YAF2 - YAF2

YAF2

Protein YAF2 PDB 2d9g.png

Dostupné struktury

Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2D9G

Identifikátory

YAF2, YY1 asociovaný faktor 2

Externí ID

OMIM: 607534 HomoloGene: 136401 Genové karty: YAF2

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 12 (lidský)^[1]

Kapela	12q12	Start	42,157,104 bp^[1]
Kapela	12q12	Konec	42,238,349 bp^[1]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba kovových iontů • GO: Aktivita transkripčního koaktivátoru 0001105 • GO: Aktivita transkripčního corepresoru 0001106
Buněčná složka	• buněčné jádro • cytosol • nukleoplazma
Biologický proces	• pozitivní regulace transkripce, chráněná DNA • negativní regulace transkripce, chráněná DNA • regulace transkripce, DNA-šablony • transkripce, chráněná DNA • negativní regulace přechodu G0 na G1
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


10138


n / a


ENSG00000015153


n / a


Q8IY57


n / a

RefSeq (mRNA)

NM_001012424 NM_001190977 NM_001190979 NM_001190980 NM_005748
NM_001320080


n / a

RefSeq (protein)


NP_001177906 NP_001177908 NP_001177909 NP_001307009 NP_005739


n / a

Místo (UCSC)

Chr 12: 42,16 - 42,24 Mb

n / a

PubMed Vyhledávání

^[2]

n / a

Zobrazit / upravit člověka

Faktor 2 související s YY1 je protein že u lidí je kódován YAF2 gen.^[3]^[4]

Protein kódovaný tímto genem interaguje s YY1, proteinem se zinkovým prstem, který se podílí na negativní regulaci genů omezených na svaly. Tento genový produkt samotný obsahuje jediný N-koncový zinkový prst C2-X10-C2 a na rozdíl od YY1 je během myogenní diferenciace up-regulován. Rovněž usnadňuje proteolytické štěpení YY1 proteázou aktivovanou vápníkem, m-kalpainem, což naznačuje mechanismus, kterým tento protein antagonizuje negativní účinek YY1.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000015153 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kalenik JL, Chen D, Bradley ME, Chen SJ, Lee TC (březen 1997). „Kvasinkové dvouhybridní klonování nového proteinu se zinkovým prstem, který interaguje s multifunkčním transkripčním faktorem YY1“. Nucleic Acids Res. 25 (4): 843–9. doi:10.1093 / nar / 25.4.843. PMC 146511. PMID 9016636.
^ ^A ^b „Entrez Gene: YAF2 YY1 associated factor 2“.

Další čtení

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Mädge B, Geisen C, Möröy T, Schwab M (2003). "Yaf2 inhibuje biologickou funkci Myc". Cancer Lett. 193 (2): 171–6. doi:10.1016 / S0304-3835 (02) 00696-1. PMID 12706874.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ogawa H, Ishiguro K, Gaubatz S a kol. (2002). "Komplex s modifikátory chromatinu, který obsazuje geny reagující na E2F a Myc v buňkách G0". Věda. 296 (5570): 1132–6. doi:10.1126 / science.1069861. PMID 12004135. S2CID 34863978.
Sawa C, Yoshikawa T, Matsuda-Suzuki F a kol. (2002). „YEAF1 / RYBP a YAF-2 jsou funkčně odlišnými členy rodiny kofaktorů pro transkripční faktory YY1 a E4TF1 / hGABP“. J. Biol. Chem. 277 (25): 22484–90. doi:10,1074 / jbc.M203060200. PMID 11953439.
Bannasch D, Mädge B, Schwab M (2001). "Funkční interakce Yaf2 s centrální oblastí MycN". Onkogen. 20 (41): 5913–9. doi:10.1038 / sj.onc.1204747. PMID 11593398.

externí odkazy

YAF2 umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
YAF2 podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.