Alamethicin - Alamethicin - Wikipedia

Alamethicin[1]
Alamethicin.png
Jména
Název IUPAC
N-acetyl-2-methylalanyl-L-prolyl-2-methylalanyl-L-alanyl-2-methylalanyl-L-alanyl-L-glutaminyl-2-methylalanyl-L-valyl-2-methylalanylglycyl-L-leucyl-2-methylalanyl-L-prolyl-L-valyl-2-methylalanyl-2-methylalanyl-L-α-glutamyl-N1-[(1S) -1-benzyl-2-hydroxyethyl] -L-glutamamid
Identifikátory
3D model (JSmol )
ChEMBL
ChemSpider
Informační karta ECHA100.121.626 Upravte to na Wikidata
UNII
Vlastnosti
C92H150N22Ó25
Molární hmotnost1964,31 g / mol
VzhledŠpinavě bílá pevná látka
Bod tání 255 až 270 ° C (491 až 518 ° F; 528 až 543 K)
Nerozpustný
Rozpustnost v DMSO, methanolu, ethanolRozpustný
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa).
☒N ověřit (co je šekY☒N ?)
Reference Infoboxu

Alamethicin je kanál tvořící peptid antibiotikum, produkovaný houbou Trichoderma viride. Patří to peptaibol peptidy, které obsahují neproteinogenní aminokyselinový zbytek Aib (2-aminoisomáselná kyselina ). Tento zbytek silně indukuje tvorbu alfa-šroubovice struktura. Peptidová sekvence je:

Ac-Aib-Pro-Aib-Ala-Aib-Ala-Gln-Aib-Val-Aib-Gly-Leu-Aib-Pro-Val-Aib-Aib-Glu-Gln-Phl

(Ac = acetyl, Phl = fenylalaninol, Aib = Kyselina 2-aminoisomáselná )

v buněčné membrány, tvoří se Napětí -závislý ion kanály agregací čtyř až šesti molekuly.

Biosyntéza

Předpokládá se, že biosyntéza alamethicinu je katalyzována alamethicin syntázou, Nonribozomální peptid syntáza (NRPS) byla poprvé izolována v roce 1975.[2] Ačkoli existuje několik sekvencí peptidu alamethicinu přijímaných,[3] důkazy naznačují, že se všechny řídí obecným mechanismem NRPS [4] s malými odchylkami u vybraných aminokyselin.[5] Počínaje acylace terminálu N první kyselina aminoisobutirová na enzymu ALM syntázy do Acetyl-CoA,[6] poté následuje postupná kondenzace aminokyselin každou modulární jednotkou syntetázy.[7] Aminokyseliny jsou zpočátku adenylovány „adenylylace „(A) doména před připojením a thioester vazba na Acyl Carrier Protein - jako peptidyl nosný protein.[8] Rostoucí řetězec je připojen k aminokyselině nesoucí PCP pomocí „kondenzační“ (C) domény, po níž následuje další kolo stejných reakcí dalším modulem.[8]

alternativní text
Obecný mechanismus syntézy NRPS v alamethicinu, který ukazuje kondenzaci aminokyselinových substrátů z modulu na modul. Ac = Acetyl Aib = kyselina aminoisomáselná. Složky modulu: A = Adenylylace PCP = Peptidyl Carrier Protein C = Kondenzace

Sestavení je dokončeno přidáním fenylalaninolu, neobvyklého substrátu podobného aminokyselině.[9] Po přidání fenylalaninolu je dokončený peptidový řetězec štěpen thioesterázovou doménou, štěpen thioesterovou vazbou a zanechává alkohol.

alternativní text
Schéma jednotlivých modulů a prodloužení biosyntézy alamethicinu. Rostoucí peptidový řetězec je zobrazen pro každý modul, končící štěpením thioesteru a generováním lineárního alamethicinu. Ac = Acetyl Aib = kyselina aminoisomáselná Pheol = fenylalaninol. Složky modulu: A = Adenylylace PCP = Peptidyl Carrier Protein C = Kondenzace

