Virus tabáku - Tobacco etch virus

Virus tabáku
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Riboviria
Království:Orthornavirae
Kmen:Pisuviricota
Třída:Stelpaviricetes
Objednat:Patatavirales
Rodina:Potyviridae
Rod:Potyvirus
Druh:
Virus tabáku
Synonyma

virus datura Z
virus těžkého leptání tabáku
virus rajče

Virus tabáku (TEV) je rostlinný patogenní virus[1] v rodu Potyvirus a rodina virů Potyviridae. Stejně jako ostatní členové rodu Potyvirus je TEV monopartitním vláknem jednovláknové RNA pozitivního smyslu obklopené kapsidou vyrobenou z jediného proteinu kódovaného virem. Virus je vláknitá částice o délce přibližně 730 nm. Je přenosný netrvalým způsobem více než 10 druhy mšic včetně Myzus persicae. Také se snadno přenáší mechanickými prostředky, ale není známo, že se přenáší semeny.[2]

Rozsah hostitelů

Tento virus infikuje mnoho druhů Solanaceae. Mezi zemědělsky významné plodiny, které infikuje, patří několik druhů Paprika (tj. C. annuum, C. frutescens), rajče (Lycopersicon esculentum ), a tabák (Nicotiana spp.).

Infikuje také mnoho vytrvalých druhů plevelů, které mohou působit jako virové nádrže pro citlivé zemědělské plodiny. Mezi tyto druhy plevelů patří Solanum nigrum (lilek), S. aculeatissimum (soda jablko), Chenopodium album (prasátko), Datura stramonium (jedovatý plevel), Linaria canadensis (modrá muchomůrka) a Physalis spp. (mletá třešeň). Doporučení pro kontrolu tohoto viru tedy zahrnují kontrolu plevelů v citlivých plodinách čelistí a v jejich okolí.[3]

Příznaky a symptomy

Příznaky pozorované na rostlinách infikovaných tímto virem se mohou lišit v závislosti na rostlině. Mezi typické příznaky však patří čištění žil, mramorování a nekrotické linie nebo leptání. Příznaky se mohou objevit na listech a plodech a rostliny mohou být zakrnělé.[4] (Obrázky příznaků naleznete v této příručce.)

Stejně jako ostatní potyviry vytváří TEV virové inkluze, které lze pozorovat ve světelném mikroskopu, pokud jsou správně obarveny.[5][6][7] Tento konkrétní potyvirus vytváří dva druhy inkluzí, které lze diagnostikovat u známého hostitele. Jednou z inkluzí jsou cylindrické inkluze nalezené v cytoplazmě infikovaných buněk a druhá inkluze se nachází v jádře. Ve skvrně nukleové kyseliny (AzureA) se neobarví ani jeden typ inkluze.

Zahrnutí viru Tobch etch (u různých hostitelů).

Geografické rozdělení

TEV se jeví jako virus, který se vyvinul v Novém světě.[8] Bylo hlášeno z Kanady, USA (včetně Havaje), Mexika a Portorika v Severní Americe a z Venezuely v Jižní Americe. (2)

Kromě chorob rostlin

Potyvirová RNA kóduje alespoň 7 různých proteinů.[9] Jedním z nich je proteáza TEV proteáza je vysoce místně specifická proteáza, kterou biochemici využili ve svůj prospěch k vytvoření a čištění bílkovin systém začleněním rozpoznávacího místa TEV proteázy do značek pro čištění proteinu.

Vytvoří se genový konstrukt obsahující protein, který je středem zájmu, fúzovaný s rozpoznávacím místem TEV proteázy, následovaný afinitní značka, jako je a Polyhistidinová značka. Následující afinitní chromatografie, purifikovaný protein se poté zpracuje s TEV proteázou. TEV proteáza se štěpí na svém rozpoznávacím místě a odstraňuje afinitní značku. To umožňuje afinitní čištění proteinů, které se při fúzování s proteinovými značkami nesprávně chovají.[10]

Reference

  1. ^ „O rostlinných virech / Materiál a metody detekce virových inkluzí / Rostlinné viry na Floridě a jejich inkluze / Věda / Rostlinný průmysl / Divize a kanceláře / Domů - Florida Department of Agriculture & Consumer Services“. www.freshfromflorida.com.
  2. ^ Antoniw, John. „Show DPV and Refs in Frame“. www.dpvweb.net.
  3. ^ L. L. Breman (červenec 1987). „Virus tabáku (PDF). Rostlinná patologie oběžník č. 297 Fla. Odd. Agric. & Zákaznická obsluha. Citováno 12. července 2017.
  4. ^ „Tobacco Etch Virus Potyvirus TEV“. www.invasive.org.
  5. ^ „Materiál a metody detekce virových inkluzí / Florida Plant Viruses and their Inclusion / Věda / Rostlinný průmysl / Divize a kanceláře / Domů - Florida Department of Agriculture & Consumer Services“. www.freshfromflorida.com. Archivovány od originál dne 2014-10-13.
  6. ^ Christie, R.G. a Edwardson, J. R. (1977). Fla Agric. Exp. Stn Monog. Č. 9, 150 stran
  7. ^ „Diagnóza / Materiál a metody detekce virových inkluzí / Viry rostlin na Floridě a jejich inkluze / Věda / Rostlinný průmysl / Divize a kanceláře / Domů - Ministerstvo zemědělství a spotřebitelských služeb na Floridě“. www.freshfromflorida.com.
  8. ^ Gibbs A, Ohshima K (2010). „Potyviry a digitální revoluce“. Annu Rev Phytopathol. 48: 205–23. doi:10.1146 / annurev-phyto-073009-114404. PMID  20438367.
  9. ^ Adam C. Winterhalter. „Potyvirus“. Archivovány od originál dne 2005-07-20.
  10. ^ Jenny RJ, Mann KG, Lundblad RL (2003). "Kritický přehled metod štěpení fúzních proteinů trombinem a faktorem Xa". Protein Expr. Purif. 31 (1): 1–11. doi:10.1016 / S1046-5928 (03) 00168-2. PMID  12963335.

externí odkazy