AHNAK - AHNAK

AHNAK
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4DRW, 4FTG, 4HRG
Identifikátory
Aliasy	AHNAK, AHNAKRS, AHNAK nukleoprotein, PM227
Externí ID	OMIM: 103390 MGI: 1316648 HomoloGene: 67425 Genové karty: AHNAK
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	62,556,235 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	9,076,914 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba na protein S100; • aktivita strukturní molekuly udělující elasticitu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• cytoplazma; • váček; • cytosol; • membrána; • kontaktní zóna buňka-buňka; • ohnisková adheze; • buněčná membrána; • lysozomální membrána; • aktinový cytoskelet; • membránový vor; • sarcolemma; • costamere; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • T-tubule;
Biologický proces	• regulace napěťově řízené aktivity vápníkového kanálu; • regulace sestřihu RNA; • oligomerizace proteinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	79026
	66395
	ENSG00000124942
	ENSMUSG00000069833
	Q09666
	n / a
	NM_001620; NM_024060; NM_001346445; NM_001346446
	NM_001039959; NM_001286518; NM_009643; NM_175108
	NP_001333374; NP_001333375; NP_001611; NP_076965
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein AHNAK spojený s diferenciací neuroblastů, také známý jako desmoyokin, je a protein že u lidí je kódován AHNAK gen.^[5]^[6]^[7] AHNAK byl původně identifikován v roce 1989 (v hovězí čenich epidermální buněk) a pojmenovaný desmoyokin kvůli jeho lokalizačnímu vzoru (který se podobal a jho ) v desmosomální plaketa.^[8] Ukázalo se, že AHNAK je pro pseudopod výčnělek a buňka migrace. ^[9]

Interakce

Ukázalo se, že AHNAK komunikovat s S100B.^[10]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124942 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069833 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ James MR, Richard CW, Schott JJ, Yousry C, Clark K, Bell J, Terwilliger JD, Hazan J, Dubay C, Vignal A (září 1994). "Radiační hybridní mapa 506 STS markerů překlenujících lidský chromozom 11". Genetika přírody. 8 (1): 70–6. doi:10.1038 / ng0994-70. PMID 7987395. S2CID 21392416.
^ Hohaus A, Osoba V, Behlke J, Schaper J, Morano I, Haase H (srpen 2002). „Karboxylová koncová oblast ahnaku poskytuje spojení mezi srdečními kanály Ca2 + typu L a cytoskeletem na bázi aktinu“. FASEB Journal. 16 (10): 1205–16. doi:10.1096 / fj.01-0855com. PMID 12153988. S2CID 12413536.
^ "Entrez Gene: AHNAK AHNAK nukleoprotein (desmoyokin)".
^ Hieda Y, Tsukita S, Tsukita S (říjen 1989). „Nový protein s vysokou molekulovou hmotností vykazující jedinečnou lokalizaci v desmosomálním plaku“. The Journal of Cell Biology. 109 (4 Pt 1): 1511–8. doi:10.1083 / jcb.109.4.1511. PMC 2115823. PMID 2677021.
^ Shankar J, Messenberg A, Chan J, Underhill TM, Foster LJ, Nabi IR (květen 2010). „Pseudopodiální aktinová dynamika řídí epiteliálně-mezenchymální přechod v metastatických rakovinných buňkách“. Výzkum rakoviny. 70 (9): 3780–90. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-4439. PMID 20388789.
^ Gentil BJ, Delphin C, Mbele GO, Deloulme JC, Ferro M, Garin J, Baudier J (červen 2001). „Obří protein AHNAK je specifickým cílem pro protein S100B vázající vápník a zinek: potenciální důsledky pro regulaci homeostázy Ca2 + pomocí S100B“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 23253–61. doi:10,1074 / jbc.M010655200. PMID 11312263.

Další čtení

Shtivelman E, Cohen FE, Bishop JM (červen 1992). „Lidský gen (AHNAK) kódující neobvykle velký protein se strukturou polyiontové tyčinky 1,2 mikronů“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 89 (12): 5472–6. doi:10.1073 / pnas.89.12.5472. PMC 49314. PMID 1608957.
Kudoh J, Wang Y, Minoshima S, Hashimoto T, Amagai M, Nishikawa T, Shtivelman E, Bishop JM, Shimizu N (1995). „Lokalizace lidského genu AHNAK / desmoyokinu (AHNAK) do pásma chromozomu 11q12 pomocí hybridní analýzy somatických buněk a hybridizace in situ fluorescence“. Cytogenetika a genetika buněk. 70 (3–4): 218–20. doi:10.1159/000134037. PMID 7789175.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (březen 2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Gentil BJ, Delphin C, Mbele GO, Deloulme JC, Ferro M, Garin J, Baudier J (červen 2001). „Obří protein AHNAK je specifickým cílem pro protein S100B vázající vápník a zinek: potenciální důsledky pro regulaci homeostázy Ca2 + pomocí S100B“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 23253–61. doi:10,1074 / jbc.M010655200. PMID 11312263.
Sussman J, Stokoe D, Ossina N, Shtivelman E (září 2001). „Protein kináza B fosforyluje AHNAK a reguluje jeho subcelulární lokalizaci“. The Journal of Cell Biology. 154 (5): 1019–30. doi:10.1083 / jcb.200105121. PMC 2196192. PMID 11535620.
Wernyj RP, Ewing CM, Isaacs WB (říjen 2001). "Více protilátek proti titinovému imunoreaktu s AHNAK a lokalizovaných do mitotického vřetenového aparátu". Motilita buněk a cytoskelet. 50 (2): 101–13. doi:10,1002 / cm. 1044. PMID 11746675.
Straub BK, Boda J, Kuhn C, Schnoelzer M, Korf U, Kempf T, Spring H, Hatzfeld M, Franke WW (prosinec 2003). „Nový spojovací systém buňka-buňka: mozaika cortex adhaerens buněk optických vláken“. Journal of Cell Science. 116 (Pt 24): 4985–95. doi:10.1242 / jcs.00815. PMID 14625392.
Haase H, Pagel I, Khalina Y, Zacharzowsky U, osoba V, Lutsch G, Petzhold D, Kott M, Schaper J, Morano I (květen 2004). „Karboxyl-koncová doména ahnak indukuje svazování aktinů a stabilizuje svalovou kontrakci“. FASEB Journal. 18 (7): 839–41. doi:10.1096 / fj.03-0446fje. PMID 15001564. S2CID 11613802.
Lee IH, You JO, Ha KS, Bae DS, Suh PG, Rhee SG, Bae YS (červen 2004). „AHNAK zprostředkovaná aktivace fosfolipázy C-gamma1 prostřednictvím proteinkinázy C“. The Journal of Biological Chemistry. 279 (25): 26645–53. doi:10,1074 / jbc.M311525200. PMID 15033986.
Stiff T, Shtivelman E, Jeggo P, Kysela B (březen 2004). „AHNAK interaguje s komplexem DNA ligáza IV-XRCC4 a stimuluje dvouvláknovou ligaci zprostředkovanou DNA ligázou IV“. Oprava DNA. 3 (3): 245–56. doi:10.1016 / j.dnarep.2003.11.001. PMID 15177040.
Ahn J, Chung KS, Kim DU, Won M, Kim L, Kim KS, Nam M, Choi SJ, Kim HC, Yoon M, Chae SK, Hoe KL (listopad 2004). „Systematická identifikace hepatocelulárních proteinů interagujících s NS5A viru hepatitidy C“. Journal of Biochemistry and Molecular Biology. 37 (6): 741–8. doi:10,5483 / bmbrep.2004.37.6.741. PMID 15607035.
Haase H, Alvarez J, Petzhold D, Doller A, Behlke J, Erdmann J, Hetzer R, Regitz-Zagrosek V, Vassort G, Morano I (prosinec 2005). „Ahnak je zásadní pro funkci vápníkového kanálu Ca (V) 1.2 v srdci a jeho beta-adrenergní regulaci.“ FASEB Journal. 19 (14): 1969–77. doi:10.1096 / fj.05-3997com. PMID 16319140. S2CID 9585089.
Tompkins V, Hagen J, viceprezident Zediak, Quelle DE (březen 2006). "Identifikace nových vazebných proteinů ARF pomocí dvouhybridního screeningu". Buněčný cyklus. 5 (6): 641–6. doi:10,4161 / cc. 5.6.6560. PMID 16582619.
De Seranno S, Benaud C, Assard N, Khediri S, Gerke V, Baudier J, Delphin C (listopad 2006). "Identifikace vazebného motivu AHNAK specifického pro tetramer Annexin2 / S100A10". The Journal of Biological Chemistry. 281 (46): 35030–8. doi:10,1074 / jbc.M606545200. PMID 16984913.

externí odkazy

Člověk AHNAK umístění genomu a AHNAK stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124942 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000069833 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7987395-5] James MR, Richard CW, Schott JJ, Yousry C, Clark K, Bell J, Terwilliger JD, Hazan J, Dubay C, Vignal A (září 1994). "Radiační hybridní mapa 506 STS markerů překlenujících lidský chromozom 11". Genetika přírody. 8 (1): 70–6. doi:10.1038 / ng0994-70. PMID 7987395. S2CID 21392416.

[pmid12153988-6] Hohaus A, Osoba V, Behlke J, Schaper J, Morano I, Haase H (srpen 2002). „Karboxylová koncová oblast ahnaku poskytuje spojení mezi srdečními kanály Ca2 + typu L a cytoskeletem na bázi aktinu“. FASEB Journal. 16 (10): 1205–16. doi:10.1096 / fj.01-0855com. PMID 12153988. S2CID 12413536.

[entrez-7] "Entrez Gene: AHNAK AHNAK nukleoprotein (desmoyokin)".

[pmid2677021-8] Hieda Y, Tsukita S, Tsukita S (říjen 1989). „Nový protein s vysokou molekulovou hmotností vykazující jedinečnou lokalizaci v desmosomálním plaku“. The Journal of Cell Biology. 109 (4 Pt 1): 1511–8. doi:10.1083 / jcb.109.4.1511. PMC 2115823. PMID 2677021.

[pmid20388789-9] Shankar J, Messenberg A, Chan J, Underhill TM, Foster LJ, Nabi IR (květen 2010). „Pseudopodiální aktinová dynamika řídí epiteliálně-mezenchymální přechod v metastatických rakovinných buňkách“. Výzkum rakoviny. 70 (9): 3780–90. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-09-4439. PMID 20388789.

[pmid11312263-10] Gentil BJ, Delphin C, Mbele GO, Deloulme JC, Ferro M, Garin J, Baudier J (červen 2001). „Obří protein AHNAK je specifickým cílem pro protein S100B vázající vápník a zinek: potenciální důsledky pro regulaci homeostázy Ca2 + pomocí S100B“. The Journal of Biological Chemistry. 276 (26): 23253–61. doi:10,1074 / jbc.M010655200. PMID 11312263.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]