Reference

  1. ^ Stránka produktu alamethicin z Fermentek
  2. ^ Rindfleisch, H .; Kleinkauf, H. (01.03.1976). "Biosyntéza alamethicinu". FEBS Dopisy. 62 (3): 276–280. doi:10.1016/0014-5793(76)80074-9. ISSN  0014-5793. PMID  945191.
  3. ^ Kirschbaum, Jochen; Krause, Corina; Winzheimer, Ruth K .; Brückner, Hans (listopad – prosinec 2003). "Sekvence alamethicinů F30 a F50 byly znovu zváženy a odsouhlaseny". Journal of Peptide Science. 9 (11–12): 799–809. doi:10,1002 / ps.535. ISSN  1075-2617. PMID  14658799.
  4. ^ Marahiel, Mohamed A .; Stachelhaus, Torsten; Mootz, Henning D. (01.11.1997). "Modulární peptidové syntetázy zapojené do syntézy nerribozomálních peptidů". Chemické recenze. 97 (7): 2651–2674. doi:10.1021 / cr960029e. ISSN  0009-2665. PMID  11851476.
  5. ^ Kleinkauf, H .; Rindfleisch, H. (1975). „Non-ribozomální biosyntéza cyklického oktadekapeptidu alamethicinu“. Acta Microbiologica Academiae Scientiarum Hungaricae. 22 (4): 411–418. ISSN  0001-6187. PMID  1241650.
  6. ^ Mohr, H .; Kleinkauf, H. (1978-10-12). "Biosyntéza alamethicinu: acetylace amino konce a připojení fenylalaninolu". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Enzymologie. 526 (2): 375–386. doi:10.1016/0005-2744(78)90129-8. ISSN  0006-3002. PMID  568941.
  7. ^ Weber, Thomas; Marahiel, Mohamed A (leden 2001). "Zkoumání struktury domény modulárních nerribozomálních peptidových syntetáz". Struktura. 9 (1): –3 – R9. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00560-8. ISSN  0969-2126. PMID  11342140.
  8. ^ A b Fischbach, Michael A .; Walsh, Christopher T. (srpen 2006). „Enzymologie montážní linky pro polyketidová a neribozomální peptidová antibiotika: logika, strojní zařízení a mechanismy“. Chemické recenze. 106 (8): 3468–3496. doi:10.1021 / cr0503097. ISSN  0009-2665. PMID  16895337.
  9. ^ Turner, S. Richard; Voit, Brigitte I .; Mourey, Thomas H. (01.08.1993). "All-aromatické hyperrozvětvené polyestery s C-fenylalaninolem a N-acetátovými koncovými skupinami: syntéza a charakterizace". Makromolekuly. 26 (17): 4617–4623. Bibcode:1993MaMol..26.4617T. doi:10.1021 / ma00069a031. ISSN  0024-9297.

Další čtení

  • Jones, LR; Maddock, SW; Besch, HR Jr (1980). „Demaskující účinek alamethicinu na (Na +, K +) - ATPázu, adenylátcyklázu spojenou s beta-adrenergním receptorem a aktivity cAMP-dependentní protein kinázy srdečních sarkolemálních vezikul“. J. Biol. Chem. 255 (20): 9971–9980. PMID  6253461.
  • Prozkoumejte struktury Alamethicin na proteinová banka
  • Alamethicin v Norine
    • Z „modelu napěťově řízeného iontového kanálu odvozeného z krystalové struktury alamethicinu v rozlišení 1,5-A.“ Fox Jr, RO; Richards, FM (1982). „Model napěťově řízeného iontového kanálu odvozený z krystalové struktury alamethicinu v rozlišení 1,5-A“. Příroda. 300 (5890): 325–30. Bibcode:1982 Natur.300..325F. doi:10.1038 / 300325a0. PMID  6292726.
  • Leitgeb, Balázs; Szekeres, András; Manczinger, László; Vágvölgyi, Csaba; Kredics, László (01.06.2007). „Historie alamethicinu: přehled nejrozsáhleji studovaného peptaibolu“. Chemie a biologická rozmanitost. 4 (6): 1027–1051. doi:10.1002 / cbdv.200790095. ISSN  1612-1880. PMID  17589875.