TP53I3 - TP53I3

TP53I3
Dostupné struktury
PDB	Lidské vyhledávání UniProt: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2J8Z, 2OBY
Identifikátory
Aliasy	TP53I3, PIG3, indukovatelný protein nádorového proteinu p53 3
Externí ID	OMIM: 605171 HomoloGene: 36617 Genové karty: TP53I3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	24,085,861 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita oxidoreduktázy; • aktivita homodimerizace proteinu; • Vazba NADPH; • chinonová vazba; • NADPH: aktivita chinon reduktázy;
Buněčná složka	• cytosol;
Biologický proces	• Metabolický proces NADP; • oxidačně-redukční proces; • regulace apoptotického procesu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9540
	n / a
	ENSG00000115129
	n / a
	Q53FA7
	n / a
	NM_001206802; NM_004881; NM_147184
	n / a
	NP_001193731; NP_004872; NP_671713
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Předpokládaná chinonoxidoreduktáza je enzym že u lidí je kódován TP53I3 gen.^[3]^[4]^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je podobný oxidoreduktázy, což jsou enzymy podílející se na buněčných reakcích na oxidační stres a ozařování. Tento gen je indukován supresor nádoru p53 a předpokládá se, že je zapojen do buněčné smrti zprostředkované p53. Obsahuje konsensuální vazebné místo p53 ve své promotorové oblasti a pentanukleotid po směru mikrosatelitní sekvence. Ukázalo se, že P53 transkripčně aktivuje tento gen interakcí s následnou pentanukleotidovou mikrosatelitovou sekvencí. Mikrosatelit je polymorfní s různým počtem opakování pentanukleotidu přímo korelovalo s rozsahem transkripční aktivace p53. Bylo navrženo, že mikrosatelitní polymorfismus může být spojen s rozdílnou náchylností k rakovina. Pro tento gen byly nalezeny alespoň dvě varianty transkriptu kódující stejný protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115129 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Contente A, Dittmer A, Koch MC, Roth J, Dobbelstein M (březen 2002). "Polymorfní mikrosatelit, který zprostředkovává indukci PIG3 p53". Nat Genet. 30 (3): 315–20. doi:10.1038 / ng836. PMID 11919562. S2CID 19112465.
^ Flatt PM, Polyak K, Tang LJ, Scatena CD, Westfall MD, Rubinstein LA, Yu J, Kinzler KW, Vogelstein B, Hill DE, Pietenpol JA (červenec 2000). "p53-závislá exprese PIG3 během proliferace, genotoxického stresu a reverzibilní zástavy růstu". Cancer Lett. 156 (1): 63–72. doi:10.1016 / S0304-3835 (00) 00441-9. PMID 10840161.
^ Porte S, Valencia E, Yakovtseva EA, Borras E, Shafqat N, Debreczeny JE, Pike AC, Oppermann U, Farres J, Fita I, Pares X (červen 2009). „Trojrozměrná struktura a enzymatická funkce proapoptotické lidské p53-indukovatelné chinonoxidoreduktázy PIG3“. J Biol Chem. 284 (25): 17194–205. doi:10.1074 / jbc.M109.001800. PMC 2719357. PMID 19349281.
^ ^A ^b „Entrez Gene: TP53I3 tumor protein p53 indukovatelný protein 3“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Polyak K, Xia Y, Zweier JL a kol. (1997). "Model pro apoptózu indukovanou p53". Příroda. 389 (6648): 300–5. doi:10.1038/38525. PMID 9305847. S2CID 4429638.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nicholls CD, Shields MA, Lee PW a kol. (2004). „Alternativní sestřih závislý na UV záření odděluje aktivitu p53 a funkci genu PIG3 rychlou proteolytickou degradací“. J. Biol. Chem. 279 (23): 24171–8. doi:10,1074 / jbc.M401049200. PMID 15067011.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Hillier LW, Graves TA, Fulton RS a kol. (2005). "Generování a anotace sekvencí DNA lidských chromozomů 2 a 4". Příroda. 434 (7034): 724–31. doi:10.1038 / nature03466. PMID 15815621.
Rohaly G, Chemnitz J, Dehde S a kol. (2005). „Nová lidská izoforma p53 je podstatným prvkem kontrolního bodu fáze ATR-intra-S“. Buňka. 122 (1): 21–32. doi:10.1016 / j.cell.2005.04.032. PMID 16009130. S2CID 2350226.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115129 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11919562-3] Contente A, Dittmer A, Koch MC, Roth J, Dobbelstein M (březen 2002). "Polymorfní mikrosatelit, který zprostředkovává indukci PIG3 p53". Nat Genet. 30 (3): 315–20. doi:10.1038 / ng836. PMID 11919562. S2CID 19112465.

[pmid10840161-4] Flatt PM, Polyak K, Tang LJ, Scatena CD, Westfall MD, Rubinstein LA, Yu J, Kinzler KW, Vogelstein B, Hill DE, Pietenpol JA (červenec 2000). "p53-závislá exprese PIG3 během proliferace, genotoxického stresu a reverzibilní zástavy růstu". Cancer Lett. 156 (1): 63–72. doi:10.1016 / S0304-3835 (00) 00441-9. PMID 10840161.

[pmid19349281-5] Porte S, Valencia E, Yakovtseva EA, Borras E, Shafqat N, Debreczeny JE, Pike AC, Oppermann U, Farres J, Fita I, Pares X (červen 2009). „Trojrozměrná struktura a enzymatická funkce proapoptotické lidské p53-indukovatelné chinonoxidoreduktázy PIG3“. J Biol Chem. 284 (25): 17194–205. doi:10.1074 / jbc.M109.001800. PMC 2719357. PMID 19349281.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: TP53I3 tumor protein p53 indukovatelný protein 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]