ARPC2 - ARPC2

ARPC2
Identifikátory
Aliasy	ARPC2, ARC34, PNAS-139, p34-Arc, PRO2446, aktin související protein 2/3 komplexní podjednotka 2
Externí ID	OMIM: 604224 MGI: 1923959 HomoloGene: 4187 Genové karty: ARPC2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	218,254,356 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	74,268,209 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba aktinového vlákna; • strukturní složka cytoskeletu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktinová vazba;
Buněčná složka	• cytosol; • endozom; • buněčná projekce; • projekční membrána svalových buněk; • ohnisková adheze; • buněčná membrána; • Komplex Arp2 / 3; • synapse; • buněčné spojení; • náběžná hrana buňky; • aktinový cytoskelet; • neuronová projekce; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • cytoplazma; • buněčné jádro; • lamellipodium; • místo dvouvláknového zlomu; • glutamátergická synapse;
Biologický proces	• pohyb buňky nebo subcelulární složky; • pozitivní regulace polymerace aktinových vláken; • Signální dráha receptoru Fc-gama zapojená do fagocytózy; • signální dráha receptoru efrinu; • regulace polymerace aktinových vláken; • pozitivní regulace šíření buněk závislá na adhezi; • Nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • pozitivní regulace sestavy lamellipodia; • membránová organizace; • polymerace aktinových vláken; • pohyblivost buněk závislá na polymeraci aktinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10109
	76709
	ENSG00000163466
	ENSMUSG00000006304
	O15144
	Q9CVB6
	NM_005731; NM_152862
	NM_029711; NM_001357387
	NP_005722; NP_690601
	NP_083987; NP_001344316
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

S aktinem související protein 2/3 komplexní podjednotka 2 je protein že u lidí je kódován ARPC2 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

Tento gen kóduje jednu ze sedmi podjednotek lidského proteinového komplexu Arp2 / 3. Komplex proteinu Arp2 / 3 se podílí na řízení polymerace aktinu v buňkách a byl zachován evolucí. Přesná role proteinu kódovaného tímto genem, podjednotkou p34, musí být ještě stanovena. Dosud byly charakterizovány dvě alternativně spojené varianty. Byly popsány další alternativně sestřihané varianty, ale jejich plná délka nebyla stanovena.^[7]

Interakce

ARPC2 bylo prokázáno komunikovat s Kortaktin.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000163466 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000006304 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Machesky LM, Reeves E, Wientjes F, Mattheyse FJ, Grogan A, Totty NF, Burlingame AL, Hsuan JJ, Segal AW (1997). „Komplex 2/3 proteinu příbuzného s aktinem se lokalizuje do oblastí lamellipodiálního výčnělku a je složen z evolučně konzervovaných proteinů“. Biochem. J. 328 (Pt 1) (Pt 1): 105–12. doi:10.1042 / bj3280105. PMC 1218893. PMID 9359840.
^ Welch MD, DePace AH, Verma S, Iwamatsu A, Mitchison TJ (srpen 1997). „Lidský komplex Arp2 / 3 se skládá z evolučně konzervovaných podjednotek a je lokalizován do buněčných oblastí sestavy dynamického aktinového vlákna“. J. Cell Biol. 138 (2): 375–84. doi:10.1083 / jcb.138.2.375. PMC 2138188. PMID 9230079.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARPC2 aktin související protein 2/3 komplex, podjednotka 2, 34 kDa“.
^ Weed SA, Karginov AV, Schafer DA, Weaver AM, Kinley AW, Cooper JA, Parsons JT (říjen 2000). „Lokalizace kortaktinu na místa sestavení aktinu v lamellipodii vyžaduje interakce s F-aktinem a komplexem Arp2 / 3“. J. Cell Biol. 151 (1): 29–40. doi:10.1083 / jcb.151.1.29. PMC 2189811. PMID 11018051.

externí odkazy

Člověk ARPC2 umístění genomu a ARPC2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Couch FJ, Rommens JM, Neuhausen SL, Bélanger C, Dumont M, Abel K, Bell R, Berry S, Bogden R, Cannon-Albright L, Farid L, Frye C, Hattier T, Janecki T, Jiang P, Kehrer R, Leblanc JF, McArthur-Morrison J, Meney D, Miki Y, Peng Y, Samson C, Schroeder M, Snyder SC, Simard J (1996). "Generování integrované transkripční mapy oblasti BRCA2 na chromozomu 13q12-q13". Genomika. 36 (1): 86–99. doi:10.1006 / geno.1996.0428. PMID 8812419.
Welch MD, Iwamatsu A, Mitchison TJ (1997). „Polymerace aktinu je indukována proteinovým komplexem Arp2 / 3 na povrchu Listeria monocytogenes.“ Příroda. 385 (6613): 265–9. doi:10.1038 / 385265a0. PMID 9000076. S2CID 4358529.
Näär AM, Beaurang PA, Zhou S, Abraham S, Solomon W, Tjian R (1999). "Kompozitní koaktivátor ARC zprostředkovává transkripční aktivaci zaměřenou na chromatin". Příroda. 398 (6730): 828–32. doi:10.1038/19789. PMID 10235267. S2CID 23646963.
Zhao X, Yang Z, Qian M, Zhu X (2001). "Interakce mezi podjednotkami lidského komplexu Arp2 / 3: p20-Arc jako rozbočovač". Biochem. Biophys. Res. Commun. 280 (2): 513–7. doi:10,1006 / bbrc.2000.4151. PMID 11162547.
Robinson RC, Turbedsky K, Kaiser DA, Marchand JB, Higgs HN, Choe S, Pollard TD (2001). "Krystalová struktura komplexu Arp2 / 3". Věda. 294 (5547): 1679–84. doi:10.1126 / science.1066333. PMID 11721045. S2CID 18088124.
Gournier H, Goley ED, Niederstrasser H, Trinh T, Welch MD (2001). "Rekonstituce lidského komplexu Arp2 / 3 odhaluje kritické role jednotlivých podjednotek ve složité struktuře a aktivitě". Mol. Buňka. 8 (5): 1041–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00393-8. PMID 11741539.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Nat. Biotechnol. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Kaneda A, Kaminishi M, Sugimura T, Ushijima T (2004). "Snížená exprese sedmi genů komplexu ARP2 / 3 u lidských rakovin žaludku". Cancer Lett. 212 (2): 203–10. doi:10.1016 / j.canlet.2004.03.020. PMID 15279900.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Dubois T, Paléotti O, Mironov AA, Fraisier V, Stradal TE, De Matteis MA, Franco M, Chavrier P (2005). „Golgi-localized GAP for Cdc42 functions downstream of ARF1 to control Arp2 / 3 complex and F-actin dynamics“. Nat. Cell Biol. 7 (4): 353–64. doi:10.1038 / ncb1244. PMID 15793564. S2CID 37000096.
Cai L, Holoweckyj N, MD Schaller, Bear JE (2005). „Fosforylace koroninu 1B proteinovou kinázou C reguluje interakci s Arp2 / 3 a buněčnou motilitu“. J. Biol. Chem. 280 (36): 31913–23. doi:10,1074 / jbc.M504146200. PMID 16027158.
Cai L, Marshall TW, Uetrecht AC, Schafer DA, Bear JE (2007). „Coronin 1B koordinuje aktivity Arp2 / 3 a aktivity cofilinu na špičce“. Buňka. 128 (5): 915–29. doi:10.1016 / j.cell.2007.01.031. PMC 2630706. PMID 17350576.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.