:2011 Natur.470..163E. doi:10.1038 / 470163a. ISSN  1476-4687. PMID  21307913.
  23. ^ „Osvětlení drogového genomu | Společný fond NIH“. commonfund.nih.gov. Citováno 2019-07-12.
  24. ^ Zimmer, Carl (2018-09-18). „Proč je vaše DNA stále na nezmapovaném území“. The New York Times. ISSN  0362-4331. Citováno 2019-07-12.
  25. ^ Arrowsmith, Cheryl H .; Audia, James E .; Austin, Christopher; Baell, Jonathan; Bennett, Jonathan; Blagg, Julian; Bountra, Chas; Brennan, Paul E .; Brown, Peter J. (srpen 2015). „Slib a nebezpečí chemických sond“. Přírodní chemická biologie. 11 (8): 536–541. doi:10.1038 / nchembio.1867. ISSN  1552-4469. PMC  4706458. PMID  26196764.
  26. ^ Generální, kancelář tajemníka guvernéra (01.07.2009). „Generální guvernér oznamuje 60 nových jmenování do Řádu Kanady“. Generální guvernér Kanady. Citováno 2019-07-12.