Rodina aktinobakteriálních fágů Holin - Actinobacterial phage holin family

The Rodina Actinobacterial Phage Holin (APH) (TC # 1.E.57 ) je poměrně velká rodina proteinů o délce 105 až 180 aminoacylových zbytků, která obvykle vykazuje jeden transmembránový segment (TMS) poblíž N-konce. Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny APH lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[1]

Jedním z proteinů archetypu v této rodině je Gp5 holin mykobakteriofág Ms6. Mycobacteriophage Ms6 je dvouvláknová DNA (dsDNA) bakteriofág který kromě předpokládaného lyzačního systému endolysin (LysA) -holin (Gp4) kóduje tři další proteiny v rámci svého lyzačního modulu: Gp1, LysB a Gp5.[2]

Ms6 Gp4 (TC # 1.E.18.1.2 ) byl dříve popsán jako holin-like protein třídy II. Druhý domnělý gen holinu (gp5) kódující protein (Gp5) s predikovaným jediným N-koncovým TMS byl identifikován na konci lytického operonu Ms6. Ani domnělý holin třídy II, ani jediný TMS polypeptid nemohl spustit lýza v párových kombinacích s endolyzinem LysA v Escherichia coli. Další studie však ukázaly, že Gp4 a Gp5 Ms6 vzájemně interagují. To naznačuje, že u infekce Ms6 je správného a naprogramovaného načasování lýzy dosaženo kombinovaným působením Gp4 a Gp5.[2]

Viz také

Další čtení

  • Petrovski, Steve; Seviour, Robert J .; Tillett, Daniel (2011). „Charakterizace genomu polyvalentního lytického bakteriofága GTE2, který má potenciál pro biokontrolu pěn stabilizovaných Gordonia, Rhodococcus a Nocardia v rostlinách s aktivovaným kalem“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 77 (12): 3923–3929. doi:10.1128 / AEM.00025-11. PMC  3131622. PMID  21498753.
  • Reddy, Bhaskara L .; Saier Jr, Milton H. (2013). „Topologické a fylogenetické analýzy rodin bakteriálních holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. PMC  3788059. PMID  23856191.
  • Saier, Milton H .; Reddy, Bhaskara L. (2015). „Holins in Bacteria, Eukaryotes, and Archaea: Multifunctional Xenologues with Potential Biotechnological and Biomedical Applications“. Journal of Bacteriology. 197 (1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. PMC  4288690. PMID  25157079.
  • Wang, I.N .; Smith, D.L .; Young, R. (2000). „Holiny: proteinové hodiny bakteriofágových infekcí“. Výroční přehled mikrobiologie. 54: 799–825. doi:10,1146 / annurev.micro. 54.1.799. PMID  11018145.

Reference

  1. ^ „1.E.57. Rodina Actinobacterial Phage Holin (APH)“. TCDB. Citováno 2016-03-29.
  2. ^ A b Catalão, Maria João; Gil, Filipa; Moniz-Pereira, José; Pimentel, Madalena (01.06.2011). „Funkční analýza holinových proteinů mykobakteriofága Ms6“. Journal of Bacteriology. 193 (11): 2793–2803. doi:10.1128 / JB.01519-10. ISSN  1098-5530. PMC  3133122. PMID  21441511.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.E.57. Rodina Actinobacterial Phage Holin (APH), který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.