Rodina AGCS - AGCS family - Wikipedia
| Alanin / glycin: proteinový kationový symportér (AGCS) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | A3P053 | ||||||||
| Pfam | PF01235 | ||||||||
| InterPro | IPR001463 | ||||||||
| STRÁNKA | PS00873 | ||||||||
| |||||||||
Členové Rodina Alanine nebo Glycine: Cation Symporter (AGCS) (TC # 2.A.25 ) doprava alanin a / nebo glycin v symport s Na+ a nebo H+.
Struktura a funkce
Známé proteiny v rodině AGCS mají délku mezi 445 a 550 aminoacylovými zbytky a mají 8 až 12 domnělých transmembránových a-šroubovicových klíčů. Členové mohou mít 11 transmembránových segmentů (TMS), jak se zdá být pravdivé pro DagA (TC # 2.A.25.1.1 ) a AgcS (TC # 2.A.25.1.3 ), ačkoli Acp (TC # 2.A.25.1.2 ) má pouze 8 TMS, možná výsledek zkrácení. Počátkem roku 2016 se nezdá, že by pro tyto proteiny byla k dispozici žádná data o 3D krystalové struktuře. Členové rodiny AGCS byli nalezeni v bakteriích a archaeách, jako jsou extremofilní halotolerantní sinice Aphanothece halophytica, a termofilní bakterie, Bacil PS3.[1][2] Od roku 2015 byly funkčně charakterizovány pouze tři členové rodiny. Tyto proteiny vykazují omezenou sekvenční podobnost v rodině APC (TC # 2.A.3 ).[3] Počátkem roku 2016 se nezdá, že by pro členy rodiny AGCS byly k dispozici nějaké krystalové struktury.
Transportní reakce
Zobecněná transportní reakce katalyzovaná rodinou AGCS je:[3]
alanin nebo glycin (out) + Na+ nebo H+ (out) → alanin nebo glycin (in) + Na+ nebo H+ (v).
Proteiny v rodině AGCS
V současné době existuje 10 proteinů patřících do rodiny AGCS. Tyto proteiny a jejich popisy lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.
Reference
- ^ Bualuang A, Kageyama H, Tanaka Y, Incharoensakdi A, Takabe T (2015). "Funkční charakterizace člena alaninu nebo glycinu: rodina kationových symportérů u halotolerantních sinic Aphanothece halophytica". Bioscience, biotechnologie a biochemie. 79 (2): 230–5. doi:10.1080/09168451.2014.968091. PMID 25421789. S2CID 205616830.
- ^ Kanamori M, Kamata H, Yagisawa H, Hirata H (březen 1999). "Nadměrná exprese genu nosného proteinu alaninu z termofilní bakterie PS3 v Escherichia coli". Journal of Biochemistry. 125 (3): 454–9. doi:10.1093 / oxfordjournals.jbchem.a022308. PMID 10050032.
- ^ A b Saier MH. „2.A.25 Rodina Alaninů nebo Glycinů: Cation Symporter (AGCS)“. Databáze klasifikace transportérů. Saier Lab Bioinformatics Group / SDSC.
Další čtení
- Rodionov DA, Hebbeln P, Eudes A, ter Beek J, Rodionova IA, Erkens GB, Slotboom DJ, Gelfand MS, Osterman AL, Hanson AD, Eitinger T (leden 2009). „Nová třída modulárních transportérů pro vitamíny u prokaryot“. Journal of Bacteriology. 191 (1): 42–51. doi:10.1128 / JB.01208-08. PMC 2612444. PMID 18931129.
- Kamata H, Akiyama S, Morosawa H, Ohta T, Hamamoto T, Kambe T, Kagawa Y, Hirata H (říjen 1992). "Primární struktura alaninového nosného proteinu termofilní bakterie PS3". The Journal of Biological Chemistry. 267 (30): 21650–5. PMID 1400476.
Do tato úprava, tento článek používá obsah z „2.A.25 Rodina Alaninů nebo Glycinů: Cation Symporter (AGCS)“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.
 | Tento membránový protein –Příbuzný článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |