ANKRD27 - ANKRD27

ANKRD27
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4B93, 4CYM, 4CZ2
Identifikátory
Aliasy	ANKRD27, VARP, PP12899, ankyrinová opakovaná doména 27
Externí ID	MGI: 2444103 HomoloGene: 12956 Genové karty: ANKRD27
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	32,676,597 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	35,639,226 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • aktivita faktoru výměny guanyl-nukleotidů; • Vazba Rab GTPázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • SNARE vazba; • Aktivita výměnného faktoru rab guanyl-nukleotid;
Buněčná složka	• endozom; • pozdní endosom; • membrána; • melanosom; • buněčná membrána; • transportní váček; • tubulární endosom; • časný endosom; • lysozom; • cytoplazmatická vezikulární membrána; • cytoplazmatický váček; • cytosol; • neuronová projekce;
Biologický proces	• negativní regulace sestavy komplexu SNARE; • transport raného endosomu k pozdnímu endosomu; • pozitivní regulace morfogeneze dendritů; • transport endosomu do melanosomu; • transport bílkovin; • retrográdní transport, endosom na plazmatickou membránu; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • neuronová projekce morfogeneze; • doprava; • regulace molekulární funkce; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	84079
	245886
	ENSG00000105186
	ENSMUSG00000034867
	Q96NW4
	Q3UMR0
	NM_032139
	NM_145633; NM_178263; NM_001358876
	NP_115515
	NP_663608; NP_839994; NP_001345805
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein obsahující ankyrinovou repetiční doménu 27 je protein že u lidí je kódován ANKRD27 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105186 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034867 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
^ Zhang X, He X, Fu XY, Chang Z (březen 2006). „Varp je Rab21 guaninový nukleotidový výměnný faktor a reguluje dynamiku endozomů“. J Cell Sci. 119 (Pt 6): 1053–62. doi:10.1242 / jcs.02810. PMID 16525121.
^ „Entrez Gene: ANKRD27 ankyrin opakující se doména 27 (doména VPS9)“.

externí odkazy

Člověk ANKRD27 umístění genomu a ANKRD27 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A a kol. (2001). „Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných sekvenováním cDNA ve velkém měřítku“. EMBO Rep. 1 (3): 287–92. doi:10.1093 / embo-reports / kvd058. PMC 1083732. PMID 11256614.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Wan D, Gong Y, Qin W a kol. (2004). „Rozsáhlý screening transfekce cDNA na geny související s vývojem a progresí rakoviny“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (44): 15724–9. doi:10.1073 / pnas.0404089101. PMC 524842. PMID 15498874.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105186 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034867 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11230166-5] Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B „Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (březen 2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.

[pmid16525121-6] Zhang X, He X, Fu XY, Chang Z (březen 2006). „Varp je Rab21 guaninový nukleotidový výměnný faktor a reguluje dynamiku endozomů“. J Cell Sci. 119 (Pt 6): 1053–62. doi:10.1242 / jcs.02810. PMID 16525121.

[entrez-7] „Entrez Gene: ANKRD27 ankyrin opakující se doména 27 (doména VPS9)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]