ARPC1B - ARPC1B

ARPC1B
Identifikátory
Aliasy	ARPC1B, ARC41, p40-ARC, p41-ARC, aktin související protein 2/3 komplexní podjednotka 1B, PLTEID
Externí ID	OMIM: 604223 MGI: 1343142 HomoloGene: 4179 Genové karty: ARPC1B
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	99,394,816 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba aktinového vlákna; • aktinová vazba; • strukturní složka cytoskeletu; • GO: 0032403 vazba makromolekulárního komplexu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • Komplex Arp2 / 3; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • ohnisková adheze; • aktinový cytoskelet; • tubulobulbarový komplex; • buněčné jádro;
Biologický proces	• Nukleace aktinu zprostředkovaná komplexem Arp2 / 3; • signální dráha receptoru efrinu; • regulace polymerace aktinových vláken; • pohyb buňky nebo subcelulární složky; • Signální dráha receptoru Fc-gama zapojená do fagocytózy; • reakce na estrogen; • odpověď na estradiol;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10095
	11867
	ENSG00000130429
	ENSMUSG00000029622
	O15143
	Q9WV32
	NM_005720
	NM_023142
	NP_005711
	NP_075631
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

S aktinem související protein 2/3 komplexní podjednotka 1B je protein že u lidí je kódován ARPC1B gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje jednu ze sedmi podjednotek lidského proteinového komplexu Arp2 / 3. Tato podjednotka je členem rodiny proteinů SOP2 a je nejvíce podobná proteinu kódovanému genem ARPC1A. Podobnost mezi těmito dvěma proteiny naznačuje, že oba mohou fungovat jako podjednotka p41 lidského komplexu Arp2 / 3, která usnadňuje větvení aktinových vláken v buňkách. Izoformy podjednotky p41 mohou přizpůsobit funkce komplexu různým typům buněk nebo vývojovým stádiím.^[6] Ve skutečnosti se nedávno ukázalo, že varianty komplexu Arp2 / 3 se liší ve své schopnosti podporovat sestavení aktinu, přičemž komplexy obsahující ARPC1B a ARPC5L jsou v tomto ohledu lepší než ty, které obsahují ARPC1A a ARPC5.^[7] Rozdílné funkce ARPC1A a ARPC1B jsou patrné také v nedávném objevu pacientů se závažným nebo celkovým nedostatkem ARPC1B, kteří mají abnormality krevních destiček a imunitního systému, ale přesto přežívají, pravděpodobně kvůli kompenzační regulaci exprese ARPC1A.^[8]

