T-A hol rodina - T-A hol family

The Předpokládaná rodina Holin (T-A Hol) spojená s TMS transglykosylázou (TC # 1.E.43 ) je považována za skupinu holinů, která nepatří do jedné ze sedmi holinských superrodin. Homology zahrnují tisíce různých fágových a bakteriálních proteinů o délce mezi 80 a 140 aminokyselinami (aas), které vykazují 3 až 4 transmembránové segmenty (TMS). Tyto proteiny jsou svou velikostí a topologií podobné holinu a jsou v databázi proteinů NCBI označeny jako „spojené s transglykosylázou“, „Předpokládaný holin“, „Fágový transmembránový protein“, „YeaQ protein“ atd.[1] Počátkem roku 2016 zůstávají funkčně netypické.[2] Pocházejí z široké škály bakteriálních a archaálních kmenů včetně obou Gramnegativní a Grampozitivní bakterie. Tyto proteiny jsou příbuzné rodině RDD (TC # 9.B.45 ) v databázi konzervovaných domén.[2] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny T-A Hol lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.

Viz také

Další čtení

  • Reddy, BL; Saier, MH (2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochim. Biophys. Acta. 1828 (11): 2654–71. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. PMC  3788059. PMID  23856191..
  • Saier, MH; Reddy, BL (2015). „Holiny v bakteriích, eukaryotech a archeaech: multifunkční xenologové s potenciálními biotechnologickými a biomedicínskými aplikacemi“. J. Bacteriol. 197 (1): 7–17. doi:10.1128 / JB.02046-14. PMC  4288690. PMID  25157079..
  • Wang, IN; Smith, DL; Young, R (2000). „Holiny: proteinové hodiny bakteriofágových infekcí“. Annu. Rev. Microbiol. 54: 799–825. doi:10,1146 / annurev.micro. 54.1.799. PMID  11018145..
  • Young, R; Bläsi, U (1995). "Holiny: forma a funkce při lýze bakteriofágů". FEMS Microbiol. Rev. 17 (1–2): 191–205. doi:10.1111 / j.1574-6976.1995.tb00202.x. PMID  7669346..

Reference

  1. ^ Reddy, Bhaskara L .; Saier Jr., Milton H. (01.11.2013). „Topologické a fylogenetické analýzy bakteriálních rodin holinů a superrodin“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1828 (11): 2654–2671. doi:10.1016 / j.bbemem.2013.07.004. PMC  3788059. PMID  23856191.
  2. ^ A b „1.E.43 Předpokládaná rodina Holin (T-A Hol) spojená s TMS transglykosylázou 3-4“. TCDB. Citováno 2016-03-28.

Do tato úprava, tento článek používá obsah z „1.E.43 Předpokládaná rodina Holin (T-A Hol) spojená s TMS transglykosylázou 3-4“, který je licencován způsobem, který umožňuje opětovné použití v rámci Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License, ale ne pod GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky.