Cílené sledování projekce - Targeted projection pursuit - Wikipedia

V tomto příkladu se cílené sledování projekce používá k prozkoumání projekcí a genová exprese soubor dat. Každý ze 122 bodů odpovídá vzorku odebranému z rakoviny nádor čtyř diagnostických tříd (znázorněno barvou). U každého vzorku byla zaznamenána úroveň exprese 100 genů (představovaná osami). Animace ukazuje, že TPP dokáže oddělit dvě třídy jasně (červenou a fialovou), ale dvě další nelze rozlišit (modrá a zelená). Poloha os pak indikuje aktivaci, které geny jsou nejvíce spojeny s každou třídou.

Cílené sledování projekce je typ statistické techniky používané pro průzkumná analýza dat, informační vizualizace, a výběr funkcí. Umožňuje uživateli interaktivně prozkoumat velmi složitá data (obvykle s desítkami až stovkami atributů), aby našel vlastnosti nebo vzorce potenciálního zájmu.

Konvenční nebo „slepý“, pronásledování projekce, najde nejzajímavější možné projekce ve vícerozměrných datech pomocí a vyhledávací algoritmus která optimalizuje určité pevné kritérium „zajímavosti“ - například odchylku od a normální distribuce. Naproti tomu cílené sledování projekce umožňuje uživateli prozkoumat prostor projekcí manipulací s datovými body přímo v interaktivním prostředí bodový diagram.

Cílená projekce našla uplatnění v DNA microarray analýza dat,^[1] protein sekvenční analýza,^[2] rozložení grafu^[3] a zpracování digitálních signálů.^[4] Je k dispozici jako balíček pro WEKA strojové učení sada nástrojů.

Reference

^ Faith, Joseph; Robert Mintram; Maia Angelova (2006). „Cílená projekce pro vizualizaci klasifikace dat genových výrazů“ (PDF). Bioinformatika. 22 (21): 2667–267. doi:10.1093 / bioinformatika / btl463. PMID 16954139.
^ Haddow, Chris; Marcus Durrant; Justin Perry; Joe Faith (2011). "Predikce funkčních zbytků přiřazení sekvence proteinů jako úkol výběru funkce". International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 5 (6): 691–705. doi:10.1504 / IJDMB.2011.045417. PMID 22295751.
^ Gibson, Helen; Joe Faith (2011). „Rozložení grafu uzlu s atributem pro sítě malého světa“. Sborník z 15. mezinárodní konference o vizualizaci informací.
^ Sujan, Rajbhandari; Joe Faith (2010). "Využití lineárních projekcí při vizuální analýze signálů ve vnitřním optickém bezdrátovém spojení". 7. mezinárodní symposium o komunikačních systémech, sítích a digitálním zpracování signálů (CSNDSP 2010) 2010. IEEE. 576–581. doi:10.1109 / CSNDSP16145.2010.5580367. ISBN 978-1-4244-8858-2.

Další čtení

Joe Faith (2007) „Cílená projekce za interaktivním průzkumem mnohorozměrných datových sad“, Sborník z 11. mezinárodní konference o vizualizaci informací

externí odkazy

imDEV bezplatný doplněk Excel pro cílené projekce pomocí výběru funkcí ve spojení s PLS a PLS-DA
Stránka projektu Cílená projekce

Tento statistika související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Faith, Joseph; Robert Mintram; Maia Angelova (2006). „Cílená projekce pro vizualizaci klasifikace dat genových výrazů“ (PDF). Bioinformatika. 22 (21): 2667–267. doi:10.1093 / bioinformatika / btl463. PMID 16954139.

[2] Haddow, Chris; Marcus Durrant; Justin Perry; Joe Faith (2011). "Predikce funkčních zbytků přiřazení sekvence proteinů jako úkol výběru funkce". International Journal of Data Mining and Bioinformatics. 5 (6): 691–705. doi:10.1504 / IJDMB.2011.045417. PMID 22295751.

[3] Gibson, Helen; Joe Faith (2011). „Rozložení grafu uzlu s atributem pro sítě malého světa“. Sborník z 15. mezinárodní konference o vizualizaci informací.

[4] Sujan, Rajbhandari; Joe Faith (2010). "Využití lineárních projekcí při vizuální analýze signálů ve vnitřním optickém bezdrátovém spojení". 7. mezinárodní symposium o komunikačních systémech, sítích a digitálním zpracování signálů (CSNDSP 2010) 2010. IEEE. 576–581. doi:10.1109 / CSNDSP16145.2010.5580367. ISBN 978-1-4244-8858-2.

[1]

[2]

[3]

[4]