Viunavirus - Viunavirus
Viunavirus | |
---|---|
Klasifikace virů ![]() | |
(bez hodnocení): | Virus |
Oblast: | Duplodnaviria |
Království: | Heunggongvirae |
Kmen: | Uroviricota |
Třída: | Caudoviricetes |
Objednat: | Caudovirales |
Rodina: | Myoviridae |
Rod: | Viunavirus |
Druh | |
Viunavirus je rod bakteriofágy v Myoviridae rodina. V současné době tento rod obsahuje šest druhů.[1]
Charakterizace
Členové Viunavirus rod sdílejí řadu funkcí, které se odlišují od ostatních členů skupiny Myoviridae rodina. Hlavy těchto fágů jsou icosahedral v přírodě. Jejich ocasy jsou dále složeny z límce s krkem (strukturou podobného jako u a F4 fág ), „Plášť obklopující ocasní trubici nebo jádro, tenký základní deska a adsorpce struktura “Je pozoruhodné, že lze nalézt řadu jedinečných výčnělků vycházejících ze základní desky těchto organismů.[2] U členů rodu byly pozorovány 3 až 4 silné zaoblené hroty (umístěné ve spodní části základní desky) a stejný počet tenčích hvězdicovitých výčnělků (připevněných ke stěnám základní desky pomocí stopky). Žádné další fágy, které byly pozorovány, nevykazovaly podobné symetrické struktury.
Členové rodu jsou si také podobní, pokud jde o genomika. Všechny druhy rodu vykazovaly nad 75% shodnost složení bílkovin. Zatímco „genový řád je silně konzervován u všech sedmi fágů… různých funkční regiony jsou náhodně distribuovány po celém genomu ... “.[2] Funkční shlukování, jak je pozorováno u jiných rodů fágů, ve Viunaviru jednoznačně chybí a prokazuje se jako rozhodující kvalita rodu.
Vzhledem k rozmanitosti vláken ocasu s hroty vědci navrhli, že tyto fágy mohou být schopné infikovat širší škálu hostitelů. Jeden takový příklad již byl pozorován: druh SFP10 úspěšně infikoval rod Salmonella a druhu E-coli. Zatímco všichni členové rodu mají ocasní hroty, je důležité si uvědomit, že každý druh může mít jedinečné hroty, z nichž mnohé je třeba dále zkoumat, aby se určila jejich funkce.
Případová studie
V roce 2013 provedla studie University of Pittsburgh se zabýval analýzou fágu Salmonella Det7, potenciálně nový člen rodu Viunavirus (podobný Salmonella P22, z rodiny Podoviridae ). Det7 sdílí 60 až 90 procent své syntézy nukleotidů s ostatními členy rodu. Testování odhalilo, že kmen Det7 byl schopen infikovat všechny hostitele postižené Salmonella P22 a 9NA, spolu s řadou jedinečných cílů hostitele.[3]
Reference
- ^ Brands, S.J. (comp.). "Taxon: Rod Viunalikevirus". Taxinomicon. Universal Taxonomic Services, Zwaag, Nizozemsko. Citováno 1. června 2014.
- ^ A b Adriaenssens, Evelien M .; et al. (Říjen 2012). „Navrhovaný nový rod bakteriofágů:“ Viunalikevirus"". Archivy virologie. 157 (10): 2035–46. doi:10.1007 / s00705-012-1360-5. PMC 4174289. PMID 22707043.
- ^ Edgar, Robert H (4. února 2014). Vývoj připojení hostitele Bacteriophage pomocí modelu DET7 jako modelu (MSc). University of Pittsburgh. Citováno 1. června 2014.