ARHGAP29 - ARHGAP29

ARHGAP29 je gen umístěný na chromozomu 1p22, který kóduje protein aktivující Rho GTPázu (GAP) 29,[1] A protein který zprostředkovává cyklickou regulaci malých proteinů vázajících GTP, jako je RhoA.[2]

Funkce

ARHGAP29 je exprimován ve vyvíjející se tváři a může působit po proudu IRF6 v kraniofaciálním vývoji.[3]

Struktura

ARHGAP29 obsahuje čtyři domény včetně oblasti coiled-coil, o které je známo, že interaguje s Rap2,[4] doména C1, doména Rho GTPáza a malá C-koncová oblast, která interaguje s PTPL1.[2]

Klinický význam

Lokus 1p22 obsahující ARHGAP29 byl spojen s nesydromickým rozštěp rtu / patra podle genomové asociace[5] a metaanalýza.[6] Následná studie[3] identifikovali vzácné varianty kódování zahrnující nesmysly a variantu posunu snímků u pacientů s nesydromickými rozštěp rtu / patra. Nález role ARHGAP29 v kraniofaciálním vývoji byl objeven po sousedním ABCA4 Gen postrádal funkční nebo expresní data, aby jej podporoval jako etiologický gen pro nesydromní rozštěp rtu / patra i když SNP v genu ABCA4 byly spojeny s rozštěpem rtu / patra.

Reference

  1. ^ Heasman, SJ; Ridley, AJ (2008). „Savčí Rho GTPasy: nový pohled na jejich funkce ze studií in vivo“. Nat Rev Mol Cell Biol. 9 (9): 690–701. doi:10.1038 / nrm2476. PMID  18719708.
  2. ^ A b Saras, J; Franzen, P; Aspenstrom, P; Hellman, U; Gonez, LJ; Heldin, CH (1997). „Nový protein aktivující GTPázu pro Rho interaguje s doménou PDZ protein-tyrosin fosfatázy PTPL1“. J Biol Chem. 272 (39): 24333–24338. doi:10.1074 / jbc.272.39.24333. PMID  9305890.
  3. ^ A b Leslie, EJ; Mansilla MA; Biggs LC; Schuette K; Bullard S; Cooper M; Dunnwald M; Lidral AC; Marazita ML; Beaty TH; Murray JC (2012). „Analýzy exprese a mutací implikují ARHGAP29 jako etiologický gen pro rozštěpový ret s lokusem rozštěpu patra nebo bez něj, identifikovaný celogenomovou asociací na chromozomu 1p22“. Část A: Výzkum vrozených vad: Klinická a molekulární teratologie. 94: 934–942. doi:10,1002 / bdra.23076. PMC  3501616. PMID  23008150.
  4. ^ Myagmar, BE; Umikawa, M; Asato, T; Taira, K; Oshiro, M; Hino, A; Takei, K; Uezato, H; Kariya, K (2005). "PARG1, protein-tyrosin fosfatáza asociovaná s RhoGAP, jako domnělý efektor Rap2". Biochem Biophys Res Commun. 329 (3): 1046–1052. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.02.069.
  5. ^ Beaty TH, Murray JC, Marazita ML, Munger RG, Ruczinski I, Hetmanski JB, Liang KY, Wu T, Murray T, Fallin MD, Redett RA, Raymond G, Schwender H, Jin SC, Cooper ME, Dunnwald M, Mansilla MA , Leslie E, Bullard S, Lidral AC, Moreno LM, Menezes R, Vieira AR, Petrin A, Wilcox AJ, Lie RT, Jabs EW, Wu-Chou YH, Chen PK, Wang H, Ye X, Huang S, Yeow V , Chong SS, Jee SH, Shi B, Christensen K, Melbye M, Doheny KF, Pugh EW, Ling H, Castilla EE, Czeizel AE, Ma L, Field LL, Brody L, Pangilinan F, Mills JL, Molloy AM, Kirke PN, Scott JM, Arcos-Burgos M, Scott AF (2010). „Genomová asociační studie rozštěpu rtu s rozštěpem patra a bez něj rozeznává rizikové varianty poblíž MAFB a ABCA4“. Genetika přírody. 42 (6): 525–529. doi:10,1038 / ng.580. PMC  2941216. PMID  20436469.
  6. ^ Ludwig KU, Mangold E, Herms S, Nowak S, Reutter H, Paul A, Becker J, Herberz R, AlChawa T, Nasser E, Böhmer AC, Mattheisen M, Alblas MA, Barth S, Kluck N, Lauster C, Braumann B , Reich RH, Hemprich A, Pötzsch S, Blaumeiser B, Daratsianos N, Kreusch T, Murray JC, Marazita ML, Ruczinski I, Scott AF, Beaty TH, Kramer FJ, Wienker TF, Steegers-Theunissen RP, Rubini M, Mossey PA , Hoffmann P, Lange C, Cichon S, Propping P, Knapp M, Nöthen MM (2012). „Celo genomové metaanalýzy nesyndromického rozštěpu rtu s nebo bez rozštěpu patra identifikují šest nových rizikových lokusů“. Genetika přírody. 44 (9): 968–971. doi:10,1038 / ng.2360. PMC  3598617. PMID  22863734.


externí odkazy