ARL3 - ARL3

ARL3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1FZQ, 3BH6, 3BH7, 4GOJ
Identifikátory
Aliasy	ARL3ARFL3, ADP ribosylační faktor jako GTPase 3, JBTS35, RP83
Externí ID	OMIM: 604695 MGI: 1929699 HomoloGene: 48276 Genové karty: ARL3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 10 (lidský)
Konec	102,714,397 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	46,573,198 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • Vazba na HDP; • vazba mikrotubulů; • Vazba GTP; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Aktivita GTPázy; • vazba iontů hořčíku; • Vazba proteinu aktivujícího GTPázu;
Buněčná složka	• cytoplazma; • centrosome; • Golgiho aparát; • buněčná projekce; • membrána; • Golgiho membrána; • vřeteno; • intracelulární; • fotoreceptor spojující cilium; • organizační centrum mikrotubulů; • střední část těla; • vřetenová mikrotubule; • cytoplazmatický mikrotubul; • extracelulární exosom; • cytoskelet; • buněčné jádro; • cilium; • mikrotubulární cytoskelet;
Biologický proces	• cilium morfogeneze; • vývoj ledvin; • intraciliary transport; • malá transdukce signálu zprostředkovaná GTPázou; • vývoj fotoreceptorových buněk; • transport zprostředkovaný vezikulemi po Golgi; • buněčné dělení; • transport bílkovin; • buněčný cyklus; • vyhlazená signální dráha; • doprava; • mitotická cytokineze; • Transport Golgiho plazmatickou membránou; • lokalizace proteinu do cilium; • lokalizace proteinu na ciliární membránu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	403
	56350
	ENSG00000138175
	ENSMUSG00000025035
	P36405
	Q9WUL7
	NM_004311
	NM_019718; NM_001355233
	NP_004302
	NP_062692; NP_001342162
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein podobný ADP-ribosylačnímu faktoru 3 je protein že u lidí je kódován ARL3 gen.^[5]^[6]^[7]

Funkce

ADP-ribosylační faktor podobný 3 je členem rodiny ADP-ribosylačního faktoru proteinů vázajících GTP. ARL3 váže guaninové nukleotidy, ale postrádá aktivitu ADP-ribosylačního faktoru.^[7]

Interakce

ARL3 bylo prokázáno komunikovat s Homolog proteinu unc-119.^[8]^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138175 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025035 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cavenagh MM, Breiner M, Schurmann A, Rosenwald AG, Terui T, Zhang C, Randazzo PA, Adams M, Joost HG, Kahn RA (srpen 1994). „ADP-ribosylační faktor (ARF) podobný 3, nový člen rodiny ARF proteinů vázajících GTP klonovaných z lidských a potkaních tkání“. J. Biol. Chem. 269 (29): 18937–42. PMID 8034651.
^ Kim HS (1998). "Přiřazení lidského genu pro ADP-ribosylační faktor 3 (ARL3) do pásma chromozomu 10 q23.3 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet. Cell Genet. 83 (3–4): 246. doi:10.1159/000015194. PMID 10072593. S2CID 35440803.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ARL3 ADP-ribosylační faktor podobný 3“.
^ Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.
^ Van Valkenburgh H, Shern JF, Sharer JD, Zhu X, Kahn RA (červen 2001). „Faktory ADP-ribosylace (ARF) a ARF podobné 1 (ARL1) mají specifické i sdílené efektory: charakterizující proteiny vázající ARL1“. J. Biol. Chem. 276 (25): 22826–37. doi:10,1074 / jbc.M102359200. PMID 11303027.

