Tombusvirus interní replikační prvek (IRE) - Tombusvirus internal replication element (IRE)

Tombusvirus interní replikační prvek (IRE)
RF00510.jpg
Předpovězeno sekundární struktura a zachování sekvence Tombus_IRE
Identifikátory
SymbolTombus_IRE
RfamRF00510
Další údaje
RNA typCis-reg
DoményViry
TAKSO: 0000233
PDB strukturPDBe

v virologie, tombusvirus interní replikační prvek (IRE) je segmentem RNA nachází se v oblasti kódující p92 polymeráza. Tento prvek je nezbytný pro virová replikace; konkrétně se předpokládá, že je to nutné v rané fázi replikace, jako je nábor šablon a / nebo sestavení komplexu replikáz.[1]

jiný nekódující RNA struktury v Tombusvirus zahrnují 3 'UTR region IV[2] a 5 'UTR.[3][4]

Reference

  1. ^ Monkewich, S; Lin HX; Fabian MR; Xu W; Na H; Ray D; Chernysheva OA; Nagy PD; White KA (2005). „Oblast kódující polymerázu p92 obsahuje interní prvek RNA požadovaný v rané fázi replikace genomu Tombusvirus“. J Virol. 79 (8): 4848–4858. doi:10.1128 / JVI.79.8.4848-4858.2005. PMC  1069561. PMID  15795270.
  2. ^ Fabian MR, Na H, Ray D, White KA (2003). „Sekundární struktury 3'-terminální RNA jsou důležité pro akumulaci DI RNA rajčatového huňatého stunt viru“. Virologie. 313 (2): 567–580. doi:10.1016 / S0042-6822 (03) 00349-0. PMID  12954222.
  3. ^ Wu B, Vanti WB, White KA (2001). „RNA doména v 5 'nepřekládané oblasti genomu rajčatového huňatého kousku viru moduluje replikaci virové RNA“. J. Mol. Biol. 305 (4): 741–756. doi:10.1006 / jmbi.2000.4298. PMID  11162089.
  4. ^ Ray D, Na H, White KA (2004). „Strukturální vlastnosti multifunkční RNA domény ve tvaru T, které zprostředkovávají účinnou replikaci RNA rajčatového huňatého stunt viru“. J. Virol. 78 (19): 10490–10500. doi:10.1128 / JVI.78.19.10490-10500.2004. PMC  516415. PMID  15367615.

externí odkazy