Sada nástrojů pro míchu - Spinal Cord Toolbox

Sada nástrojů pro míchu
VývojářiNeuroPoly
Stabilní uvolnění
3.0.3 / 26. dubna 2017; před 3 lety (2017-04-26)
Úložištěgithub.com/ neuropoly/ spinalcordtoolbox
NapsánoKrajta
Operační systémLinux, Mac OS X
Velikost140 MB
K dispozici vAngličtina
TypDigitální zobrazování
LicenceLicence MIT

Sada nástrojů pro míchu (SCT) [1] je sada analytických nástrojů optimalizovaných pro mícha obrázky pořízené pomocí magnetická rezonance. Mezi hlavní funkce patří segmentace, registrace a výpočet anatomických metrik.

Funkce

  • Propseg Automatická segmentace míchy.[2]
  • The Šablona PAM50 je anatomická šablona míchy, která pokrývá celou míchu a mozkový kmen a je k dispozici pro kontrasty MRI vážené T1, T2 a T2 *. Šablona PAM50 zahrnuje pravděpodobnostní segmentaci bílé hmoty, šedé hmoty, CSF a také pravděpodobnostní atlasy podoblastí šedé hmoty a drah bílé hmoty.[3][4] Šablona také zahrnuje segmentaci spinálních úrovní pro automatické hodnocení metrik na konkrétních místech.[5]
  • A Atlas bílé hmoty včetně 29 masek s částečným objemem, z nichž hmoty traktují.[6]

Reference

  1. ^ De Leener B, Lévy S, Dupont SM, Fonov VS, Stikov N, Louis Collins D a kol. SCT: Spinal Cord Toolbox, open-source software pro zpracování míchy MRI dat. Neuroimage. 2017; 145: 24–43. doi: 10.1016 / j.neuroimage.2016.10.009
  2. ^ De Leener B, Cohen-Adad J, Kadoury S. Automatická segmentace míchy a míchy spojená s vertebrálním označením. Medical Imaging, IEEE Transactions on (v tisku). DOI: 10.1109 / TMI.2015.2437192
  3. ^ Fonov V, Le Troter A, Taso M, De Leener B, Leveque G, Benhamou M, Sdika M, Benali H, Pradat PF, Collins DL, Callot V, Cohen-Adad J. Rámec pro integrovaný průměr MR bílé míchy a šedá hmota: Šablona MNI-Poly-AMU. Neuroimage 2014. DOI: 10.1016 / j.neuroimage.2014.08.057
  4. ^ De Leener B, Fonov V, Collins DL, Callot V, Stikov N, Cohen-Adad J. PAM50: Multimodální šablona mozkového kmene a míchy kompatibilní s prostorem ICBM152. Sborník z 25. výročního zasedání ISMRM, Honolulu, USA. 2017.
  5. ^ Cadotte DW, Cadotte A, Cohen-Adad J, Fleet D, Livne M, Mikulis D, Fehlings MG. Řešení anatomické variability lidské krční míchy: řešení usnadňující pokročilé neurální zobrazování. Sborník z 22. výročního zasedání ISMRM, Milán, Itálie 2014: 1719.
  6. ^ Lévy S, Benhamou M, Naaman C, Rainville P, Callot V, Cohen-Adad J. Atlas bílé hmoty lidské míchy s odhadem účinku částečného objemu. Neuroimage. 2015; 119: 262–271. doi: 10.1016 / j.neuroimage.2015.06.040