Interakce

ARPC1B bylo prokázáno komunikovat s PAK1.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130429 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Welch MD, DePace AH, Verma S, Iwamatsu A, Mitchison TJ (červenec 1997). „Lidský komplex Arp2 / 3 se skládá z evolučně konzervovaných podjednotek a je lokalizován do buněčných oblastí sestavy dynamického aktinového vlákna“. The Journal of Cell Biology. 138 (2): 375–84. doi:10.1083 / jcb.138.2.375. PMC 2138188. PMID 9230079.
^ Machesky LM, Reeves E, Wientjes F, Mattheyse FJ, Grogan A, Totty NF, Burlingame AL, Hsuan JJ, Segal AW (listopad 1997). „Komplex 2/3 proteinu příbuzného s aktinem se lokalizuje do oblastí lamellipodiálního výčnělku a je složen z evolučně konzervovaných proteinů“. The Biochemical Journal. 328 (Pt 1) (1): 105–12. doi:10.1042 / bj3280105. PMC 1218893. PMID 9359840.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARPC1B aktinový proteinový komplex 2/3, podjednotka 1B, 41 kDa“.
^ „Diverzita izoforem v komplexu Arp2 / 3 určuje dynamiku aktinových vláken“.
^ Kahr, Walter H. A .; Pluthero, Fred G .; Elkadri, Abdul; Warner, Neil; Drobac, Marko; Chen, Chang Hua; Lo, Richard W .; Li, Ling; Li, Ren; Li, Qi; Thoeni, Cornelia; Pan, Jie; Leung, Gabriella; Lara-Corrales, Irene; Murchie, Ryan; Cutz, Ernest; Laxer, Ronald M .; Upton, Julia; Roifman, Chaim M .; Yeung, Rae S. M .; Brumell, John H .; Muise, Aleixo M. (2017). „Ztráta komplexní složky Arp2 / 3 ARPC1B způsobuje abnormality krevních destiček a předisponuje k zánětlivému onemocnění“. Příroda komunikace. 8: 14816. doi:10.1038 / ncomms14816. PMC 5382316. PMID 28368018.
^ Vadlamudi RK, Li F, Barnes CJ, Bagheri-Yarmand R, Kumar R (únor 2004). „p41-Arc podjednotka komplexu lidského Arp2 / 3 je substrát interagující s p21-aktivovanou kinázou“. Zprávy EMBO. 5 (2): 154–60. doi:10.1038 / sj.embor.7400079. PMC 1298990. PMID 14749719.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (duben 1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Analytická biochemie. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Welch MD, Iwamatsu A, Mitchison TJ (leden 1997). „Polymerace aktinu je indukována proteinovým komplexem Arp2 / 3 na povrchu Listeria monocytogenes.“ Příroda. 385 (6613): 265–9. doi:10.1038 / 385265a0. PMID 9000076. S2CID 4358529.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (duben 1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Výzkum genomu. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Rassenti LZ, Kipps TJ (duben 1997). "Nedostatek alelického vyloučení u B lymfocytární chronické lymfocytární leukémie". The Journal of Experimental Medicine. 185 (8): 1435–45. doi:10.1084 / jem.185.8.1435. PMC 2196272. PMID 9126924.
Zhao X, Yang Z, Qian M, Zhu X (leden 2001). "Interakce mezi podjednotkami lidského komplexu Arp2 / 3: p20-Arc jako rozbočovač". Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 280 (2): 513–7. doi:10,1006 / bbrc.2000.4151. PMID 11162547.
Volkmann N, Amann KJ, Stoilova-McPhie S, Egile C, Winter DC, Hazelwood L, Heuser JE, Li R, Pollard TD, Hanein D (září 2001). "Struktura komplexu Arp2 / 3 v aktivovaném stavu a ve spojeních větví aktinového vlákna". Věda. 293 (5539): 2456–9. doi:10.1126 / science.1063025. PMID 11533442. S2CID 17427295.
Robinson RC, Turbedsky K, Kaiser DA, Marchand JB, Higgs HN, Choe S, Pollard TD (listopad 2001). "Krystalová struktura komplexu Arp2 / 3". Věda. 294 (5547): 1679–84. doi:10.1126 / science.1066333. PMID 11721045. S2CID 18088124.
Gournier H, Goley ED, Niederstrasser H, Trinh T, Welch MD (listopad 2001). "Rekonstituce lidského komplexu Arp2 / 3 odhaluje kritické role jednotlivých podjednotek ve složité struktuře a aktivitě". Molekulární buňka. 8 (5): 1041–52. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00393-8. PMID 11741539.
Hüfner K, Schell B, Aepfelbacher M, Linder S (březen 2002). „Kyselé oblasti WASp a N-WASP mohou synergizovat s CDC42Hs a Rac1 za účelem indukce filopodií a lamellipodií.“ FEBS Dopisy. 514 (2–3): 168–74. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 02358-X. PMID 11943145. S2CID 36684487.
Kaneda A, Kaminishi M, Nakanishi Y, Sugimura T, Ushijima T (červenec 2002). "Snížená exprese inzulinem indukovaných proteinů komplexu 1 a p41 Arp2 / 3 v lidských rakovinách žaludku". International Journal of Cancer. 100 (1): 57–62. doi:10.1002 / ijc.10464. PMID 12115587. S2CID 13737339.
Gevaert K, Goethals M, Martens L, Van Damme J, Staes A, Thomas GR, Vandekerckhove J (květen 2003). „Zkoumání proteomů a analýza zpracování proteinů hmotnostní spektrometrickou identifikací tříděných N-koncových peptidů“. Přírodní biotechnologie. 21 (5): 566–9. doi:10.1038 / nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563.
Vadlamudi RK, Li F, Barnes CJ, Bagheri-Yarmand R, Kumar R (únor 2004). „p41-Arc podjednotka komplexu lidského Arp2 / 3 je substrát interagující s p21-aktivovanou kinázou“. Zprávy EMBO. 5 (2): 154–60. doi:10.1038 / sj.embor.7400079. PMC 1298990. PMID 14749719.
Kaneda A, Kaminishi M, Sugimura T, Ushijima T (srpen 2004). "Snížená exprese sedmi genů komplexu ARP2 / 3 u lidských rakovin žaludku". Dopisy o rakovině. 212 (2): 203–10. doi:10.1016 / j.canlet.2004.03.020. PMID 15279900.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK, Ong SE, Lyon CE, Lamond AI, Mann M (leden 2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.

externí odkazy

ARPC1B umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
ARPC1B podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.
Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: Q58CQ2 (Bovine Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B) at the PDBe-KB.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000130429 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9230079-4] Welch MD, DePace AH, Verma S, Iwamatsu A, Mitchison TJ (červenec 1997). „Lidský komplex Arp2 / 3 se skládá z evolučně konzervovaných podjednotek a je lokalizován do buněčných oblastí sestavy dynamického aktinového vlákna“. The Journal of Cell Biology. 138 (2): 375–84. doi:10.1083 / jcb.138.2.375. PMC 2138188. PMID 9230079.

[pmid9359840-5] Machesky LM, Reeves E, Wientjes F, Mattheyse FJ, Grogan A, Totty NF, Burlingame AL, Hsuan JJ, Segal AW (listopad 1997). „Komplex 2/3 proteinu příbuzného s aktinem se lokalizuje do oblastí lamellipodiálního výčnělku a je složen z evolučně konzervovaných proteinů“. The Biochemical Journal. 328 (Pt 1) (1): 105–12. doi:10.1042 / bj3280105. PMC 1218893. PMID 9359840.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: ARPC1B aktinový proteinový komplex 2/3, podjednotka 1B, 41 kDa“.

[7] „Diverzita izoforem v komplexu Arp2 / 3 určuje dynamiku aktinových vláken“.

[8] Kahr, Walter H. A .; Pluthero, Fred G .; Elkadri, Abdul; Warner, Neil; Drobac, Marko; Chen, Chang Hua; Lo, Richard W .; Li, Ling; Li, Ren; Li, Qi; Thoeni, Cornelia; Pan, Jie; Leung, Gabriella; Lara-Corrales, Irene; Murchie, Ryan; Cutz, Ernest; Laxer, Ronald M .; Upton, Julia; Roifman, Chaim M .; Yeung, Rae S. M .; Brumell, John H .; Muise, Aleixo M. (2017). „Ztráta komplexní složky Arp2 / 3 ARPC1B způsobuje abnormality krevních destiček a předisponuje k zánětlivému onemocnění“. Příroda komunikace. 8: 14816. doi:10.1038 / ncomms14816. PMC 5382316. PMID 28368018.

[pmid14749719-9] Vadlamudi RK, Li F, Barnes CJ, Bagheri-Yarmand R, Kumar R (únor 2004). „p41-Arc podjednotka komplexu lidského Arp2 / 3 je substrát interagující s p21-aktivovanou kinázou“. Zprávy EMBO. 5 (2): 154–60. doi:10.1038 / sj.embor.7400079. PMC 1298990. PMID 14749719.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]