externí odkazy

Člověk ARL3 umístění genomu a ARL3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Adams MD, Kerlavage AR, Fleischmann RD, Fuldner RA, Bult CJ, Lee NH, Kirkness EF, Weinstock KG, Gocayne JD, White O (1995). „Počáteční hodnocení rozmanitosti lidských genů a vzorců exprese na základě 83 milionů nukleotidů sekvence cDNA“ (PDF). Příroda. 377 (6547 Suppl): 3–174. PMID 7566098.
Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Linari M, Hanzal-Bayer M, Becker J (1999). „Delta podjednotka tyčinkově specifické cyklické GMP fosfodiesterázy, PDE delta, interaguje s Arf-like proteinem Arl3 specifickým způsobem GTP“. FEBS Lett. 458 (1): 55–9. doi:10.1016 / S0014-5793 (99) 01117-5. PMID 10518933. S2CID 23460401.
Hillig RC, Hanzal-Bayer M, Linari M, Becker J, Wittinghofer A, Renault L (2000). „Strukturální a biochemické vlastnosti ukazují ARL3-GDP jako odlišný protein vázající GTP.“ Struktura. 8 (12): 1239–45. doi:10.1016 / S0969-2126 (00) 00531-1. PMID 11188688.
Bartolini F, Bhamidipati A, Thomas S, Schwahn U, Lewis SA, Cowan NJ (2002). „Funkční překrytí mezi proteinem retinitis pigmentosa 2 a tubulinově specifickým chaperonovým kofaktorem C“. J. Biol. Chem. 277 (17): 14629–34. doi:10,1074 / jbc.M200128200. PMID 11847227.
Hanzal-Bayer M, Renault L, Roversi P, Wittinghofer A, Hillig RC (2002). "Komplex delta Arl2-GTP a PDE: od struktury k funkci". EMBO J.. 21 (9): 2095–106. doi:10.1093 / emboj / 21.9.2095. PMC 125981. PMID 11980706.
Wistow G, Bernstein SL, Wyatt MK, Ray S, Behal A, Touchman JW, Bouffard G, Smith D, Peterson K (2002). „Exprimovaná analýza sekvenční značky lidské sítnice pro projekt NEIBank: retbindin, hojná nová retinální cDNA a alternativní sestřih dalších transkriptů genů preferovaných pro sítnici“. Mol. Vis. 8: 196–204. PMID 12107411.
Grayson C, Bartolini F, Chapple JP, Willison KR, Bhamidipati A, Lewis SA, Luthert PJ, Hardcastle AJ, Cowan NJ, Cheetham ME (2002). „Lokalizace lidského sítnice proteinu RP2 vázaného na retinitis pigmentosa RP2, jeho homologního kofaktoru C a proteinu interagujícího s RP2 Arl3“. Hučení. Mol. Genet. 11 (24): 3065–74. doi:10,1093 / hmg / 11,24,3065. PMID 12417528.
Kühnel K, Veltel S, Schlichting I, Wittinghofer A (2006). „Krystalová struktura proteinu lidské retinitis pigmentosa 2 a jeho interakce s Arl3“. Struktura. 14 (2): 367–78. doi:10.1016 / j.str.2005.11.008. PMID 16472755.
Zhou C, Cunningham L, Marcus AI, Li Y, Kahn RA (2006). „Arl2 a Arl3 regulují různé procesy závislé na mikrotubulích“. Mol. Biol. Buňka. 17 (5): 2476–87. doi:10,1091 / mbc.E05-10-0929. PMC 1446103. PMID 16525022.

Tento článek o gen na lidský chromozom 10 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138175 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000025035 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8034651-5] Cavenagh MM, Breiner M, Schurmann A, Rosenwald AG, Terui T, Zhang C, Randazzo PA, Adams M, Joost HG, Kahn RA (srpen 1994). „ADP-ribosylační faktor (ARF) podobný 3, nový člen rodiny ARF proteinů vázajících GTP klonovaných z lidských a potkaních tkání“. J. Biol. Chem. 269 (29): 18937–42. PMID 8034651.

[pmid10072593-6] Kim HS (1998). "Přiřazení lidského genu pro ADP-ribosylační faktor 3 (ARL3) do pásma chromozomu 10 q23.3 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet. Cell Genet. 83 (3–4): 246. doi:10.1159/000015194. PMID 10072593. S2CID 35440803.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ARL3 ADP-ribosylační faktor podobný 3“.

[pmid16169070-8] Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (září 2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

[pmid11303027-9] Van Valkenburgh H, Shern JF, Sharer JD, Zhu X, Kahn RA (červen 2001). „Faktory ADP-ribosylace (ARF) a ARF podobné 1 (ARL1) mají specifické i sdílené efektory: charakterizující proteiny vázající ARL1“. J. Biol. Chem. 276 (25): 22826–37. doi:10,1074 / jbc.M102359200. PMID 11303027.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]