Cílené sekvenční analýzy - Targeted analysis sequencing - Wikipedia

Cílené sekvenční analýzy (někdy nazývané cílové sekvenování amplikonu) (TAS) je a sekvenování DNA nové generace technika se zaměřením na amplikony a specifické geny.^[1] Je užitečný v populační genetice, protože se může zaměřit na velkou rozmanitost organismů. Přístup TAS zahrnuje bioinformatika techniky k produkci velkého množství dat za zlomek nákladů spojených s Sangerovo sekvenování. TAS je také užitečný ve studiích DNA, protože umožňuje amplifikaci potřebné genové oblasti pomocí PCR, na kterou navazují platformy pro sekvenování nové generace. Sekvenování nové generace používá kratší čtení 50–400 základní páry které umožňují rychlejší sekvenování více vzorků. TAS tedy umožňuje levnější postup sekvenování, který je snadno škálovatelný a nabízí spolehlivost i rychlost.^[2]

Reference

^ Bybee, Seth M .; Bracken-Grissom, Heather (13. října 2011). et al. „Targeted Amplicon Sequencing (TAS): a Scalable Next-Gen Access to Multilocus, Multitaxa Phylogenetics“. Biologie genomu a evoluce. 3: 1312–1323. doi:10.1093 / gbe / evr106. PMC 3236605. PMID 22002916.
^ Masser, D.R .; Stanford, D.R .; Freeman, W.M. (24. února 2015). „Cílená analýza methylace DNA sekvenováním nové generace“. Žurnál vizualizovaných experimentů. 96: 52488. doi:10.3791/52488. PMC 4354667. PMID 25741966.

Tento genetika článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[1] Bybee, Seth M .; Bracken-Grissom, Heather (13. října 2011). et al. „Targeted Amplicon Sequencing (TAS): a Scalable Next-Gen Access to Multilocus, Multitaxa Phylogenetics“. Biologie genomu a evoluce. 3: 1312–1323. doi:10.1093 / gbe / evr106. PMC 3236605. PMID 22002916.

[2] Masser, D.R .; Stanford, D.R .; Freeman, W.M. (24. února 2015). „Cílená analýza methylace DNA sekvenováním nové generace“. Žurnál vizualizovaných experimentů. 96: 52488. doi:10.3791/52488. PMC 4354667. PMID 25741966.

[1]

[2]