ANTXR1 - ANTXR1

ANTXR1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3N2N
Identifikátory
Aliasy	ANTXR1, ATR, GAPO, TEM8, antraxový toxinový receptor 1, ANTXR buněčná adhezní molekula 1
Externí ID	OMIM: 606410 MGI: 1916788 HomoloGene: 12976 Genové karty: ANTXR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	69,249,327 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 6 (myš)
Konec	87,335,821 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba aktinového vlákna; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kolagenu; • aktivita transmembránového signalizačního receptoru; • vazba kovových iontů; • aktivita signálního receptoru;
Buněčná složka	• integrální součást membrány; • povrch buňky; • buněčná membrána; • buněčná projekce; • endosomová membrána; • lamellipodná membrána; • extracelulární exosom; • membrána; • filopodná membrána; • vnější strana plazmatické membrány;
Biologický proces	• reorganizace aktinového cytoskeletu; • reprodukční proces; • šíření buněk závislé na adhezi; • signální transdukce; • pozitivní regulace aktivity metalopeptidázy; • negativní regulace sestavy extracelulární matrice; • vývoj krevních cév; • transport toxinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84168
	69538
	ENSG00000169604
	ENSMUSG00000033420
	Q9H6X2; Q96EC6
	Q9CZ52
	NM_018153; NM_032208; NM_053034
	NM_054041
	NP_060623; NP_115584; NP_444262; NP_060623.2
	NP_473382
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Antraxový toxinový receptor 1 (ANTXR1 nebo také známý jako TEM8) je a protein že u lidí je kódován ANTXR1 gen.^[5]^[6]^[7] Předpokládá se jeho molekulová hmotnost asi 63 kDa.

Protein kódovaný tímto genem je transmembránový protein typu I a je nádorově specifickým endotelovým markerem, který se podílí na kolorektálním karcinomu. Ukázalo se, že tento protein je také dokovacím proteinem nebo receptorem pro toxin Bacillus anthracis, původce choroby, antrax. Vazba složky ochranného antigenu (PA), tripartitního antraxového toxinu, na tento receptorový protein zprostředkovává dodání toxinových složek do cytosolu buněk. Jakmile jsou uvnitř buňky, další dvě složky antraxového toxinu, edémový faktor (EF) a letální faktor (LF) narušují normální buněčné procesy. Byly popsány tři alternativně sestříhané varianty.^[7]

Viz také

Toxin antraxu

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169604 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033420 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ St Croix B, Rago C, Velculescu V, Traverso G, Romans KE, Montgomery E, Lal A, Riggins GJ, Lengauer C, Vogelstein B, Kinzler KW (srpen 2000). "Geny exprimované v lidském endotelu nádoru". Věda. 289 (5482): 1197–202. doi:10.1126 / science.289.5482.1197. PMID 10947988.
^ Carson-Walter EB, Watkins DN, Nanda A, Vogelstein B, Kinzler KW, St Croix B (září 2001). "Endoteliální markery buněčného povrchu jsou konzervovány u myší a lidí". Cancer Res. 61 (18): 6649–55. PMID 11559528.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ANTXR1 antraxový toxinový receptor 1“.

externí odkazy

Člověk ANTXR1 umístění genomu a ANTXR1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk ATR umístění genomu a ATR stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Schmidt DR, Schreiber SL (1999). "Molekulární asociace mezi ATR a dvěma složkami komplexu remodelace a deacetylace nukleosomu, HDAC2 a CHD4". Biochemie. 38 (44): 14711–7. CiteSeerX 10.1.1.559.7745. doi:10.1021 / bi991614n. PMID 10545197.
Liu XH, Collier RJ, Youle RJ (2002). „Inhibice neurotické apoptózy vyvolané axotomií extracelulárním dodáním fúzního proteinu Bcl-XL“. J. Biol. Chem. 276 (49): 46326–32. doi:10,1074 / jbc.M108930200. PMID 11574549.
Bradley KA, Mogridge J, Mourez M a kol. (2001). "Identifikace buněčného receptoru pro antraxový toxin". Příroda. 414 (6860): 225–9. doi:10.1038 / n35101999. PMID 11700562. S2CID 4373278.
Latonen L, Taya Y, Laiho M (2001). „UV záření indukuje na dávce závislou regulaci odpovědi p53 a moduluje interakci p53-HDM2 v lidských fibroblastech“. Onkogen. 20 (46): 6784–93. doi:10.1038 / sj.onc.1204883. PMID 11709713.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scobie HM, Rainey GJ, Bradley KA, Young JA (2003). „Lidský protein kapilární morfogeneze 2 funguje jako receptor toxinu antraxu“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (9): 5170–4. doi:10.1073 / pnas.0431098100. PMC 154317. PMID 12700348.
Bradley KA, Mogridge J, Jonah G a kol. (2004). „Vazba antraxového toxinu na jeho receptor je podobná interakcím alfa integrin-ligand“. J. Biol. Chem. 278 (49): 49342–7. doi:10,1074 / jbc.M307900200. PMID 14507921.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Jones GG, Reaper PM, Pettitt AR, Sherrington PD (2004). „Cesta ATR-p53 je potlačena v necyklovatelných normálních a maligních lymfocytech“. Onkogen. 23 (10): 1911–21. doi:10.1038 / sj.onc.1207318. PMID 14755251. S2CID 31825072.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Bonuccelli G, Sotgia F, Frank PG a kol. (2005). „ATR / TEM8 je vysoce exprimován v epiteliálních buňkách lemujících tři místa vstupu Bacillus anthracis: důsledky pro patogenezi antraxové infekce“. Dopoledne. J. Physiol., Cell Physiol. 288 (6): C1402–10. doi:10.1152 / ajpcell.00582.2004. PMID 15689409.
Hotchkiss KA, Basile CM, Spring SC a kol. (2005). „Exprese TEM8 stimuluje adhezi a migraci endoteliálních buněk regulací interakcí buněčné matrice na kolagenu“. Exp. Cell Res. 305 (1): 133–44. doi:10.1016 / j.yexcr.2004.12.025. PMID 15777794.
Rmali KA, Puntis MC, Jiang WG (2005). „TEM-8 a tvorba tubulů v endoteliálních buňkách, její potenciální role jeho domén vW / TM“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 334 (1): 231–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.06.085. PMID 15993844.
Rainey GJ, Wigelsworth DJ, Ryan PL a kol. (2005). „Specifické požadavky na receptory pro dodávání toxinu antraxu do buněk“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 102 (37): 13278–83. doi:10.1073 / pnas.0505865102. PMC 1201603. PMID 16141341.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000169604 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033420 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10947988-5] St Croix B, Rago C, Velculescu V, Traverso G, Romans KE, Montgomery E, Lal A, Riggins GJ, Lengauer C, Vogelstein B, Kinzler KW (srpen 2000). "Geny exprimované v lidském endotelu nádoru". Věda. 289 (5482): 1197–202. doi:10.1126 / science.289.5482.1197. PMID 10947988.

[pmid11559528-6] Carson-Walter EB, Watkins DN, Nanda A, Vogelstein B, Kinzler KW, St Croix B (září 2001). "Endoteliální markery buněčného povrchu jsou konzervovány u myší a lidí". Cancer Res. 61 (18): 6649–55. PMID 11559528.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: ANTXR1 antraxový toxinový receptor 1“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]