Turicibacter - Turicibacter

Turicibacter
TuricibacterCells2.png
Turicibacter sp. Buňky H121 pod mikroskopem
Turicibacter sp. Kolonie H121.png
Turicibacter sp. Kolonie H121
Vědecká klasifikace
Doména:
Bakterie
Kmen:
Firmicutes
Třída:
Erysipelotrichia
Objednat:
Erysipelotrichales
Rodina:
Erysipelotrichaceae
Rod:
Turicibacter

Bosshard, Zbinden a Altwegg 2002
Kmeny

Turicibacter sanguinis MOL361
Turicibacter sp. PC909
Turicibacter sp. HGF1
Turicibacter sp. H121
Turicibacter sp. ZCY83

Turicibacter je rod v Firmicutes kmen bakterií, který se nejčastěji vyskytuje ve střevech zvířat.[1]Rod je pojmenován podle města, ve kterém byl poprvé izolován, Curych (Latinsky = Turicum), Švýcarsko.[2]

Fylogeneze

Pozice Turicibacter v rámci Firmicutes nebylo možné vyřešit pomocí analýz založených na genech 16S rRNA. Byl však předběžně zařazen do třídy Bacilli, pak třída Erysipelotrichia.[3]

Ve stromu vytvořeném pomocí zřetězeného vyrovnání proteinu obsahujícího data ze dvou konceptů Turicibacter genomů, skupina byla umístěna na základně třídy Bacilli.[4] Pozdější analýzy, které také zahrnovaly aminokyselinové sekvence předpovězené úplností Turicibacter genom dospěl ke stejnému závěru.[1]

Reference

  1. ^ A b Auchtung TA, Holder ME, Gesell JR, Ajami NJ, Duarte RT, Itoh K, Caspi RR, Petrosino JF, Horai R, Zárate-Bladés CR (2016). "Kompletní genomová sekvence Turicibacter sp. Kmen H121, izolovaný z výkalů kontaminované myši bez bakterií". Oznámení o genomu. 4 (2): e00114-16. doi:10.1128 / genomA.00114-16. PMC  4807225. PMID  27013036.
  2. ^ Bosshard PP, Zbinden R, Altwegg M (2002). „Turicibacter sanguinis gen. Nov., Sp. Nov., Nová anaerobní, grampozitivní bakterie“. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 52: 1263–1266. doi:10.1099/00207713-52-4-1263. PMID  12148638.
  3. ^ Bosshard PP. "Rod VIII. Turicibacter Bosshard, Zbinden a Altwegg 2002, 1266VP". In De Vos P, Garrity GM, Jones D, Krieg NR, Ludwig W, Rainey FA, ​​Schleifer K, Whitman WB (eds.). Bergeyův manuál systematické bakteriologie, 2. vyd. Firmicutes. Springer. str. 1314–1315.
  4. ^ Segata N, Börnigen D, Morgan XC, Huttenhower C (2013). „PhyloPhlAn je nová metoda pro lepší fylogenetické a taxonomické umístění mikrobů“. Příroda komunikace. 4: 2304. doi:10.1038 / ncomms3304. PMC  3760377. PMID  23942190.