Žlutý fluorescenční protein - Yellow fluorescent protein

žlutý fluorescenční protein, Zoanthus

Žlutý fluorescenční protein (YFP) je genetický mutant zelený fluorescenční protein (GFP) původně odvozený z Medúza Aequorea victoria. Jeho excitační vrchol je 514 nm a jeho emisní vrchol je 527 nm. Stejně jako mateřský GFP je YFP užitečným nástrojem buňka a molekulární biologie díky svým vlastnostem užitečným pro fluorescenční mikroskopie.

Tři vylepšené verze YFP jsou Citrine, Venus a Ypet. Mají sníženou citlivost na chloridy, rychlejší zrání a zvýšený jas (definovaný jako produkt produktu) koeficient zániku a kvantový výnos ). Typicky YFP slouží jako akceptor pro geneticky kódované FRET senzory, jejichž nejpravděpodobnějším dárcem FP je monomerní azurová fluorescenční bílkovina (mCFP). Červený posun vzhledem k GFP je způsoben a Stohování Pi-Pi interakce v důsledku substituce T203Y zavedené mutací, která podstatně zvyšuje polarizovatelnost lokálního chromofor prostředí a také poskytuje další hustotu elektronů do chromoforu.

„Venuše“ obsahuje novou aminokyselinovou substituci –F46L–, která urychluje oxidaci chromoforu při teplotě 37 ° C, což je krok omezující rychlost zrání. Protein má další substituce (F64L / M153T / V163A / S175G), což umožňuje dobře se Venuše složit a dává jí relativní toleranci vůči acidóze a Cl−.[1]

Viz také

Reference

  1. ^ Nagai, T; Ibata, K; Park, E. S .; Kubota, M; Mikoshiba, K; Miyawaki, A (2002). "Varianta žlutého fluorescenčního proteinu s rychlým a účinným zráním pro buněčné biologické aplikace". Přírodní biotechnologie. 20 (1): 87–90. doi:10.1038 / nbt0102-87. PMID  11753368.

externí odkazy

  • Úvod do fluorescenčních proteinů
  • EYFP na FPbase
  • Miyawaki, Atsushi; Llopis, Juan; Heim, Roger; McCaffery, J. Michael; Adams, Joseph A .; Ikura, Mitsuhiko; Tsien, Roger Y. (1997). "Fluorescenční indikátory pro Ca2 + na základě zelených fluorescenčních proteinů a kalmodulinu". Příroda. 388 (6645): 882–7. doi:10.1038/42264. PMID  9278050.