ARNT2 - ARNT2

ARNT2
Identifikátory
Aliasy	ARNT2, WEDAS, bHLHe1, nukleární translokátor aryl uhlovodíkových receptorů 2
Externí ID	OMIM: 606036 MGI: 107188 HomoloGene: 7230 Genové karty: ARNT2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	80,597,933 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	84,410,176 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • aktivita dimerizace bílkovin; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba aryl uhlovodíkových receptorů; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• cytoplazma; • komplex regulátoru transkripce; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• odpověď na estradiol; • reakce na hypoxii; • regulace transkripce, DNA-šablony; • negativní regulace apoptotického procesu; • v embryonálním vývoji dělohy; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA; • vývoj centrálního nervového systému; • vývoj mozku; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • xenobiotický metabolický proces; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9915
	11864
	ENSG00000172379
	ENSMUSG00000015709
	Q9HBZ2
	Q61324
	NM_014862
	NM_007488
	NP_055677; NP_055677.3
	NP_031514
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor 2 je protein že u lidí je kódován ARNT2 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena nadrodiny transkripčních faktorů basic-helix-loop-helix-Per-Arnt-Sim (bHLH-PAS). Kódovaný protein funguje jako partner pro několik senzorových proteinů rodiny bHLH-PAS a vytváří heterodimery se senzorovými proteiny, které vážou regulační sekvence DNA v genech reagujících na vývojové a environmentální podněty. Za hypoxických podmínek se kódované proteinové komplexy s hypoxií indukovatelným faktorem 1alfa v jádře a tento komplex se váže na prvky reagující na hypoxii v zesilovačích a promotorech genů reagujících na kyslík. Vysoce podobný protein u myší tvoří funkční komplexy jak s aryl-uhlovodíkovými receptory, tak s Single-minded proteiny, což naznačuje další role kódovaného proteinu v metabolismu xenobiotických sloučenin a regulaci neurogeneze.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172379 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015709 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Vína ME, Lee L, Katari MS, Zhang L, DeRossi C, Shi Y, Perkins S, Feldman M, McCombie WR, Holdener BC (březen 2001). "Identifikace kandidátských genů pro vývoj mezodermu (mesd) srovnávacím mapováním a analýzou sekvence genomu". Genomika. 72 (1): 88–98. doi:10,1006 / geno.2000.6466. PMID 11247670.
^ ^A ^b "Entrez Gene: ARNT2 aryl-uhlovodíkový receptor nukleární translokátor 2".

externí odkazy

Člověk ARNT2 umístění genomu a ARNT2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D a kol. (1997). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. VII. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 4 (2): 141–50. doi:10.1093 / dnares / 4.2.141. PMID 9205841.
Moffett P, Pelletier J (2000). "Různé transkripční vlastnosti mSim-1 a mSim-2". FEBS Lett. 466 (1): 80–6. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01750-0. PMID 10648817.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: sekvenování a analýza 500 nových kompletních proteinů kódujících lidské cDNA“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Barrow LL, Wines ME, Romitti PA a kol. (2003). „Aryl uhlovodíkový receptor nukleární translokátor 2 (ARNT2): struktura, mapování genů, polymorfismy a hodnocení kandidátů na lidské orofaciální rozštěpy“. Teratologie. 66 (2): 85–90. doi:10.1002 / tera.10062. PMID 12210012.
Stolze I, Berchner-Pfannschmidt U, Freitag P a kol. (2002). "Hypoxií indukovatelná exprese genu erytropoetinu v lidských buňkách neuroblastomu". Krev. 100 (7): 2623–8. doi:10.1182 / krev-2001-12-0169. PMID 12239177.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ooe N, Saito K, Mikami N a kol. (2004). „Identifikace nového základního faktoru helix-loop-helix-PAS, NXF, odhaluje konkurenční pozitivní regulační roli Sim2 v expresi genu dendritického cytoskeletu modulátoru drebrinu“. Mol. Buňka. Biol. 24 (2): 608–16. doi:10.1128 / MCB.24.2.608-616.2004. PMC 343817. PMID 14701734.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: funkční plynovod genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Friedman ER, Fan CM (2007). „Samostatné necdin domény váží ARNT2 a HIF1alpha a potlačují transkripci“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 363 (1): 113–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.08.108. PMC 2083645. PMID 17826745.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000172379 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000015709 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11247670-5] Vína ME, Lee L, Katari MS, Zhang L, DeRossi C, Shi Y, Perkins S, Feldman M, McCombie WR, Holdener BC (březen 2001). "Identifikace kandidátských genů pro vývoj mezodermu (mesd) srovnávacím mapováním a analýzou sekvence genomu". Genomika. 72 (1): 88–98. doi:10,1006 / geno.2000.6466. PMID 11247670.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: ARNT2 aryl-uhlovodíkový receptor nukleární translokátor 2".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]