VqmR sRNA - VqmR sRNA
| VqmR sRNA | |
|---|---|
 Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence malé RNA VqmR | |
| Identifikátory | |
| Rfam | RF02834 |
| Další údaje | |
| Domény | Bakterie |
| JÍT | GO termín musí začínat GO:, GO termín musí začínat GO:, GO termín musí začínat GO: |
| TAK | SO: 0000370 |
| PDB struktur | PDBe |
VqmR malá RNA byl objeven v Vibrio cholerae, bakterie, která může způsobit cholera pomocí diferenciálu Sekvenování RNA (sRNA-seq) za podmínek nízké a vysoké hustoty buněk, které byly použity ke studiu snímání kvora (QS).[1] Ovládací prvky QS virulence a biofilm formace v Vibrio cholerae; dříve bylo prokázáno, že je řízen Qrr sRNA.[2][3] Ukázalo se, že VqmR potlačuje výraz více mRNA včetně rtx (opakuje se v toxinu) toxinové geny a vpsT , který je nutný pro tvorbu biofilmu. Ve skutečnosti je to VqmR vysoce konzervativní v vibrionaceae, Bylo prokázáno, že silně inhibuje tvorbu biofilmu pomocí potlačující the vpsT gen; mohlo by to být spojení mezi tvorbou biofilmu a QS.[1]
Reference
- ^ A b Papenfort K, Förstner KU, Cong JP, Sharma CM, Bassler BL (únor 2015). „Diferenciální sekvence RNA Vibrio cholerae identifikuje malou RNA VqmR jako regulátor tvorby biofilmu“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 112 (7): E766–775. doi:10.1073 / pnas.1500203112. PMC 4343088. PMID 25646441.
- ^ Lenz DH, Mok KC, Lilley BN, Kulkarni RV, Wingreen NS, Bassler BL (červenec 2004). „Malý RNA chaperon Hfq a několik malých RNA řídí snímání kvora u Vibrio harveyi a Vibrio cholerae“. Buňka. 118 (1): 69–82. doi:10.1016 / j.cell.2004.06.009. PMID 15242645.
- ^ Bardill JP, Zhao X, Hammer BK (červen 2011). „Reakce snímání kvora Vibrio cholerae je zprostředkována interakcemi párování bází sRNA / mRNA závislými na Hfq“. Molekulární mikrobiologie. 80 (5): 1381–1394. doi:10.1111 / j.1365-2958.2011.07655.x. PMID 21453446.
 | Tento molekulární nebo buněčná biologie článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |