TimeTree - TimeTree - Wikipedia

TimeTree
Logo TimeTree. Png
Stabilní uvolnění
v4.0
TypBioinformatika
LicenceFreeware
webová stránkawww.timetree.org

TimeTree je bezplatná veřejná databáze vyvinutá S. Blairem Hedgesem a Sudhir Kumar, nyní v Temple University, za prezentaci časů divergence v strom života.[1][2] Základní koncepcí bylo vytvořit a představit společný konsensus o časovém plánu života [3][4] z publikovaných studií, kterých je nyní 3 998, a umožňují snadný přístup k těmto informacím na webu nebo v mobilním zařízení.[2] Databáze umožňuje hledat průměrné časy uzlů mezi dvěma druh nebo vyšší taxony a budování rozvrhu života [4] pro vyšší taxony. TimeTree se používá ve veřejném školství k pojetí vývoje života, například na středoškolských zařízeních.[5] Původní vývoj TimeTree se datuje do konce 90. let s počáteční podporou od Astrobiologický ústav NASA. Od té doby je podporován dalšími granty od NASA, a tím NSF a NIH.

Funkce

Uživatelé TimeTree mohou vyhledávat názvy dvou druhů, jako je kočka a pes, a získat tak průměrné a střední časové odhady jejich odchylek v milionech let. Výsledky také ukazují všechny jednotlivé časové odhady z každé studie vedle geologické časové osy s uvedením geologických období. Samostatně tabulka uvádí časové odhady, ke stažení jako tabulku, z každé studie spolu s odkazy a odkazy na abstrakty původních článků. Databáze také umožňuje vyhledávat články s časovým rozvrhem podle jména autora. Celá kniha Časový plán života[3] je také prezentován na webu.

Reference

  1. ^ Hedges SB, Dudley J, Kumar S (2006). „TimeTree: Veřejná znalostní báze rozdílných časů mezi organismy“. Bioinformatika. 22 (23): 2971–2. doi:10.1093 / bioinformatika / btl505. PMID  17021158.
  2. ^ A b Kumar S, Hedges, SB (2011). „TimeTree2: times divergence times on the iPhone“. Bioinformatika. 27 (14): 2023–4. doi:10.1093 / bioinformatika / btr315. PMC  3129528. PMID  21622662.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  3. ^ A b Hedges SB, Kumar S (2009). TimeTree of Life. New York: Oxford University Press. ISBN  978-0199535033.
  4. ^ A b Hedges SB, Marin J, Suleski M, Paymer M & Kumar S (2015). „Strom života odhaluje spiknutí a diverzifikaci podobné hodinám“. Mol. Biol. Evol. 32 (4): 835–845. arXiv:1412.4312. doi:10.1093 / molbev / msv037. PMC  4379413. PMID  25739733.CS1 maint: více jmen: seznam autorů (odkaz)
  5. ^ Metzger KJ (2011). „Pomáháme studentům s koncepcí událostí divergence druhů pomocí online nástroje“ TimeTree: The Timecale of Life"". Americký učitel biologie. 73 (2): 106–108. doi:10.1525 / abt.2011.73.2.9. S2CID  85026876.

externí odkazy